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VDAC1型电压依赖性阴离子通道1[智人(人类)]

基因ID:7416,更新于2024年6月17日

总结

官方符号
VDAC1型由提供HGNC公司
官方全名
电压依赖性阴离子通道1由提供HGNC公司
主要来源
HGNC:HGNC:12669
参见相关内容
乐团:ENSG00000213585 最小分子量:604492; 联盟基因组:HGNC:12669
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
检验过的
有机体
智人
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;颅亚目;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡他病;人科;人类
也称为
孔蛋白;VDAC-1型
总结
该基因编码一种电压依赖性阴离子通道蛋白,该蛋白是线粒体外膜的主要成分。编码蛋白促进代谢产物和离子在线粒体外膜上的交换,并可能调节线粒体功能。这种蛋白质也在质膜中形成通道,并可能参与跨膜电子传递。交替剪接导致多个转录变体。该基因的多个假基因出现在第1、2、3、6、9、12、X和Y染色体上【RefSeq提供,2010年9月】
表达式
心脏(RPKM 107.1)、十二指肠(RPKM94.9)和25个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
新的
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基因组背景

请参阅中的VDAC1基因组数据查看器
位置:
第5季度31.1
外显子计数:
19
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 5 NC_000005.10(133971871..134114540,补码)
RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 5 NC_060929.1(134495517..134638169,补码)
105.20220307 上一次装配 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 5 NC_ 000005.9(133307562..133450231,补体)

染色体5-NC_000005.10描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23109 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23110 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23111 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23112 Neighboring gene uncharacterized LOC105379183 Neighboring gene chromosome 5 open reading frame 15 Neighboring gene MPRA-validated peak5471 silencer Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23113 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23114 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 16349 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 16350 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 16351 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23115 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23116 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23117 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23118 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23119 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23120 Neighboring gene OCT4-NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133382518-133383158 Neighboring gene OCT4-NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133383159-133383798 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133385203-133385778 Neighboring gene NANOG-H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr5:133387505-133388080 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133394172-133394770 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133394771-133395367 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 16352 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 16353 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23121 Neighboring gene short transmembrane mitochondrial protein 1-like Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133422388-133422888 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133422889-133423389 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 10905 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 12956 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23122 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23123 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133437181-133438148 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133438510-133439380 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23125 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133441120-133441988 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133442973-133443520 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 16354 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23126 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23127 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 16355 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133457701-133458202 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23128 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133464814-133465636 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133465637-133466458 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23129 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23131 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23130 Neighboring gene transcription factor 7 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23132 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133475053-133476030 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23133 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23134 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23135 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23136 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 16356 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133513545-133514059 Neighboring gene S-phase kinase associated protein 1 Neighboring gene protein phosphatase 2 catalytic subunit alpha Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23137 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23138 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23139 Neighboring gene NANOG-H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr5:133561503-133562022 Neighboring gene microRNA 3661

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
  • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
  • 生物项目:项目编号:4337
  • 出版物:项目管理标识号24309898
  • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

PubMed中的相关文章

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

HIV-1相互作用

蛋白质相互作用

蛋白质 基因 互动 酒吧
包膜表面糖蛋白gp160前体 环境价值 通过亲和标记和纯化质谱分析,确认HIV-1 gp160与人类HEK293和/或Jurkat细胞系中的电压依赖性阴离子通道1(VDAC1)有物理相互作用 公共医学
包膜跨膜糖蛋白gp41 环境价值 通过亲和标记和纯化质谱分析,确认HIV-1 gp41与人类HEK293和/或Jurkat细胞系中的电压依赖性阴离子通道1(VDAC1)有物理相互作用 公共医学
奈夫 nef(奈夫) HIV-1 Nef下调Nef转染SupT1细胞中电压依赖性阴离子通道1(VDAC1)蛋白的表达 公共医学
Vpr(Vpr) 虚拟专用数据库 细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记结合基于质谱的蛋白质组学确定了HIV-1 Vpr在Vpr转导的巨噬细胞中对电压依赖性阴离子通道1(VDAC1)表达的下调 公共医学
虚拟专用数据库 凝胶蛋白G5结构域通过阻断Vpr和VDAC之间的相互作用抑制HIV Vpr诱导的T细胞凋亡 公共医学
虚拟专用数据库 HIV-1 Vpr通过直接结合ANT与电压依赖性阴离子通道(VDAC)和腺嘌呤核苷酸转运体(ANT)的分子复合物相互作用,导致线粒体膜通透性的诱导 公共医学
反胃蛋白酶 gag-pol公司 HIV-1 PR在HEK293细胞中以剂量依赖的方式裂解VDAC 公共医学
gag-pol公司 HIV-1 PR与HeLa细胞线粒体蛋白VDAC、细胞色素c、TOM22和Bax相互作用 公共医学

转到HIV-1人类交互数据库

PubChem的途径

相互作用

产品 交互作用者 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

克隆名称

  • MGC111064型

基因本体论 GOA提供

一般蛋白质信息

首选名称
电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1
姓名
线粒体外膜蛋白孔蛋白1
质膜孔蛋白
孔蛋白31HL
通道蛋白31HM
精子结合蛋白1a

NCBI参考序列(RefSeq)

新的 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来识别版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

基因组学

  1. NG_027817.3参考序列基因

    范围
    114565..147669
    下载
    发电厂银行,美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. 纳米_001401008.1NP_001387937.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型1

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    共识CDS
    CCDS4168.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B3KVK4型,D3DQ93型,第21796页,Q5FVE7问题,问题9UIQ5,问题9UPL0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    0年1月1日,B3KTS5型
  2. NM_001401009.1号NP_001387938.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型1

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    共识CDS
    《加拿大法典》第4168.1条
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B3KVK4型,D3DQ93型,第21796页,Q5FVE7问题,问题9UIQ5,问题9UPL0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    0年1月1日,B3KTS5型
  3. NM_001401010.1号NP_001387939.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型1

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    共识CDS
    CCDS4168.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B3KVK4型,D3DQ93型,第21796页,Q5FVE7问题,问题9UIQ5,问题9UPL0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    0年1月1日,B3KTS5型
  4. NM_001401011.1号NP_001387940.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型1

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    共识CDS
    CCDS4168.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B3KVK4型,D3DQ93型,第21796页,Q5FVE7问题,问题9UIQ5,问题9UPL0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    0年1月1日,B3KTS5型
  5. 纳米_001401016.1NP_001387945.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型1

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    共识CDS
    CCDS4168.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B3KVK4型,D3DQ93型,第21796页,Q5FVE7问题,问题9UIQ5,问题9UPL0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    0年1月1日,B3KTS5型
  6. NM_001401017.1号NP_001387946.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型1

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    共识CDS
    CCDS4168.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B3KVK4型,D3DQ93型,第21796页,Q5FVE7问题,问题9UIQ5,问题9UPL0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    0年1月1日,B3KTS5型
  7. NM_001401018.1号NP_001387947.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型1

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    共识CDS
    CCDS4168.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B3KVK4型,D3DQ93型,第21796页,Q5FVE7问题,问题9UIQ5,问题9UPL0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    0年1月1日,B3KTS5型
  8. NM_001401020.1号NP_001387949.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型1

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    共识CDS
    《加拿大法典》第4168.1条
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B3KVK4型,D3DQ93型,第21796页,Q5FVE7问题,第9季度第5季度,问题9UPL0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    0年1月1日,B3KTS5型
    相关的
    ENSP00000378484.3号文件,ENST00000395044.7标准
  9. NM_001401021.1号NP_001387950.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型1

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    共识CDS
    CCDS4168.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B3KVK4型,D3DQ93型,第21796页,Q5FVE7问题,问题9UIQ5,q9上传0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    0年1月1日,B3KTS5型
    相关的
    ENSP00000378487.2号文件,ENST00000395047.6标准
  10. NM_001401022.1号NP_001387951.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型1

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    共识CDS
    CCDS4168.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B3KVK4型,D3DQ93型,第21796页,Q5FVE7问题,问题9UIQ5,问题9UPL0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    0年1月1日,B3KTS5型
  11. NM_001401023.1号NP_001387952.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型1

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    共识CDS
    CCDS4168.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B3KVK4型,D3DQ93型,第21796页,Q5FVE7问题,问题9UIQ5,q9上传0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    0年1月1日,B3KTS5型
  12. NM_001401024.1号NP_001387953.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型2

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
  13. NM_001401025.1号NP_001387954.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型3

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    UniProtKB/TrEMBL公司
    B3KTS5型
  14. NM_001401026.1号NP_001387955.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型4

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    UniProtKB/TrEMBL公司
    B3KTS5型
  15. NM_001401027.1号NP_001387956.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型5

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608型
  16. NM_001401028.1号NP_001387957.1型电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型6

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
    UniProtKB/TrEMBL公司
    B3KTS5型
  17. NM_001401029.1号NP_001387958.1电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型7

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
  18. NM_001401031.1号NP_001387960.1电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型7

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
  19. NM_001401032.1号NP_001387961.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型7

    状态:已审阅

    源序列
    AC008608、AC025177
  20. NM_003374.3号NP_003365.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型1

    参见NP_003365.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已审阅

    描述
    转录变体:该变体(1)编码功能蛋白。
    源序列
    AC008608、AC025177、AK095989、BC008482、L06132
    共识CDS
    CCDS4168.1标准
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B3KVK4型,D3DQ93型,第21796页,Q5FVE7问题,问题9UIQ5,问题9UPL0
    UniProtKB/TrEMBL公司
    0年1月1日,B3KTS5型
    相关的
    ENSP00000265333.3,ENST00000265333.8号机组
    保守领域(1)总结
    cd07306
    位置:4282
    Porin3_VDAC;线粒体外膜的电压依赖性阴离子通道

注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCh38.p14一次组件

基因组学

  1. NC_000005.10参考GRCh38.p14初级组件

    范围
    133971871..134114540补码
    下载
    发电厂银行,美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

备选T2T-CHM13v2.0

基因组学

  1. NC_060929.1替代T2T-CHM13v2.0

    范围
    134495517.134638169补码
    下载
    发电厂银行,美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)