Nat Rev Mol细胞生物学。作者手稿;PMC 2011年4月11日发布。
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美国国立卫生研究院:美国国家卫生研究院283106
连接肌动蛋白动力学和基因转录以驱动细胞运动功能
*和‡
埃里克·N·奥尔森
*德克萨斯大学达拉斯西南医学中心分子生物学系,地址:5323 Harry Hines Boulevard,Dallas,Texas 75390-9148,USA
阿尔弗雷德·诺德海姆
‡Eberhard-Karls-Universität tübingen,Interfakultäres Institute für Zellbiologie,Abteilung Molekularbiologie,Auf der Morgenstelle 15,72076 Turbingen,德国
*德克萨斯大学达拉斯西南医学中心分子生物学系,地址:5323 Harry Hines Boulevard,Dallas,Texas 75390-9148,USA
‡Eberhard-Karls-Universität tübingen,Interfakultäres Institute für Zellbiologie,Abteilung Molekularbiologie,Auf der Morgenstelle 15,72076 Turbingen,德国
摘要
许多生理和病理刺激促进肌动蛋白细胞骨架的重排,从而调节细胞运动功能。虽然从直觉上看,细胞运动需要协调的蛋白质生物合成,但直到最近,细胞骨架肌动蛋白动力学和相关基因活动之间的联系仍然未知。球状肌动蛋白聚合释放心肌相关转录因子(MRTF)辅因子,从而诱导核转录因子血清反应因子(SRF)调节编码肌动蛋白动力学结构和调节效应器的基因表达,这一发现部分填补了这一知识空白。这一见解激发了研究,以更好地理解肌动蛋白-MRTF-SRF电路,并确定连接细胞骨架动力学和基因组活动的替代机制。
在胚胎发育过程中,作为成熟多细胞生物的功能成分,单个细胞在外观、形状、位置以及与包括其他细胞在内的细胞外结构的接触方面不断发生物理变化(方框1). 这些物理变化需要细胞运动功能,这是许多动态细胞行为的驱动力,例如细胞迁移、引导运动、吞噬、粘附和收缩。细胞的运动功能受到生理和病理刺激的调节。大分子组装提供了细胞运动功能的物理基础,包括肌动蛋白微丝的细胞骨架支架结构。这些支架在聚合及其与特定结合蛋白的相互作用中发生动态变化。关于肌动蛋白微丝,单体球状肌动蛋白(G-actin)聚集成丝状肌动素(F-actin)纤维受到ATP-结合G-actin的局部细胞内浓度和许多肌动蛋白结合蛋白(ABP)活性的影响。这决定了聚合的速度和方向,以及新生成的长丝的形状1肌动蛋白丝的这种动态重排产生了细胞所需的物理力,使细胞伸出丝足或跛足膜延伸,并根据活动细胞功能的需要,重新调整粘附接触,即所谓的焦点粘附,以适应细胞环境。
方框1|细胞的运动功能
活的真核细胞必须被视为一个动态结构,经历大分子接触、信号输入和代谢通量的频繁变化。因此,细胞显示出持续的物理重排和调整。这种运动功能需要支持细胞内的反作用力,如肌动蛋白微丝的动态重排所产生的反作用力。单体球状肌动蛋白(G-actin)聚合为丝状肌动素(F-actin)聚合物是可逆的,这两种反应都由许多肌动蛋白结合蛋白(ABP)促进。
涉及动态肌动蛋白微丝重排的细胞运动功能包括细胞迁移、扩散、粘附、收缩和极化、细胞与细胞接触以及细胞与细胞外基质(ECM)的相互作用(见图)。这些微丝重排导致趋化、机械趋化(细胞拉伸和超载)、细胞张力维持、形状改变(分支)、吞噬(吞噬作用)、轴突或血管尖端细胞伸展、轴突引导、,形态重排(如上皮-间充质转化所需的重排)和细胞内转运(如RNA定位、蛋白质传递、膜运输、内吞、内化、分泌和细胞器定位)。
肌动蛋白微丝的动态变化有助于每一种运动功能,无论是作为结构成分还是作为信号转导的平台。微丝聚合和解聚,伴随着相互作用分子结构的结合和解离,为运动性的动态变化提供了物理支架。如本综述所述,涉及肌动蛋白动力学的多种细胞行为需要基因表达和从头开始蛋白质生物合成。选定的ABP作为信使蛋白,向细胞基因组传递肌动蛋白重排的状态。这种转录传递系统调节编码产物的基因的表达,这些产物有助于细胞运动功能的执行或调节。图中肌动蛋白结构用不同深浅的红色表示。图片经允许复制自自然细胞生物学裁判。142(2007)Macmillan Publishers Ltd.保留所有权利。
虽然肌动蛋白微丝周转涉及ADP-肌动蛋白池中耗尽的ATP–肌动蛋白水平的再生,而ABP-profilin可以激活肌动蛋白,但细胞运动还需要从头开始G-actin的生物合成。同样,蛋白质合成的激活需要及时生成肌动蛋白微丝网络的其他结构成分(例如肌球蛋白、肌动蛋白组装和分解因子、盖蛋白和F-肌动蛋白交联蛋白)以及调节成分(例如激酶、磷酸酶和肌球蛋白轻链(MLC))。因此,细胞运动需要肌动蛋白动力学和转录活性的紧密时间耦合。
肌动蛋白周转和转录的时间联系要求信号转导机制将细胞质肌动蛋白聚合状态传递给核基因组。转录机制如何感知对动态肌动蛋白网络和运动装置成分生物合成的需要?为了解决这个问题,我们首先回顾了由运动诱导信号激活的各种细胞受体,随后导致GTP-结合蛋白Rho家族中心细胞内调节蛋白的激活(). 然后,我们将重点放在中继系统上,该系统通过特定ABP的释放和核移位,使细胞骨架肌动蛋白微丝的动态重排传递到细胞核,从而引起特定基因表达谱的明确变化().
影响肌动蛋白动力学的受体和MrTF介导的SrF靶基因调控一|细胞骨架肌动蛋白微丝动力学受六类质膜受体激活的影响:受体酪氨酸激酶(RTK)、G蛋白偶联受体(GPCR);以及Gα的α亚基12/13,Gα2011年第2季度或Gαi/0(输入/输出))整合素作为局灶性粘连的结构介质,转化生长因子-β受体(TGFβRs),粘附连接处的E-cadherins和Frizzled,介导涉及Dishevelled(DVL)的非规范Wnt–平面细胞极性(PCP)通路。这些受体调节Rho GTPases的活性2通过Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)。Rho GTPases的作用物,包括Rho相关激酶(ROCK)、formins(如解热相关formins)、Wiskott-Aldrich综合征蛋白(WASP)、WASP家族verprolin同源物(WAVEs)和肌动蛋白2/3(ARP2/3)复合体和其他肌动蛋白结合蛋白(ABP),通过将球形肌动蛋白(G-actin)并入丝状肌动蛋白聚合物中来协调肌动蛋白聚合三高水平的细胞质G-肌动蛋白在细胞质中保留血清反应因子(SRF)辅因子蛋白,即肌球蛋白相关转录因子(MRTF)。将G-actin并入F-actin丝可释放MRTF进入细胞核并与转录因子SRF相互作用58这触发了SRF靶基因子集的表达,即细胞骨架基因。b条|激活SRF II类靶基因。核MRTF可与核G-actin复合,抑制MRTF介导的SRF-依赖性转录的刺激并促进MRTF核输出76由于MRTF–SRF激活而转录的SRF II类靶基因包括肌动蛋白本身和许多调节肌动蛋白动力学的基因,如凝胶蛋白和文丘里蛋白。随着时间和浓度的增加,这些新制造的蛋白质可能会刺激细胞质肌动蛋白聚合,使细胞质MRTF复杂化,或提高细胞核G-肌动蛋白水平,从而下调MRTF介导的转录并刺激MRTF的核输出。FAK,粘着斑激酶;ILK,整合素连接蛋白激酶;LIMK、LIM结构域激酶。
肌动蛋白结合蛋白作为微丝信使一个模型总结了三种不同类型的肌动蛋白结合蛋白(ABP)的细胞核-细胞质穿梭:球状肌动蛋白(G-actin)结合蛋白(G-ABP)、丝状肌动素(F-actin)绑定蛋白(F-ABP)和F-actin复合相关蛋白(F-ACAP)。G-ABP的示例包括心肌相关转录因子(MRTFs)、Rho-依赖信号的横纹肌激活物(STARS,也称为ABRA)、连接介导和调节蛋白(JMY)、β-胸腺肽、profilin、神经Wiskott-Aldrich综合征蛋白(N-WASP)、肌动蛋白相关蛋白2/3(ARP2/3)复合体和螺旋31F-ABP的示例包括肌动蛋白结合LIM蛋白(ABLIMs)cofilin、gelsolin、filamin、α-肌动蛋白、supervillin和LIM及SH3域蛋白1(LASP1)31,32,F-ACAP的示例包括ABL1、整合素胞质结构域相关蛋白1(ICAP1α)、LIM结构域蛋白和p120-catenin44穿梭的LIM结构域蛋白zyxin、lipoma-preferred partner(LPP)、Cys-rich proteins(CRPs)、Hic-5(也称为TGFB1I1)、抗白细胞蛋白酶(ALP)、paxilin和LIM以及SH3结构域蛋白1(LASP1)被证明直接结合F-actin,而LIM激酶,特别是有趣的新Cys-His蛋白1(PINCH;也称为LIMS1)四个半LIM结构域蛋白2(FHL2)可能与F-AC间接相关44,45.F-AC聚集在局部粘连、钙粘蛋白介导的细胞-细胞粘连连接和细胞-细胞紧密连接的细胞质侧。TF,转录因子。
核肌动蛋白和核ABP对整体基因表达的一般影响没有详细讨论。相反,这篇综述强调了G-actin在控制心肌蛋白家族转录辅因子(心肌蛋白本身以及心肌蛋白相关转录因子(MRTFs))的核-细胞质穿梭和核活性方面的特殊功能的最新见解(). 这些蛋白质反过来控制血清反应因子的活性(战略参考框架),一种核转录因子。因此,G-actin的细胞质浓度由留在细胞质中的MRTF浓度反映,是肌动蛋白动力学的直接测量。肌动蛋白聚合过程中细胞质MRTF的释放和核移位引起SRF定向靶基因激活。因此,肌动蛋白–MRTF–SRF电路允许与细胞骨架组装和拆卸一起精确调节基因表达。由于SRF靶基因编码微丝的结构成分(例如肌动蛋白本身)和肌动蛋白动力学的调节器(例如凝胶蛋白和文丘林),以及在这些途径中提供反馈调节的微RnAs(miRn as),MRTF–SRF回路在指导执行运动细胞功能所需的基本基因活动方面具有核心重要性。
心肌蛋白家族成员的结构显示了心肌蛋白家族蛋白之间同源的功能域,并指出了氨基酸的数量。肌球蛋白相关转录因子(MRTF)是一种有效的转录辅激活因子,通过一个基本区域(++)和一个相邻的谷氨酸丰富结构域(Q)与血清反应因子(SRF)相关。在这些结构域之间有一个短的α-螺旋区,其二级结构与三元复合因子蛋白ELK1中的一个结构域类似,称为B盒,它介导它们与SRF的相互作用52,68,71家族蛋白中的肌卡包含Arg-Pro-X-X-X-Glu-Leu(RPEL)基序,其调节与球肌动蛋白(G-actin)的相互作用。心肌蛋白家族成员有一个同源的SAP结构域,以SAFA或SAFB、腺泡和PIAS命名,参与不同类型的染色体DNA代谢。该区域的缺失会破坏心肌蛋白激活SRF依赖基因子集的能力68Myocardin和MRTF含有刺激SRF活性所需的强大转录激活结构域(TADs)。一个类似Leu拉链的二聚化基序介导心肌蛋白和MRTF的同源和异源二聚化。心肌蛋白基因5′外显子的交替使用产生具有不同氨基末端的蛋白质。中心肌卡的心肌特异性剪接变体包含一个独特的氨基末端序列,该序列赋予与肌细胞特异性增强因子2(MEF2)转录因子相互作用的能力,该转录因子是一种与SRF相关的MADS-box转录因子。这个MEF2-相互作用域也包含在家族中一个不同的心肌成员中,称为MEF2-激活SAP转录调节器(MASTR)。MASTR缺少SRF交互域。AMKL白血病细胞的OTT(也称为RBM1B)-MAL(也称为MRTF-A)融合蛋白包含MRTF-A序列。
肌动蛋白动力学的信号调节
不同的细胞运动功能(方框1)由大量细胞外刺激物引发。通过选择性Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子(GeFs)激活Rho GTPase家族不同成员的同源受体蛋白可以感知这些刺激(). Rho GTPases包括Rho、Rac和Cdc42亚家族的成员2,调节调节细胞质中G-actin和F-actin聚合平衡的效应蛋白。G-actin与不同的ABP形成复合物,包括成核因子profilin、formins和actin-related protein 2/3(ARP2/3)复合物1,三Rho-GTPase的激活通过两个下游信号模块促进肌动蛋白聚合,其中一个涉及Rho-相关激酶(RoCK)–LiM激酶–cofilin途径(cofillin是一种ABP,可以刺激肌动蛋白解聚,从而增强其他地方的肌动蛋白聚结),另一种是由甲酸介导的(如解热相关甲酸(DRF))ABP。实验上,肌动蛋白的动力学可以通过梭菌毒素和其他以肌动蛋白为靶点的天然化合物进行有效调节4(方框2).
方框2|体外肌动蛋白动力学和MRTF-SRF活性的调节剂
通过使用调节肌动蛋白活性的化合物,肌动蛋白相关转录因子(MRTF)介导的肌动蛋白动力学和转录激活之间的通讯得到了极大的帮助51,52,75,76Rho GTPases对肌动蛋白聚合的影响可被梭状芽孢杆菌毒素(如RHOA抑制剂C3转移酶(ADP-核糖转移酶)或Rho相关激酶(ROCK)抑制物质Y-27623(见图一). 肌动蛋白靶向天然化合物破坏肌动蛋白聚合(latrunculin B、细胞松弛素D和swinholide A)或稳定丝状肌动蛋白(F-Actin)聚合物(茉莉花素内酯)4(参见图,零件b条). 有趣的是,这些化合物也影响细胞质MRTF–肌动蛋白复合物(见图c(c)). 细胞松弛素D、猪苓内酯A和茉莉糖苷破坏MRTF–球肌动蛋白(G-actin)复合体,从而释放MRTF,而latrunculin B抑制MRTF与G-actin的分离52,75,76核G肌动蛋白也与MRTF复合,从而抑制血清反应因子(SRF)的激活潜能,刺激MRTF的核输出(见图d日). 核MRTF–G-actin复合物76受肌动蛋白靶向化合物对细胞质复合体的影响。重要的是,这些研究揭示了许多以前被认为主要调节肌动蛋白聚合平衡的化合物,也影响了肌动蛋白-肌动蛋白结合蛋白(ABP)复合物的稳定性。
肌动蛋白的突变变异体也有助于研究SRF的MRTF依赖性调节。肌动蛋白变体Glu13Arg和Arg62Asp在聚合过程中受损,因此抑制MRTF活性,而Val159Asn和Ser14Cys刺激F-Actin的形成并激活MRTF功能50Glu15Ser也能稳定F-actin,同时明显与MRTF相互作用更紧密,促进其核进入75MRTF变异体在与肌动蛋白相互作用中有缺陷,表现为结构性核定位74MRTF衍生的RPEL肽和G-actin在latrunculin B存在下的共结晶最近提供了MRTF–G-actin的结构信息77.
如中所述,几种类型的质膜受体通过调节Rho-GTPase活性来调节肌动蛋白聚合和细胞运动。在下面讨论的例子中,强调了这些受体与MRTF–SRF模块之间的联系。
G蛋白偶联受体的信号传递
G蛋白偶联受体(GPCR)是一个膜受体大家族,具有七个跨膜螺旋结构域,可与异源三聚体G蛋白(鸟嘌呤核苷酸结合蛋白;由α-、β-和γ-亚基组成)偶联。具有Gα型Gα亚基的异三聚体G蛋白12/13,Gα2011年第2季度和Gα我/0通过参与Rho GTPases促进肌动蛋白周转5(). GPCR与许多配体相互作用,包括激素、趋化因子、生物活性脂质、胃肠肽、血小板活化剂和发育中大脑的孤儿配体6GPCR配体溶血磷脂酸(LPA)中Rho–肌动蛋白–MRTF–SRF通路的激活已得到明确证明7,1-磷酸鞘氨醇(S1P)7,8和一个神经元孤儿配体6.
受体酪氨酸激酶信号
许多Tyr激酶受体与Rho GTPases相关,包括血小板衍生生长因子(PDGF)、胰岛素、肾上腺素A(EphA)和肾上腺素B蛋白、TRKA、TRKB和TRKC、表皮生长因子(EGF)、成纤维细胞生长因子(FGF)、血管内皮生长因子(VEGF)和MET的受体9其中许多受体对运动细胞功能有重要影响。血管内皮细胞中的VEGF受体信号表明肌动蛋白–MRTF–SRF通路激活10神经元中的EphA信号11,12背根神经节中的神经营养素信号(可能通过TRKA、TRKB和TRKC受体)13SRF信号在这些类型的信号事件中的核心重要性体现在血管生成异常14,15神经轴突导向和突触靶向11,13,16在里面Srf公司击倒小鼠。
整合素信号
整合素受体将细胞连接到细胞外基质(ECM),是局部粘连的主要结构组织成分。整合素信号对肌动蛋白细胞骨架的重组有很大影响。整合素介导的肌动蛋白动力学主要通过激活RHOA和RAC1 GTPases来实现,这涉及到整合素连接激酶对Rho-GEFs的调节(ILK公司),粘着斑激酶(FAK(传真))和SRC公司17(). 整合素还向肌动蛋白细胞骨架传递外部和内部机械应力。这种机械传感被证明可以激活肌动蛋白–MRTF–SRF通路18.
TGFβ信号
转化生长因子β(TGFβ)超家族细胞因子包括TGFβ家族多肽、骨形态发生蛋白(BMPs)和激活素。这些配体通过Ser/Thr激酶受体的异四聚体复合物发挥作用,这些异四聚物激活不同的信号通路,并调节Rho-GTPase介导的肌动蛋白动力学19TGFβ诱导的细胞结构和运动改变有助于细胞上皮-间充质转化(EMT),EMT与胚胎组织运动和肿瘤细胞侵袭和转移有生物学联系。在TGFβ上观察到MRTF–SRF模块的激活20–22和BMP信号23.
E-cadherin信号
上皮细胞-细胞连接(粘附连接)由上皮钙粘蛋白(E-cadherins)的亲同性相互作用介导。钙粘蛋白通过连环蛋白在功能上与肌动球蛋白细胞骨架支架相连1细胞-细胞接触的组装和拆卸需要并引发广泛的肌动蛋白动力学,并通过GTPase RAC1(REFS)激活MRTF–SRF通路20,24,25). 上皮细胞接触点的分离是EMT的起始事件。连环蛋白(α-连环蛋白、β-连环蛋白和p120连环蛋白)的释放激活肌动蛋白动力学,并可直接调节核蛋白功能26.
非标准Wnt信号
非规范、β-catenin-independent Wnt–planar cell polarity(PCP)信号通路使用Wnt信号成分Dishevelled激活肌动蛋白动力学调节器,包括Rho、Rac和Cdc42 GTPases、ROCK27和formin相关蛋白Dishevelled相关的形态发生激活剂1(DAAM1号机组)28。该途径最初在黑腹果蝇在空间组织结构的建立中,特别是蛹飞翼细胞的平面细胞极性29在脊椎动物中,Wnt信号调节原肠胚形成和器官发生期间极化细胞运动的肌动蛋白动力学30Wnt–PCP信令与MRTF–SRF中继之间的链路仍然是假设的。
微丝到基因组中继系统
在本节中,我们回顾了细胞向基因组传递肌动蛋白微丝动态状态的当前特征化机制的范围。
细胞质肌动蛋白动力学引起G-actin浓度和F-actin结构的变化;后者反过来会导致F-actin复合物(F-AC)的结构或组成发生改变,例如焦点粘附复合物。肌动蛋白被ABP识别,为了清楚起见,我们建议将其分类为G-Actin结合蛋白(G-ABP)、F-Actin结合蛋白质(F-ABP)和F-Actin复合相关蛋白质(F-ACAP)().
从概念上讲,肌动蛋白动力学的变化可以通过三种方式传递给基因组。首先,细胞质单体G-actin浓度的变化可以引起核G-actin水平的相应变化。其次,G-ABP可以检测到细胞质单体G-actin水平的变化,由此G-actin聚合为F-actin可以导致G-ABP的释放、其核移位以及随后的核转录因子的调节(). MRTF–SRF电路是该机制的最佳特征(;). 最后,通过F-actin丝结构和密度的细胞传感器可以直接对细胞质肌动蛋白动力学状态进行评分。因此,细胞质F-actin纤维的结构重排可以导致F-ABP或F-ACAP的释放,随后是核移位(). 在下一节中,我们根据上述概念化的机制,简要概述了将肌动蛋白动力学与转录基因组活性联系起来的不同中继系统。
核肌动蛋白和ABP
核肌动蛋白,无论是单体G-actin还是聚合F-actin形式,都会从总体上深刻影响转录反应31,32肌动蛋白至少通过三种机制影响基因表达:肌动蛋白是所有三种RNA聚合酶(I、II和III类)的组成部分,它有助于ATP依赖的染色质重塑,并结合真核细胞细胞核中的不同核糖核蛋白(RNP)复合体,包括小核糖核酸(snRNAs)和异质核RNA(hnRNAs)。在这些活动中,肌动蛋白与G-ABP和F-ABP共同发挥作用。G-actin可以通过扩散进入和退出细胞核;然而,利用其核输出序列(部分与exportin蛋白家族成员或profilin结合)来调节其输出。这控制了其他G-ABP(如MRTF)的核出口,MRTF与G-actin绑定出口(见下文)。
JNK信号
在Rho-GTPase激活时引发动态肌动蛋白重排的信号,如上述非标准Wnt–PCP途径,也显示导致Jun N末端激酶(JNKs)的激活33–35,调节基因转录。在不同的实验环境中,GTPase介导的JNK激活涉及激酶混合谱系激酶3(MLK3;也称为MAP3K11)的介导36和岩石37或适配器蛋白CRK公司38JNK激活的这种机制与肌动蛋白动力学的刺激密切相关,这一点尚待明确证明。
NF-κB信号传导
肌动蛋白动力学调节器可诱导转录因子核因子-κB(NF-κB)的胞质-核易位。在凝血酶刺激下,内皮细胞中细胞间粘附分子1(ICAM1)的表达涉及RHOA–ROCK介导的核NF-κB活化39此外,上皮细胞-细胞接触的破坏和相关的肌动蛋白重组导致RHOA–ROCK介导的蛋白激酶D(PKD1)的激活,导致NF-κB的激活40这种情况可能反映了内皮细胞运动的病理刺激过程中细胞-细胞接触的丧失。
核激素受体
核激素受体,特别是雄激素受体(AR),除了受同源激素配体的控制外,还通过肌动蛋白和ABP调节其转录活性。F-ABP和G-ABP对AR的调节可以在细胞质-核易位的水平上进行,也可以通过影响启动子结合受体的转录活性来实现。显示与AR相互作用的ABP包括凝胶蛋白、α-肌动蛋白2、超绒毛蛋白、丝蛋白和转凝胶蛋白32G-actin是AR转录复合物的一部分。
DNA损伤反应,Nck和JMY
基因毒性损伤影响肌动蛋白动力学并引发转录反应41,42紫外线(UV)光损伤DNA会导致两种细胞质ARP2/3效应蛋白,即连接介导蛋白和调节蛋白(吉咪(JMY))和NCK1系列–细胞因子信号转导7(SOCS7)复合物的抑制物,转位到细胞核。JMY是一种能够刺激细胞运动的G-ABP。在核易位中,JMY作为p53–p300复合物的辅因子,刺激促凋亡基因的转录41NCK1–SOCS7的核转位是在紫外线诱导的与septin蛋白分离后发生的43作为F-ABP。DNA损伤检查点反应的激活需要NCK1的核功能尚不明确。这突出了肌动蛋白微丝到基因组通信的新方面,特别有助于细胞遗传毒性应激反应。
LIM结构域蛋白
整合素介导的细胞-ECM接触在局部粘连处的参与导致细胞骨架F-ACAP的核移位44,45研究得最好的例子是LIM结构域蛋白,包括zyxin、脂肪瘤防御伙伴(LPP)、甲状腺受体相互作用蛋白6(TRIP6)、paxilin、Hic-5(也称为TGFB1I1)、富含半胱氨酸蛋白1(CRP1)、CRP2、抗白细胞蛋白酶(ALP)、四个半LIM结构区蛋白2(FHL2型)LIM和SH3域蛋白1(LASP1)以及特别有趣的新Cys–His蛋白1(PINCH;也称为LIMS1)。这些蛋白质参与在局部黏附相关肌动蛋白纤维上形成蛋白质-蛋白质组合,或者,可以作为转录的核辅因子或核mRNA输出的调节器。有趣的是,其中一些LIM蛋白是转录因子SRF的辅因子(例如FHL和CRP蛋白)46,47或由SRF-调节基因编码(例如zyxin和FHL2)47,48这些F-ACBP中的每一个都不清楚从粘着灶中解放出来的确切机制,受影响的靶基因也不清楚。局部粘连释放LiM蛋白似乎是一种机制,通过某些F-ACAP信使蛋白将F-actin丝的结构和/或密度的变化传递到细胞核,以调节基因表达。
MRTF–SRF电路
转录因子SRF受Rho GTPases调控的认识49和肌动蛋白动力学50,51为迄今尚未发现的肌动蛋白细胞结构与基因活性之间的联系提供了第一条线索。随后对G-actin调节的SRF辅因子(MRTFs)的细胞核-细胞质穿梭的鉴定首次揭示了细胞质G-actin控制核转录活性的直接机制52MRTF是G-ABPs,该调节系统似乎对促进基于肌动蛋白的细胞运动功能至关重要。因此,本次审查的其余部分集中于MRTF–SRF电路。
SRF的分子和生物学功能
SRF是一种多功能转录因子,由一个在许多细胞类型中大量表达的单一基因编码53,54SRF同源物存在于所有被调查的物种中,从酵母到人类。同二聚体SRF与回文CC(A/T)具有高亲和力和特异性6GG-DnA序列,称为CArG盒55,56,并在各种信号级联的刺激下指导许多靶基因的转录47,57–61.SRF与靶基因启动子联合,构建各种辅因子招募的调控平台58,62Ets-型辅因子的三元复合因子(TCF)亚类最能说明差异辅因子招募63–65和共激活剂心肌蛋白家族(心肌蛋白和MRTFs)66–69这两种类型的SRF辅因子对不同的信号输入(包括丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号和肌动蛋白信号)作出反应,从而使SRF能够指导不同组靶基因的表达70.MRTF和TCF与SRF相互排斥71,72.
SRF靶基因履行基本功能(见下文),部分解释了Srf公司小鼠中的缺失73SRF支持广泛的生物过程,包括原肠胚形成、心脏和心血管系统的发育和功能、所有三种类型肌肉细胞的功能、内皮细胞生物学和血管化、肝脏的发育和再生,免疫系统的T细胞和B细胞活动以及发育中大脑和成人大脑的神经功能。在细胞水平上,这些表型中的许多至少可以部分归因于肌动蛋白微丝功能受损48鉴于SRF在调节肌动蛋白细胞骨架动力学方面的重要性,SRF的功能超出了细胞骨架靶基因的转录控制,包括对细胞生存和凋亡的贡献。
MRTF蛋白的分子和生物学功能
Myocardin,MRTF家族的创始成员(),在心血管系统中特异表达66–68而其他MRTF家族成员表现出更广泛的表达模式。Myocardin与MRTF-A型(也称为MAL、MKL1和BSAC)和MRTF-B型(也称为MKL2和MAL16)在一系列保守结构域中;为了协调命名,我们建议使用基于基因家族同源性标准的MRTF命名69这些有效的转录共激活物通过一个基本区域和一个相邻的Glu-rich结构域与SRF相关().
MRTF的氨基末端包含三个RPEL结构域,它们与单体G-actin形成稳定的络合物52,74–77导致MRTF在细胞质中的隔离。肌卡蛋白含有不同的RPeL结构域,不能有效结合肌动蛋白;因此,同二聚体心肌蛋白是构成核的,对调节肌动蛋白聚合的细胞刺激不敏感68,78然而,有人提出,肌钙蛋白和其他MRTF之间的异二聚体化可以促进SRF调节的肌肉基因中CArG盒之间的合作79因此,心肌可能间接受到MRTF的调控机制的影响,特别是G-actin结合。
心肌蛋白敲除研究(Myocd公司)小鼠的MRTF基因表明,这些SRF共激活物是唯一需要的体内在不同的细胞类型和不同的发育阶段。几乎所有Myocd公司突变表型反映了运动细胞功能和SRF依赖性收缩和细胞骨架基因调控方面的异常80–82缺乏MRTF-A的小鼠是可以存活的,但雌性由于乳腺肌上皮细胞受损而无法养育后代83,84MRTF-B的全基因缺失导致心血管缺陷导致胚胎死亡,包括鳃弓动脉模式异常、右心室双出口、室间隔缺损和薄壁心肌85.
肌动蛋白介导的MRTF核穿梭调控
在低肌动蛋白聚合状态下,MRTF通过与G-肌动蛋白形成可逆的复合物而在细胞质中保持在非活性状态50,52,75因此,MRTF是善意的G-ABP。Rho GTPases的刺激使G-actin进入F-actin丝,从而从G-actin中释放MRTF,并允许MRTF的核输入和随后SRF-依赖性转录的激活().
核G-actin还以多种方式调节MRTF功能76首先,核G-actin促进了MRTF的核出口。其次,核G肌动蛋白阻止核MRTF激活SRF靶基因,因此需要释放核肌动蛋白-MRTF复合物来刺激SRF。因此,细胞G-actin在三个水平调节MRTF:核输入、核输出和MRTF-SRF-依赖性转录的核激活或失活76(). 也有人认为,MRTF的MAPK磷酸化通过增强MRTF与核肌动蛋白的相互作用来刺激其核输出86因此,鉴于肌动蛋白基因本身受到MRTF-SRF的控制,出现了一个G肌动蛋白依赖的、动态调节的自我调节反馈环,用于由MRTF–SRF介导的Rho定向转录控制。Rho激活G-actin和ABP的初始合成,以刺激F-actin在细胞质中的聚合,从而满足刺激引发的细胞生物学需求。随着肌动蛋白合成的进行,细胞质和细胞核中的G-actin水平都会升高,从而通过同时损害核功能和促进核MRTF的输出,以及通过确保细胞质MRTF有效保留来降低SRF反应(). 因此,MRTF的核-细胞质穿梭是这种肌动蛋白定向反馈电路的重要组成部分。
上述调节机制在肌肉细胞和培养的成纤维细胞中得到了最全面的描述。相比之下,在缺乏刺激的情况下,初级神经元中MRTF的核水平较高。识别影响神经元核MRTF活性的调节剂并探索核肌动蛋白的潜在作用将是一件有趣的事情12,76和核MRTF磷酸化86,87MRTF的神经功能。
MRTF的积极和消极调节因素–SRF活动
除TCF和MRTF外,还有许多辅因子对SRF活性产生积极和消极影响。在肌肉细胞的细胞质中,横纹肌Rho依赖信号的激活物(星星; 也称为ABRA)是一种在心肌病期间上调的G-ABP88STARS定位于肌节,通过与单体G-actin相互作用,促进MRTF-A的核转位。STARS因此与MRTF-A-同步,以刺激SRF介导的转录。SRF的阳性核辅因子包括Nkx2–5同源结构域蛋白家族89,锌指蛋白GATA家族成员90,91和富含半胱氨酸的LIM-only蛋白的CRP家族46阴性共因子包括LIM-only蛋白FHL2(REFS47,92),组蛋白脱乙酰酶4(HDAC4)93,同源结构域蛋白MSX1(参考。94)锌指蛋白krueppel-like因子4(KLF4型)95同源密码子蛋白(HOP)通过与心肌细胞竞争心肌蛋白和MRTF-A的相互作用,以及通过向SRF靶基因招募HDAC2来抑制心肌细胞中的SRF活性96–98除了SRF之外,心肌病家族成员还与其他合作伙伴合作。这些包括组蛋白乙酰转移酶p300(REFS99,100),II类HDAC99,SMAD4(参考。101)(一种受TGFβ信号调节的转录因子),叉头盒蛋白O4(FOXO4)95和GATA转录因子102SRF与阳性和阴性伴侣的这种组合结合通过提供细胞类型特异性、时间控制和对SRF靶基因的信号响应性来扩大SRF的调节潜力。
MRTF–SRF靶基因功能
SRF靶基因包含用于SRF结合的功能性CArG盒,已通过候选基因特征、SRF缺陷细胞的全基因组表达谱和生物信息学基因组查询47,48,59,60(有关审查,请参阅REF。57). 基于这些研究,我们估计SRF靶基因的数量约为300个。带有抗SRF抗血清的染色质免疫沉淀(ChIP)为SRF的直接基因调控提供了严格支持,已鉴定出200多个SRF靶基因103选择性辅因子募集(TCF vs.myocardin和MRTFs)指导不同类别SRF靶基因的信号特异性调节。第一类靶基因主要编码具有“即时-早期”细胞功能的蛋白质,包括编码G0-G1转变蛋白的基因的快速转录激活,这些靶基因由TCF辅因子辅助62,63Ⅱ类靶基因,由SRF与心肌蛋白或其他MRTF辅因子共同调节57,编码至少三种类型的蛋白质,即参与肌肉特异性和收缩功能、肌动蛋白微丝动力学和细胞运动以及miRNA活性的蛋白质。在下文中,我们将讨论局限于第二类SRF靶基因,以强调其受心肌蛋白家族转录共激活物的调控。
肌肉特异性和收缩性基因
几乎所有平滑肌特异基因和许多心肌和骨骼肌基因都由CArG盒控制。肌卡蛋白是SRF依赖性平滑肌基因表达的一种特别有效的激活剂79,84,104–106MRTF的强制过表达也会激活转染细胞中的平滑肌基因,这就提出了一个问题,为什么许多非肌肉细胞中内源性MRTF水平不足以驱动肌肉基因的表达59,69,107,108内源性MRTF水平很可能由肌动蛋白信号调节,而过表达的MRTF绕过这种调节机制,直接激活下游肌肉基因。骨骼肌分化也需要MRTF,如骨骼肌基因表达对显性阴性MRTF突变体表达的抑制所示体内和在体外59,108肌肉细胞的许多收缩功能是由肌钙蛋白-SRF和MRTF-SRF调节基因激活的57.
影响肌动蛋白动力学和细胞运动的基因
受MRTF辅因子募集调控的SRF靶基因编码与肌动蛋白细胞骨架活性相关的蛋白质。根据SRF调节的基因产物对肌动蛋白微丝功能的贡献,可将其分为三类:结构(例如肌动蛋白)、肌动蛋白周转效应器(例如cofilin 1)和肌动蛋白动力学调节器(例如talin 1)。列出了一些特征鲜明的细胞骨架SRF靶基因示例。在生物学方面,编码蛋白有助于发育(中胚层模式)、收缩装置的功能(肌肉细胞收缩、血管张力)以及ECM介导的粘附和组织重塑。
表1
基因符号* | 基因名称 | 功能 |
---|
微丝功能的结构成分 |
ACTA1公司 | 肌动蛋白,α1 | 微丝建筑 |
活性剂2 | 肌动蛋白,α2 | 超细纤维建筑 |
ACTB公司 | 肌动蛋白,β | 微丝建筑 |
动作g1 | 肌动蛋白,γ1 | 微丝建筑 |
动作2 | 肌动蛋白,γ2 | 微丝建筑 |
校准1 | Caldesmon 1号机组 | 肌肉细胞收缩 |
DMD公司 | 肌萎缩蛋白 | 薄膜锚固 |
ITGB1标准 | 整合素,β1 | 焦点粘附组件 |
2011马来西亚令吉 | 肌球蛋白重链11 | 肌动球蛋白结构 |
MYH9年 | 肌球蛋白重链9 | 肌动球蛋白结构 |
9车型年款 | 肌球蛋白轻链9 | 肌动球蛋白结构 |
标签(SM22A) | Transgelin公司 | 肌肉细胞收缩 |
SMTN公司 | 平滑蛋白 | 肌肉细胞收缩 |
胎压监测1 | 原肌球蛋白1 | 肌肉细胞收缩 |
VCL公司 | 文丘林 | 将整合素与 微丝 |
肌动蛋白周转的效应物 |
ACTR3(ARP3) | 肌动蛋白相关蛋白3 | 微丝周转和 分支 |
CFL1型 | 科菲林1 | 微丝周转 |
GSN公司 | 盖尔索林 | 微丝周转 |
VIL1号机组 | 维尔林1 | 微丝重组 |
SVIL公司 | Supervillin公司 | 微丝重组 |
肌动蛋白动力学调节器 |
CTGF公司 | 结缔组织 生长因子
| ECM蛋白是一种 整合素配体与调控 细胞迁移活动 |
61日历年(CCN1型) | 富含半胱氨酸的蛋白质61 | ECM蛋白是一种 整合素配体与调控 细胞迁移活动 |
FHL1层和FHL2型 | 四个半LIM 域1和域2 | 粘附连接信号 和转录调控 (通过SRF绑定) |
FLNA公司 | 丝素A | 整合素信号 |
基质金属蛋白酶9 | 基质金属蛋白酶9 | ECM重塑与细胞 迁移 |
MYLK(马来西亚) | 肌球蛋白轻链激酶 | 肌动球蛋白调节 |
战略参考框架 | 血清反应因子 | 转录调控 |
TLN1型 | 塔林1 | 整合素信号传导 |
使用MRTF活性调节剂进行表达谱分析(显性阴性MRTF和在缺乏或存在latrunculin B的情况下用细胞钙素D治疗;参见方框2)确定了约30个MRTF依赖性SRF靶基因的子集7,59,109。我们预计这一数字将随着调查的进行而增长110.基于ChIP的证据可以证明MRTF与CArG箱中SRF的关联,但有限103尽管存在这种局限性,但已确定的MRTF依赖性SRF靶基因有助于细胞-ECM粘附和肌动球蛋白活性。局灶性粘连的许多结构成分由SRF–MRTF调节基因编码,包括α1、α5、α9和β1整合素,以及talin 1、vinculin和syndecan蛋白2和4(REF)。57)SRF缺乏导致局部粘连形成受损48.
微小RNA
最近的研究揭示了miRNAs在细胞回路中的核心作用,SRF和MRTFs通过其控制肌肉基因表达、细胞骨架动力学和应激反应111SRF直接激活编码同源miRNA对的两个双顺反子miRNA基因的表达(miR-1-1和miR133a-2,以及miR-1-2和miR1133a-1)112(). 这些miRNAs反过来调节大量mRNAs,其中许多编码影响SRF-MRTF信号通路的蛋白质。例如,miR-133抑制SRF的表达,从而建立负反馈回路,精确滴定肌肉细胞中的SRF表达113一个特别有趣的发现是miR-1可以替代SRF从小鼠胚胎干细胞诱导中胚层114.
SRF介导的miRNAs调控一|血清反应因子(SRF)对microRNA-1(miR-1)和miR-133的调节。SRF激活编码miR-1和miR-133(REFS)的双顺反子miRNA簇的转录112,113). miR-133a抑制SRF表达,建立精确滴定的反馈回路来调节SRF活性。哺乳动物基因组中有两组miR-1和miR-133a基因,它们在心肌和骨骼肌细胞中特异表达。第三对同源miRNAs,miR-206和miR-133b,独立于SRF在骨骼肌中特异表达。miR-1基因缺失导致苯妥英钠,表明其在中胚层形成中起作用。由于心脏缺陷,两个miR-133a基因的基因缺失导致围产期死亡。miR-1和miR-133a还抑制神经外胚层和内胚层基因并促进中胚层基因表达。miR-1可以替代SRF,通过一种不明确的机制调节参与中胚层发育的下游基因。b条|SRF对miR-143和miR-145的调节。SRF激活编码miR-143和miR-145的双顺反子miRNA簇的转录,这些miRNA簇在心脏和平滑肌细胞中特异表达115,117这些miRNAs调节许多编码肌动蛋白信号调节器和心肌相关转录因子(MRTF)-SRF活性的mRNAs的表达,从而建立一系列精细的反馈回路来调节肌动蛋白-MRTF-SRF信号通路。miR-143或miR-145的靶点包括锌指蛋白krueppel-like factor 4(KLF4)和KLF5(抑制SRF)、MRTF-B、弹弓2磷酸酶(SHH2;通过辅酶磷酸化控制肌动蛋白聚合)、加合蛋白3(促进肌动蛋白聚合)和Slit-Robo Rho GTPase激活蛋白1(SRGAP1)和SRGAP2(抑制Rho信号传导)115该途径已被证明对损伤后的血管重塑至关重要。在缺少miR-143和miR-145的情况下,肌动蛋白应力纤维的形成被破坏,使平滑肌细胞对通常导致血管狭窄的机械刺激不敏感。
心肌细胞中MRTF-A调节的miRNA筛选发现了几种在肌肉分化、增殖和表型转换中发挥关键作用的miRNA115与野生型小鼠胚胎干细胞相比,许多相同的miRNA在SRF-null中表达下调。生物信息学还显示,与miRNA基因相关的预测SRF结合位点数量不成比例116.
miR-143和miR-145由双顺反子miRNA基因编码,由远端上游CArG盒控制(). 这两种miRNAs在早期心脏祖细胞和整个胚胎心脏中表达,然后局限于所有血管和内脏平滑肌细胞115,117据报道,在培养细胞中,miR-145基因敲除可阻断心肌蛋白对平滑肌基因的激活,表明这种miRNA是心肌蛋白的重要辅因子117,118相反,缺乏miR-143和/或miR-145的敲除小鼠是可行的,并且正常表达平滑肌SRF靶基因115然而,这些小鼠对血管损伤引起的血管重塑具有抵抗力。这些突变小鼠对血管损伤的不敏感性似乎反映了参与调节肌动蛋白细胞骨架动力学和应力纤维形成的蛋白质集合的异常调节,使突变小鼠对管壁变形不敏感。例如,这些miRNAs以内收蛋白3为靶点,内收蛋白覆盖肌动蛋白细丝的倒刺末端,充当细胞膜和肌动蛋白细胞骨架之间的桥梁115Slingshot 2是miR-143和miR-145的另一个靶点,通过去磷酸化和激活肌动蛋白切断因子cofilin促进细胞运动并增强F-actin重组。miR-145靶向抑制SRF活性的KLF4和KLF5,以及通过灭活小GTPase Cdc42和抑制肌动蛋白聚合来调节细胞迁移的Slit-Robo GTPase激活蛋白115最后,这些miRNAs以其表达的上游调控因子MRTF-B为靶点,提供一个负反馈回路来精确滴定miR-143和miR-145的表达和肌动蛋白动力学115().
缺少miR-143和miR-145的小鼠由于血管张力降低,血压降低。这些发现表明miR-145和miR-143在调节SRF调节的细胞骨架转录回路的反馈回路控制中发挥了作用。
另一个由SRF和MRTF共同调节的miRNA是miR-486,这是一种心肌和骨骼肌富集的miRNA,由锚蛋白1内含子中的替代启动子表达。119). miR-486是SRF–MRTF途径的下游效应器,通过抑制磷酸酶和张力蛋白同源物(PTEN)和FOXO1A的表达,促进磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)–AKT信号传导,FOXO1A是PI3K信号传导的负调控因子。
通过调节影响控制MRTF–SRF活性的信号系统的miRNAs表达,MRTF-SRF伙伴关系产生了一个平衡的调节网络,以控制细胞骨架功能和信号反应性。奇怪的是,与其他转录因子相比,SRF与miRNA调节电路紧密相连。也许这反映了对SRF及其下游目标保持严格控制的重要性。
病理学中的肌动蛋白–MRTF–SRF回路
MRTF介导的肌动蛋白细胞骨架和基因组之间的通讯对细胞的许多运动功能具有广泛的意义。细胞类型特异性小鼠敲除研究Srf公司和MRTF基因表明MRTF–SRF回路对人类病理学有贡献。以下结合对人类健康的两大威胁:心血管疾病和癌症,讨论了支持这一概念的现有证据。
心血管疾病
鉴于编码收缩蛋白的基因过多,这些收缩蛋白由SRF和心肌细胞蛋白家族成员调节,因此,这种调节途径在肌肉细胞的力和机械传感中起着中心作用,这一点也就不足为奇了,因此,SRF-依赖性基因表达的失调导致了许多心血管系统疾病模型。在肥大和心力衰竭的心脏病理重塑过程中,SRF依赖性基因失调。STARS和心肌炎是SRF功能的两个阳性调节剂,在心肌病和肥厚期间分别上调88,120,121在衰竭心脏中,半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3对SRF的裂解产生一种显性阴性形式的SRF,可能抑制肉瘤基因的表达122因此,SRF不仅是心脏收缩蛋白适当表达所必需的,而且过多的SRF也是致病性的,这表明MRTF–SRF活性对心脏稳态的需求。这可能解释了为基因调控程序提供稳健性和稳定性的miRnAs与MRTF–SRF信号通路紧密结合的原因。
最近,研究表明,在阿尔茨海默病期间,SRF和肌钙蛋白在大脑小动脉中过度表达,并通过激活SRF依赖的平滑肌收缩基因,增强动脉的高收缩性,从而减少脑血流量,从而在疾病的进展中起到关键作用123此外,SRF和肌球蛋白控制脑血管平滑肌细胞对淀粉样蛋白-β肽的清除124.
SRF还作为平滑肌细胞表型的中央调节器,对损伤作出反应,并促进血管壁病理性平滑肌细胞增殖。减少心肌蛋白和MRTF活性的信号促进平滑肌细胞过度增殖,如动脉粥样硬化和再狭窄期间发生的情况125叉头转录因子FOXO4和锌指蛋白KLF4在血管平滑肌细胞的去分化过程中上调体内 95从而抑制SRF依赖的转录。因此,MRTF–SRF电路作为机械应力和生长因子信号的节点传感器,调节平滑肌细胞的表型转换。
癌症
肌动蛋白–MRTF–SRF回路与人类癌症生物学的关联已被确定,表明MRTF-SRF参与肿瘤过程。然而,仍缺乏与临床相关致癌发生有关的确切证据。
婴儿急性巨核细胞白血病(AMKL)与预后不良相关,与平衡染色体易位t(1;22)(p13;q13)有关,其中MRTF-A基因(MKL1公司; 亦称为MAL公司)融合到基因组融合伙伴OTT(也称为RBM15)126–128(). OTT–MAL是SRF的一种组成性核自由基激活剂,不受G-actin的控制129–131.OTT–MAL激活转录因子Jκ重组信号结合蛋白(RBP-Jκ),该蛋白通常由典型notch信号控制,并被OTT–MA所覆盖,导致异常巨核细胞生成132.
肌球蛋白被认为是一种分化诱导肿瘤抑制蛋白,在间质源性肉瘤中下调133相比之下,平滑肌肉瘤(LMS)平滑肌肿瘤显示肌钙蛋白过度表达134在人类前列腺癌中,雄激素受体活性被认为可以调节SRF依赖的FHL2(REF)表达。135)其本身是SRF活动的调节器47,92和整合素信号;SRF或FHL2的表达与预后不良相关。
MRTF–SRF活性与肌动蛋白调节的细胞运动功能的一般联系将肌动蛋白–MRTF活性与癌症转移联系起来。因此,在一项实验中,MRTF或SRF的耗竭导致转移性肿瘤细胞的粘附、扩散、运动、侵袭和定植减少体内转移试验109为了支持MRTF–SRF活性促进肿瘤转移,发现癌细胞侵袭抑制因子(SCAI)抑制MRTF活性。推测SCAI下调MRTF–SRF介导的β1整合素的表达,从而抑制肿瘤细胞侵袭136.
结论和未来方向
虽然以前未被重视,但现在似乎很明显,肌动蛋白驱动的细胞运动需要基因组支持。现在可以概括出几个独立的机制,将肌动蛋白细胞骨架的动态状态传达给基因组。微丝到基因组的通讯由不同的信使蛋白介导,这些信使蛋白代表G-ABP、F-ABP或F-ACAPs,其核移位的细胞质释放取决于G-actin水平或F-actin结构和组成的变化。如CRP、FHL2、JMy和MRTF蛋白所示,这种信使蛋白可以作为转录辅因子在细胞核内发挥作用。通过多种辅因子相互作用和信号输入控制SRF活性是理解基因组活动与肌动蛋白细胞骨架动力学联系的逻辑的范例。肌动蛋白动力学、MRTF–SRF调节的基因表达和细胞运动行为之间的密切功能联系已通过遗传手段在几个细胞和器官系统中得到证实,包括胚胎干细胞48,发育中的小鼠胚胎73,116,137,肌肉组织82,138和大脑11,139,140然而,MRTF–SRF回路和上述所有其他系统中涉及的调控相互作用的许多分子细节仍有待研究。
我们预计将鉴定出新的肌动蛋白依赖性信使蛋白。对于每个中继系统,全面表征相关的差异基因表达谱是很重要的。MRTF–SRF定向表达miRnA编码基因的例子表明,令人惊讶的机制洞察力将来自于细胞生物学这一领域的未来研究。
微生物病原体、两种细菌(例如,李斯特菌属Spp.、。,沙门氏菌属唾液和肠致病性大肠杆菌)和病毒(例如痘苗病毒)通过调节其肌动蛋白动力学,破坏受感染宿主细胞的肌动蛋白细胞骨架功能(综述见REF)。141). 这些对微丝重塑的影响可能伴随着基因活性的变化,我们推测这与MRTF–SRF回路有关。同样可能的是,其他迄今未被检测到的G-ABP可能与此类宿主细胞感染事件有关。更笼统地说,肌动蛋白动力学可能与基因组沟通,从而对抗其他细胞损伤,正如在紫外线诱导的DNA损伤中已经看到的那样。
依赖于动态肌动蛋白重排的囊泡转运,如内吞、外吐和高尔基体到内质网的转运,也可能引起甚至需要基因表达的改变。膜贩运的这一研究不足的方面值得进行更深入的调查,并可能提供令人惊讶的新见解。
胚胎发育需要细胞运动和许多基本步骤的运动功能。微丝到基因组通信对这些活动的确切贡献仍不清楚。虽然SRF在小鼠原肠胚形成中的参与早在73MRTF–SRF电路有望以许多其他方式促进开发,包括在EMT期间启用功能22以及干细胞编程和重编程117深入了解这些问题将是有益的。
在识别肌动蛋白依赖性SRF辅因子和确定其作用机制方面取得的显著进展,为细胞生理学、发育和疾病的诸多方面提供了新的见解。鉴于肌动蛋白–MRTF–SRF通路可能参与疾病期间的组织重塑,确定如何对这种和类似的细胞骨架-核通讯途径进行治疗性调节将非常重要。
致谢
我们向所有因空间限制而无法完全引用其工作的同事致歉。我们感谢G.Posern和B.Knöll对手稿的评论。该组织得到了美国国立卫生研究院、美国心脏协会、罗伯特·A·韦尔奇基金会和勒杜克基金会的资助。A.N.确认DFG的财务支持(No120/12-3和SFB 773/A3)。
词汇表
F-肌动蛋白 | G-actin单体的一种柔性螺旋聚合物,直径为5-9纳米。F-actin聚合物是极性的,显示正(+)和负(−)端 |
焦点粘连 | 一种通过整合素受体将细胞外ECM与细胞内肌动蛋白细胞骨架连接起来的细胞结构 |
鸟嘌呤核苷酸交换因子 | 一种通过催化结合GDP与GTP的交换而激活特定小GTP的蛋白质 |
异三聚体G蛋白 | 异源三聚体细胞质信号介质家族之一,由包含GTP结合位点和内在GTPase活性的α亚基以及疏水性和经常酰化的β-和γ-蛋白亚复合物组成。β-和γ-蛋白亚复合体可能通过α-GTP的解离而被激活,而α-GTP的解离是由α-亚基上的GTP交换引发的 |
上皮-间充质转化 | 上皮细胞转化为具有迁移和侵袭特性的间充质细胞 |
粘合连接 | 一种细胞-细胞黏附复合体,包含附着在细胞质肌动蛋白丝上的经典钙粘蛋白和连环蛋白 |
SAP域 | (SAFA或SAFB、腺泡和PIAS结构域)。在几种已知与DNA接触的蛋白质中发现的肽基序 |
亮氨酸拉链 | 蛋白质中富含亮氨酸的结构域,与具有类似结构域的其他蛋白质结合 |
LIM域 | (Lin11,Isl1和Mec3结构域)连接两个锌离子的锌结合蛋白结构域。LIM结构域介导与其他蛋白质的相互作用,并作为基因表达、细胞粘附和运动以及信号转导的调节器具有多种功能 |
RPEL域 | 含有氨基酸序列Arg-Pro-X-X-X-Glu-Leu的蛋白质结构域,在转录辅激活物的心肌蛋白家族中发现有三倍。RPEL结构域与G-actin形成稳定的复合物 |
带刺端 | 极性F-actin聚合物的正(+)端与负(−)端相比,在G-actin并入聚合物时更为活跃(聚合物伸长) |
平滑肌肉瘤 | 一种罕见的癌症(软组织肉瘤),起源于平滑肌的恶性肿瘤。 |
工具书类
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