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Syp公司突触素[褐家鼠(挪威鼠)]

基因ID:24804,更新日期2024年6月19日

总结

官方符号
Syp公司由提供RGD公司
官方全名
突触素由提供RGD公司
主要来源
RGD:3802
参见相关内容
乐团:ENSRNOG00000059720 联盟基因组:RGD:3802
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
褐家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;颅亚目;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;变形肌;鼠形目;鼠科;穆里奈;大鼠
也称为
Syp1号机组
总结
实现蛋白质结构域特异性结合活性和syntaxin-1结合活性。参与内吞作用;阿片受体信号通路的调控;以及对淀粉样β的反应。位于几个细胞成分中,包括兴奋性突触;突触后密度;和突触小泡膜。蛋白质复合物的一部分。是突触小泡膜的组成部分。阿尔茨海默病的生物标志物。该基因的人类直系同源基因与非综合征性X连锁智力残疾96有关。与人类SYP(突触素)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
限制表达(RPKM 2066.8)查看更多
直系同源
新的
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

请参阅中的Syp基因组数据查看器
位置:
许继12
外显子计数:
7
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCr8级(GCF_036323735.1号) X(X) NC_086039.1(17521348..17536449,补体)
RS_2023_06号 上一次装配 mRatBN7.2美元(GCF_015227675.2号) X(X) NC_051356.1(14849444..14864553,补码)
106 上一次装配 雷诺_6.0(总金额000001895.5) X(X) NC_005120.4(15694699..15709244,补遗)

染色体X-NC_086039.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene uncharacterized LOC134484177 Neighboring gene MAGI family member, X-linked Neighboring gene prickle planar cell polarity protein 3 Neighboring gene proteolipid protein 2 Neighboring gene uncharacterized LOC120099258 Neighboring gene calcium voltage-gated channel subunit alpha1 F Neighboring gene coiled-coil domain containing 22 Neighboring gene protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F Neighboring gene forkhead box P3

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
  • 描述:从Fischer 344大鼠的11个器官(肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本,这些器官来自于四个发育阶段(2-、6-、21-和104周龄)的雌雄大鼠
  • 生物项目:项目编号:238328
  • 出版物:PMID 24510058
  • 分析日期:2016年6月6日星期一17:44:12

参考文献

PubMed中的相关文章

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

PubChem的途径

互动

产品 交互作用者 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

基因本体论 RGD提供

组件 证据代码 酒吧
located_in Schaffer侧枝-CA1突触 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
is_active_in Schaffer侧枝-CA1突触 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于细胞基底部 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位于兴奋性突触 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
定位于兴奋性突触 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
定位于兴奋性突触 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位于神经肌肉接头 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
定位于神经肌肉接头 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位神经元投影 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于神经元投射末端 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
定位于神经元投射终点 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位于神经元棘 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
位于细胞质核周区 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
位于细胞质核周区 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位突触后密度 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
位于突触前 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
突触前活动区内活动 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
位于突触前活动区 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
位于突触前活动区 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
位于突触前活动区 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于突触前膜 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
位于突触前膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
蛋白质复合物的一部分 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
定位于突触 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
定位于突触小泡 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
定位于突触小泡 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
突触小泡膜中的is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
突触小泡膜中的is_active 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
定位于突触小泡膜 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
定位于突触小泡膜 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
定位于突触小泡膜 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于航站楼bouton HDA公司 公共医学 
位于航站楼bouton 国际开发协会
从直接测定推断
更多信息
公共医学 
位于航站楼bouton 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
位于航站楼bouton 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
位于前庭花萼末端 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 

一般蛋白质信息

首选名称
突触素
姓名
主要突触囊泡蛋白p38

NCBI参考序列(RefSeq)

新的 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来识别版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_012664.3号NP_036796.1号突触素

    参见NP_036796.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    源序列
    BC099798号
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    P07825号,1999年第4季度3
    UniProtKB/TrEMBL公司
    A0A0G2KAD8型,A6KP94型
    相关的
    ENSRNOP00000096197.1公司,ENSRNOT00000107562.1号
    保守领域(1)总结
    pfam01284型
    位置:16216
    奇迹;膜缔合域

注释基因组的参考序列:GCF_036323735.1-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCr8

基因组学

  1. NC_086039.1参考GRCr8

    范围
    17521348..17536449补码
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)