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.2000年12月;20(23):8803-14.
doi:10.1128/MCB.20.23.8803-8814.2000。

磷酸化诱导的干扰素调节因子7二聚化揭示了DNA结合和二部分转录激活域

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磷酸化诱导的干扰素调节因子7二聚化揭示了DNA结合和二部分转录激活域

I Marié等。 分子细胞生物学. 2000年12月.

摘要

干扰素调节因子7(IRF7)是一种干扰素(IFN)诱导的转录因子,需要激活病毒感染后以延迟动力学表达的IFN-α基因子集。IRF7作为一种潜在蛋白合成,并通过受感染细胞中的蛋白磷酸化进行翻译后修饰。磷酸化需要一个羧基末端调控域,该调控域控制活性蛋白在细胞核中的保留,以及其与特定DNA靶序列的结合、多重聚合和诱导靶基因表达的能力。IRF7的转录激活映射到两个不同的区域,这两个区域都是完全活性所必需的,而所有功能在潜在的IRF7中都被一个到内部区域的自身抑制域映射所掩盖。通过将IRF7与雌激素受体(ER)的配体结合和二聚化结构域融合,构建了条件活性形式的IRF7。嵌合IRF7-ER的激素依赖性二聚化刺激内源性靶基因的DNA结合和转录反式激活。这些研究表明,IRF7活性是通过磷酸化依赖的变构变化来调节的,这种变构变化会导致二聚体化,并有助于核保留,解除反式激活,并允许特定的DNA结合。

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图1
图1
磷酸化IRF7积聚在细胞核中并与DNA结合。(A) NDV激活IRF7的等电聚焦分析。用IRF7-HA表达质粒转染293T细胞。在转染后16 h,细胞被模拟感染(第1道)或NDV感染(第2道)7 h,细胞提取物被免疫沉淀,并使用抗HA抗体通过自然等电聚焦和Western blotting进行分析。显示了IRF7和磷酸化IRF7(IRF7-P)的活性。(B) 磷酸化IRF7仅为核。用IRF7表达质粒转染293T细胞,用针对羧基末端的抗IRF7抗体对感染后9 h从模拟或NDV感染细胞制备的核(N)和细胞质(C)提取物进行Western blotting分析。显示了IRF7和磷酸化IRF7(IRF7-P)的活性。(C) IRF7结合DNA以应对病毒感染。如图所示,对来自载体转染的293T细胞(通道1和2)或表达IRF7-Flag的细胞(通道3至7)的细胞核(通道1至5)和细胞质(通道6和7)提取物进行EMSA。提取物与ISG15基因的ISRE探针孵育。将抗Flag M2抗体添加到反应混合物(通道5)中,以确认复合物的身份。
图2
图2
IRF7对IFN-α6启动子的反激活。(A) 用图示的IRF7剪接变异体和截短突变表达结构以及IFN-α6启动子驱动的荧光素酶报告子转染COS细胞。转染后24小时,细胞模拟感染(阴影条)或感染NDV 12小时(实心条),然后检测荧光素酶活性。这些值表示为与共转染β-半乳糖苷酶正常化后用空载体转染的细胞相关的折叠诱导。显示了重复进行的单个代表性实验的平均值。每个结构都在至少三个单独的实验中进行了测试,实验之间的差异小于10%。(B) IRF7Δ238–410缺乏自身抑制结构域对病毒感染没有反应。COS细胞被转染并按A组处理,但IRF7Δ减少了五倍238–410相对于野生型IRF7转染DNA。(C) IRF7Δ238–410构成性转录活性不需要磷酸化调控序列。用IRF7Δ转染细胞238–410或IRF7Δ238–410其中调节域磷酸化所需的两个丝氨酸残基被转化为丙氨酸(AA)。数据表示为干扰素-α6-luc报告子相对于其被病毒激活的野生型IRF7激活的折叠激活。
图3
图3
使用Gal4嵌合体绘制IRF7反式激活和自身抑制域的结构-功能图。Gal4-IRF7融合蛋白结构如左图所示,表明Gal4-DBD和IRF7的外显子结构。IRF7的不同功能区被着色。右侧显示了COS细胞中与所示Gal4-IRF7嵌合表达质粒共转染的Gal4上游激活位点荧光素酶报告子的折叠激活。在共转染β-半乳糖苷酶活性正常化后,这些值表示为相对于Gal4-DBD单独的基底激活的折叠诱导。该图表示重复进行的单个试验的平均值,并代表每个结构的至少三次试验。总体实验变化始终小于15%。请注意,构件1到9和10到11的结果以不同的比例绘制。(B) IRF7功能域图,由不同的阴影模式表示并在下面标记,总结了转染实验得出的数据。外显子被编号以便识别。
图4
图4
IRF7亚型诱导内源性IFN-α基因表达。(A) 状态1−/−如图所示,用编码IRF7剪接变异体和截断变异体的表达质粒瞬时转染成纤维细胞。36 h后,模拟细胞或感染NDV 9 h,用RT-PCR监测非干扰素-α4和GAPDH mRNA水平,如图所示。(B) IRF7在细胞质和细胞核中都有积累。通过Western blotting监测瞬时转染细胞提取物中每个IRF7剪接变异体或截断变异体的表达水平。在通道1、3、7和8中观察到的快速迁移形式(用*表示)很可能是蛋白水解分解产物。分子质量标记的迁移率以千道尔顿为单位显示在右边。
图5
图5
IRF7γ和IRF7ΔN102竞争性抑制IRF7介导的IFN-α6诱导。如图所示,COS细胞与编码IRF7α或IRF7β(50 ng)的表达结构共转染,IRF7γ(上部面板)或IRF6ΔN的量增加(0、250、1000和2000 ng)102(下部面板),以及由IFN-α6启动子驱动的荧光素酶报告子构建。转染后24小时,用NDV感染细胞12小时,并检测提取物的荧光素酶活性。这些值表示为共转染β-半乳糖苷酶活性归一化后无竞争对手的活性百分比,并表示重复测量的平均值。
图6
图6
磷酸化的IRF7显示出增加的天然分子大小。从转染IRF7的未感染对照(Ctl)细胞(上面板)或NDV感染(下面板)293T细胞中采集的核提取物通过甘油梯度沉淀进行分离。如图所示,在SDS-PAGE后通过免疫印迹分析单个组分的IRF7。顶部显示了平行梯度中分子质量标准的分馏,右侧显示了磷酸化和非磷酸化IRF7的电泳迁移率。
图7
图7
IRF7-ER的激素依赖性二聚化诱导特异性DNA结合和IFN-α基因表达。(A) IRF7-ER嵌合蛋白图。IRF7α(上部)和IRF7γ剪接变异体(下部)显示DBD、反式激活域(TA)、自身抑制域(Inhib.)、调节域(Reg)和雌激素LBD。(B) 如图所示,用IFN-α6-luc-plus载体、IRF7α-ER或IRF7γ-ER共同转染293T细胞,然后用4-HT处理16小时或不处理(Ctl),然后检测荧光素酶活性。数据显示为未经处理的载体转染细胞的折叠诱导,代表重复测量的平均和标准误差。(C) 与IFN-α6-luc-plus载体、野生型IRF7α、IRF7β-ER或IRF7(AA)-ER共转染的细胞未经处理或用4-HT处理16 h,然后检测荧光素酶活性。数据显示为转染野生型IRF7的NDV感染细胞中获得的最大活性百分比(未显示结果),并表示三次测定的平均值和标准误差。(D) 通过免疫印迹法测定转染293T细胞提取物中的IRF7α(第1道)、IRF7β-ER(第2道)和IRF7γ-ER(第一道)蛋白水平。(E) EMSA分析了转染IRF7α-ER(α-ER)或IRF7γ-ER(γ-ER)的细胞提取物,如图所示,这些细胞未经处理(第1和第3道)或用4-HT处理4小时(第2和第4道)。指出了IRF7-ER蛋白-DNA复合物的位置。(F) 状态1−/−成纤维细胞转染IRF7α-ER(1和2道)或IRF7γ-ER(3和4道),然后用4-HT处理6 h(偶数道)。如图所示,分析RNA的非干扰素-α4亚群表达或GAPDH。

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