RPS10是PRMT5的基板
在我们研究富含亮氨酸重复激酶2(LRRK2)相关复合物的过程中,我们纯化了一组内源性LRRK2-相互作用蛋白。三在这一组中,我们发现了几种属于先前报道的复合物甲基体的蛋白质,包括PRMT5、MEP50(甲基体蛋白50,甲基体的支架)(31)以及PRMT5的几种底物,例如组蛋白2A和组蛋白4。这表明LRRK2相关复合物可能在蛋白质甲基化中起作用。因为富含甘氨酸和精氨酸的基序(GAR基序)是精氨酸甲基转移酶子集的保守甲基化位点,我们搜索了其他包含GAR基元的LRRK2相关蛋白并发现了RPS10。
RPS10是核糖体40S亚基复合物的成员。基于以下证据,我们假设RPS10是PRMT5的底物。首先,40S人核糖体的质谱结果表明RPS10甲基化修饰(32); 其次,对大鼠脑提取物进行了类似的质谱分析,发现了一种RPS10 C末端肽,其质量比预测的大56Da(33); 第三,87.1%的系统性红斑狼疮患者抗Sm血清(识别Sm中的sDMA)具有抗RPS10的抗体活性(34). 最后,Y12,一种特殊的对称二甲基化抗体,识别Sm的sDMA并与RPS10交叉反应(34).
为了验证我们的假设,即RPS10是PRMT5的新底物,我们首先使用交互免疫沉淀法研究RPS10和PRMT5是否相互作用。在转染细胞中,不同标记的PRMT5和RPS10蛋白共同表达,随后免疫沉淀,在RPS10和PRMT5之间检测到一种特殊的复合物(,A类和B类). 为了评估内源性PRMT5和RPS10是否相互作用,HEK293细胞裂解物与PRMT5及RPS10抗血清进行联合免疫沉淀和Western印迹。免疫沉淀物分析显示内源性蛋白之间有明显的相互作用(C类). 为了进一步表征PRMT5和RPS10之间的相互作用,我们用从HEK293细胞裂解物中纯化的FLAG-PRMT5培养纯化的GST和GST融合的RPS10。观察到GST-RPS10和FLAG-PRMT5之间的相互作用(D类).
RPS10与PRMT5相互作用体内和在体外. A类和B类,RPS10与PRMT5相互作用体内用编码标签的表达载体转染HEK293细胞PRMT5项目和RPS10型如图所示。24小时后,保存小份细胞裂解物用于分析表达的标记蛋白。用FLAG-PRMT5的抗FLAG免疫沉淀剩余部分的裂解物,并分析Myc-RPS10的免疫复合物(A类). 交互共表达/免疫沉淀(IP(IP))实验中,用抗Myc抗体对细胞裂解物进行免疫沉淀,并检测免疫复合物中是否存在GFP-PRMT5(B类).C类,内源性PRMT5和RPS10相互作用。HEK293细胞裂解物用所示的抗RPS10或IgG抗体进行免疫沉淀。分别检测PRMT5和RPS10的免疫复合物。D类,PRMT5与RPS10相互作用在体外表达、纯化用于结合分析的GST和GST-RPS10融合蛋白,并用FLAG珠与从HEK293细胞裂解液中纯化的FLAG-PRMT5蛋白孵育。分别用GST和FLAG抗血清检测GST、GST-RPS10和FLAG-PRMT5。
在认识到RPS10在生理条件下与PRMT5相互作用后,我们接下来检查RPS10是否是PRMT5的底物。通过将免疫纯化的FLAG-PRMT5与GST-RPS10和[甲基-三【H】S公司-腺苷蛋氨酸,我们发现PRMT5可以甲基化GST-RPS10,但不能甲基化GST(B类). RPS10在其C末端包含几个潜在的富含甘氨酸-精氨酸(GAR)基序(Arg-Gly-Gly-Phe(RGGF)和Arg-Gly(RG))(A类). 为了确定RPS10中的这个区域是否为甲基化位点,我们构建了一个C末端GAR基序缺失突变体(ΔGAR)。GAR基序的去除导致PRMT5甲基化修饰的丢失(B类). 这表明PRMT5在其C末端GAR基序内甲基化RPS10。
PRMT5甲基化物RPS10两者在体外和体内. A类,人类保守RG-丰富基序的比对(智人),鼠标(小家鼠),黑腹果蝇,秀丽隐杆线虫、和绒球裂殖酵母高度保守的残基在黑色; 弱保守残基在灰色。B类,PRMT5甲基化RPS10的C末端在体外按照“实验程序”中的描述,使用免疫纯化的FLAG-PRMT5对GST、GST-RPS10或RPS10的GAR基序缺失突变体(ΔGAR)进行甲基化,并通过SDS-PAGE分离和考马斯亮蓝染色进行可视化(左边)和放射自显影术(正确的).C类,氩气158和Arg160RPS10中是PRMT5甲基化的残基体外试验。体外采用免疫纯化的FLAG-PRMT5对GST-RPS10、GST-RPS10ΔGAR和RPS10精氨酸单突变体或双突变体(GST-RPS-R158K、-R160K或-R158K/R160K)进行甲基化分析,如B、D类,PRMT5甲基化物RPS10体内用FLAG标记的基因转染HEK293细胞RPS10型或转速10-R158K/R160K以及PRMT5项目24 h后,用抗FLAG抗体免疫沉淀细胞裂解物,用SYM11探针检测RPS10中对称二甲基精氨酸。用RPS10或RPS10-R158K/R160K的抗FLAG抗体对印迹进行了重新验证。E类,RPS10的甲基化需要PRMT5体内用FLAG转染HEK293T细胞-RPS10型与靶向荧光素酶或PRMT5项目比例为1:5。转染后48小时,用抗PRMT5抗血清进行免疫印迹分析细胞裂解物(左侧面板,GAPDH用作加载控制)。免疫沉淀物(IP(IP))用细胞裂解物中的FLAG抗体获得的RPS10的抗FLAG抗体和RPS10中对称二甲基精氨酸的SYM11抗体进行分析(右侧面板).
RPS10C末端的GAR基序中有三个精氨酸残基,即精氨酸153,氩气158、和Arg160质谱结果显示RPS10的分子质量增加了56-Da(33)表明存在两种二甲基精氨酸。为了确定甲基化位点的准确位置,我们将潜在氨基酸单独或组合突变为赖氨酸残基。所得的RPS10的R158K和R160K突变体通过PRMT5表现出较弱的甲基化,并且R158K/R160K突变体的甲基化完全丧失(C类). 精氨酸158和Arg160因此,RPS10可能是PRMT5甲基化的位点。
研究RPS10甲基化是否需要PRMT5以及Arg158和Arg160RPS10的精氨酸甲基化位点体内,我们使用对称的二甲基精氨酸特异性抗体SYM11检测免疫纯化RPS10和RPS10-R158K/R160K蛋白中的甲基化精氨酸残基。如所示D类,SYM11抗体在WT RPS10中清楚地检测到甲基化,但在从转染的293细胞免疫纯化的RPS10(R158K/R160K)中没有检测到甲基化。然后,我们敲低了具有不同shRNA的U2OS细胞中PRMT5的表达,发现内源性RPS10的甲基化水平显著降低(E类). 综上所述,这些结果表明PRMT5可以在Arg下使RPS10甲基化158和Arg160二者都在体外和体内.
RPS10的甲基化是正常细胞增殖所必需的
因为有报道称一组核糖体蛋白可以调节细胞周期和细胞增殖(35,36),我们研究了RPS10在细胞增殖中的生理作用。我们生成了两种不同的shRNA-表达结构,以敲低Bel7402细胞中内源性RPS10的表达。如所示,A–C,转染后2天内源性RPS10蛋白水平显著降低,转染si的细胞RPS10型构建物的生长速度比转染对照siRNA的细胞慢得多。到第5天,转染对照siRNA的细胞生长速度慢,但转染对照siRNA的细胞的生长速度慢RPS10型构造,形成殖民地(A类). 对于其他细胞系,包括U2OS和HEK293,也获得了类似的结果(数据未显示)。这表明RPS10是维持细胞增殖所必需的。
RPS10通过PRMT5甲基化是正常细胞增殖所必需的。 A类和B类,RPS10是细胞增殖所必需的。pSIREN-DNR-DsRed.si荧光素酶RPS10型A、 和pSIREN-DNR-DsRed.siRPS10型B(标记为控制,标准RPS10 A、和标准RPS10 B)共同转染到Bel7402细胞中。24小时后,将细胞分裂成6孔板,并让其再生长5天。A类,转染细胞在第1天显示(顶部)和5(底部)在荧光显微镜下(×10)。B类每天在荧光显微镜下计数转染细胞数。实验重复三次,数值代表转染细胞的平均数量,是重复培养±S.E.的平均值。C类,RPS10型shRNAs可以下调内源性RPS10的表达。Bel7402细胞被转染为A类36小时后,通过使用RPS10抗血清的蛋白质印迹测定RPS10的表达。以β-微管蛋白作为负荷对照,对印迹进行再表达。D类和E类,重量RPS10型在RPS10敲除细胞中,比甲基化突变体更好地恢复细胞增殖。Myc-tagged WT和甲基化突变siRNA-resistantRPS10型(SR-WT公司和SR-R158K型/对160公里)通过改变三个核苷酸生成,如下划线的,不改变氨基酸序列(D类,下部面板). Bel7402细胞与si共转染RPS10型与控制器SR-WT或SR-R158K/R160K一起使用。36小时后,收集细胞,将一半细胞分成6孔板进行救援实验(E类).D类,内源性和外源性RPS10的表达被确定为C类每2天计数一次转染细胞数,共6天。实验重复四次,数值表示为平均值±S.E.(第4天,第页< 0.05; 第6天,第页<0.01)(E类).
为了检测RPS10的甲基化是否在增殖中起作用,我们比较了WT RPS10和RPS10甲基化突变在RPS10敲除细胞中的拯救作用。首先,我们设计了WT和甲基化突变siRNA-resistantRPS10型(销售代表-RPS10型)通过改变三个核苷酸RPS10型不改变氨基酸序列(D类). Bel7402细胞与si共转染RPS10型与siRNA-resistant WT或甲基化突变RPS10型。如所示E类,WT SR的表达式-RPS10型RPS10敲除细胞比甲基化突变SR更有效地恢复细胞增殖-RPS10型总细胞裂解物的Western blotting显示,在si中RPS10蛋白水平下调RPS10型-转染细胞和siRNA-resistant RPS10(WT或甲基化突变)的表达恢复了与对照组相似的总RPS10水平(D类). 因此,我们推测RPS10的甲基化在适当的细胞增殖中发挥作用。为了进一步支持这一结论,我们能够建立具有SR的永久性细胞系-RPS10型,但不适用于SR-RPS10型-R158K/R160K,在表达RPS10型shRNA(补充图S2和数据未显示)。
RPS10甲基化在RPS10有效组装成核糖体中起作用
因为RPS10的甲基化对细胞增殖很重要,我们继续通过检测RPS10组装成核糖体来研究其潜在机制。将WT RPS10或RPS10甲基化突变体转染到HEK293细胞中,并通过超速离心分离核糖体。如所示A类,将翻译的多聚体合并在超速离心沉淀中。正如预期的那样,所有核糖体组分中都存在内源性RPS10,包括总细胞裂解物、上清液和多聚体组分,而GFP和GAPDH仅在总细胞裂解液和上清液组分中检测到。FLAG标记的WT RPS10蛋白存在于游离细胞质组分和多聚体中,表明它可以正确组装成核糖体。
RPS10的甲基化在RPS10高效组装成核糖体和蛋白质合成中起着重要作用。 A类如“实验程序”所述,通过超速离心分离细胞质多聚体。从转染FLAG标记WT的HEK293细胞中提取多聚体部分RPS10型或R158K/R160K突变体与pCMS一起。EGFP。使用RPS10、GFP和GAPDH特异性抗体通过Western blotting分析收集的组分。T型,S公司、和P(P)分别代表总细胞裂解物、上清液和分离的多聚体。B类,通过ImageJ软件将与多聚体相关的外源性RPS10的分数定量分析计算为多聚体中的RPS10-FLAG/多聚体内的内源性RPS10-FLAG,并用总细胞裂解物中的RPS0-FLAG或总细胞裂解液中的内源性RP S10进行归一化。数值为三个独立实验,平均值±S.E(第页< 0.05).C类,多聚体剖面。转染48小时后,转染HEK293T细胞的总提取物RPS10型shRNA与任一SR-RPS10型-Myc或甲基化突变RPS10型用超速离心法进行5~45%线性蔗糖密度梯度沉淀。线性峰值表示在254nm处的吸光度的连续测量。D类,RPS10甲基化突变导致蛋白质合成速率降低。细胞被转染为C类在转染后.48小时,将培养基换成无Met培养基,补充有[35S] 会议。标记后1h收集细胞,然后进行SDS-PAGE分析。SDS-PAGE凝胶用考马斯蓝染色(左边,车道1,WT SR-RPS10/RPS10 shRNA;车道2,SR-RPS10甲基化突变/RPS10 shRNA),干燥,暴露于x射线胶片35S标记蛋白质(正确的,车道3和4对应于车道1和2).E类,总蛋白质合成的定量分析D类计算为35S放射性/总蛋白(考马斯蓝染色),使用ImageJ软件。数值为三个独立的实验平均值±S.E.(*,第页< 0.01).
为了确定RPS10甲基化突变体是否与WT RPS10一样有效地组装到核糖体中,我们使用ImageJ软件分析了与多聚体相关的外源RPS10的比例。多聚体相关的外源性RPS10的百分比计算为多聚体中的RPS10-FLAG/多聚体中的内源性RPS10,并用总细胞裂解物中的RPS10-FLAG/总细胞裂解物中的内源性RPS10进行归一化(B类). 与核糖体相关的RPS10-R158K/R160K突变体的比例小于WT RPS10突变体(B类)表明RPS10甲基化突变体组装成核糖体的效率较低。
Rmt3是人类PRMT3的同源物,其特征是核糖体蛋白Rps2的甲基转移酶(21,42). RMT3-完整细胞产生非甲基化的Rps2,并显示40S:60S核糖体亚单位比率失调(21). 由于RPS10甲基化突变体组装成核糖体的效率较低,我们分析了蔗糖梯度中的核糖体谱,包括游离40S和60S核糖体亚基以及80S单体的水平,以确定核糖体生物合成是否受到影响。与酵母Prmt3被破坏的情况一样,当内源性RPS10被shRNA击倒时,细胞中RPS10-R158K/R160K的表达导致40S:60S核糖体亚基比率的扰动。这个A类254表达野生型RPS10的细胞的60S∶40S比率为2.01;这个A类254在表达突变RPS10的细胞中,三个独立实验的比率增加了约19.5%至2.40(C类,尖峰箭头). 这表明RPS10的甲基化突变可能导致40S:60S核糖体亚基比率的错误调节。
为了检测在表达突变RPS10的细胞中发现的核糖体亚单位失衡是否影响细胞中的整体蛋白质合成,用[35S] 蛋氨酸并在SDS-PAGE凝胶上分离。如所示,D类和E类,表达突变RPS10的细胞中大多数新合成的蛋白质水平低于表达WT RPS10细胞中的蛋白质水平(右侧面板,比较标记为箭头在里面车道4具有车道3)然而,总蛋白水平没有太大差异(左侧面板,比较车道1和2). 我们注意到只有一条与过度表达DsRed的大小相对应的带没有明显变化(虚线箭头). 我们的数据表明,与表达WT RPS10的细胞相比,表达突变RPS10细胞中新蛋白的生物生成较慢。
RPS10甲基化突变体与WT RPS10相比不稳定
核糖体蛋白高水平表达,不同的未组装核糖体蛋白质在核质中被降解(37). 我们注意到外源性表达的RPS10-R158K/R160K的水平始终低于WT RPS10(补充图S2和4C类). 这使我们研究了RPS10甲基化与其稳定性之间的关系。将WT RPS10和不同数量的RPS10-R158K/R160K与EGFP表达载体共转染293细胞。如所示A类WT RPS10的表达水平远高于突变体。EGFP显示,尽管转染的突变体数量增加了3倍,但突变体的表达量更低,转染效率更高(A类). 为了测试快速降解是否可以解释突变RPS10蛋白CHX(一种从头开始蛋白质合成)脉冲相实验。如所示B类,RPS10水平在CHX存在时下降。然而,我们发现RPS10-R158K/R160K突变体更加不稳定(通过ImageJ软件分析,RPS10-R158K/R160K的半衰期为~5小时,而WT RPS10的半衰周期约为8小时)。据报道,CHX处理会影响核糖体组装和亚单位的稳定性,因此我们使用[35S] WT RPS10和RPS10-R158K/R160K突变体定量免疫沉淀的蛋氨酸脉冲相分析,以PRMT5为对照。如所示D类,RPS10-R158K/R160K突变体的稳定性明显低于WT RPS10。
RPS10甲基化突变体不如WT RPS10稳定。 A类,RPS10甲基化突变体的表达远低于WT RPS10。用FLAG标记转染HEK293细胞RPS10型,或不同数量的RPS10型-R158K/R160K,以及1μg pCMS。表皮生长因子。36小时后,使用抗FLAG抗体通过Western blotting检测RPS10的表达。以抗GFP抗体作为转染效率的对照,对印迹进行再验证。B类和C类,RPS10甲基化突变更不稳定,可以通过蛋白酶体抑制剂稳定。用FLAG标记转染HEK293细胞RPS10型或RPS10型-158K兰特/160K兰特。36小时后,用100μ米环己酰亚胺(瑞士法郎)或10μ米如图所示,在不同的时间点收集MG132和细胞。使用RPS10抗血清通过Western blotting测定RPS10的表达水平。以β-微管蛋白作为负荷对照,对印迹进行再表达。D类,用WT转染HEK293细胞RPS10型-FLAG或RPS10型-R158K/R160K-FLAG和FLAG-PRMT5项目。脉冲相位实验通过标记[35S] 甲硫氨酸处理1h,随后用含有非放射性甲硫氨酸的培养基在细胞溶解前进行追踪。用抗FLAG珠免疫沉淀WT和突变RPS10和PRMT5蛋白。35用FLA-3000荧光成像仪分析S标记的RPS10-FLAG,并以FLAG-PRMT5作为对照。E类,RPS10甲基化突变易于通过蛋白酶体途径降解。HEK293细胞与对照载体共转染(车道1和4),RPS10型-旗帜(车道2和三),或RPS10型-158K兰特/160K兰特(车道5和6)与Myc-tagged泛素一起。转染后36小时,用MG132处理细胞(车道4–6)如图所示。使用抗FLAG珠免疫沉淀FLAG标记的RPS10,然后进行SDS-PAGE和免疫印迹(IB公司)用抗Myc抗血清检测泛素化RPS10或RPS10-R158K/R160K。用抗FLAG抗血清重复印迹,检测RPS10和RPS10-R158R/K160K。
许多核糖体蛋白质以蛋白酶体依赖的方式降解(37). 为了确定RPS10是否也通过蛋白酶体途径降解,我们分析了蛋白酶体抑制剂MG132对RPS10降解的影响。如所示C类MG132存在时,WT RPS10和RPS10-R158K/R160K均迅速积累。为了进一步研究RPS10的表达是否受到泛素化的调控RPS10型甲基化突变体与Myc-tagged泛素共同转染HEK293细胞。免疫沉淀RPS10并分析其泛素化水平。我们检测到RPS10以上的高分子量涂片,经MG132治疗后其强度显著增强(E类,车道2与车道5). RPS10甲基化突变的泛素化比WT更明显RPS10型尤其是在MG132在场的情况下(E类,车道5与车道6). 总之,我们的结果表明RPS10甲基化突变不太稳定,容易通过蛋白酶体途径降解。
RPS10的甲基化是其在核苷酸GC区富集所必需的
核糖体的生物发生发生在核仁中,核仁是细胞核内的一个专门的隔室。每个核仁包含三种形态上不同的成分,反映了核糖体的生成过程。前rRNA的合成、修饰和初始裂解发生在纤维组分和周围致密纤维组分内,而核糖体的后期加工步骤和组装则发生在GC区域内(38).
我们通过免疫染色确定了RPS10在Bel7402永久性细胞系(稳定表达RPS10-Myc)中的定位,并期望它像其他核糖体蛋白一样定位在核仁中(39).RPS10型-Myc定位于细胞核中,主要聚集在与核仁相对应的结构中(补充图S3). 还发现了较弱的弥漫性细胞质染色。RPS10在稳定细胞系中的环状亚细胞定位与NPM/B23(核仁GC区的一个众所周知的标记)相对应,并且与瞬时转染细胞中融合到GFP的RPS10非常相似(补充图S4和数据未显示)。这使我们通过联合转染来测试RPS10是否集中在核仁的GC区域B23型无论是哪一种RPS10型或RPS10-R158K/R160K型进入U2OS单元。我们发现57%的WT RPS10主要与B23共定位,表明RPS10集中在GC区域(,A类和E类). 令我们惊讶的是,在任何细胞中都没有发现RPS10-R158K/R160K与B23的共定位。相反,它的信号在核仁区域而不是GC区域内增强(,B类和E类). 为了进一步定义RPS10的位置,重量RPS10和RPS10-R158K型/16万兰特与共转染纤维素酶分别进行。如所示,C类和D类,突变体RPS10,而不是WT RPS10与纤维素酶这些结果表明RPS10在核仁的GC区富集,RPS10的甲基化是其在核仁GC区富集所必需的。
RPS10的甲基化是其在核仁GC区的浓度所必需的。 A类和B类WT RPS10和RPS10甲基化突变体的亚核定位差异。RPS10型-GFP公司(A类)和RPS10型-R158K/R160K-GFP(B类)与B23-DsRed共转染U2OS细胞,24小时后固定。RPS10型(绿色)和B23(红色)共聚焦显微镜下观察。指示区域的高放大率(正方形)显示在底部。酒吧,5微米。这个图对应于以任意单位表示的强度绿色和红色中通过轴绘制的线的每个像素的标签A类和B类分别是。C类和D类,RPS10型-GFP公司(C类),RPS10型-R158K/R160K-GFP(D类)、和纤维素酶-DsRed被转染并分析为A类和B.工程WT RPS10和甲基化突变在核仁中的不同分布。GFP标记RPS10型和RPS10型-R158K/R160K与B23-DsRed或纤维素酶-DsRed进入U2OS细胞,24小时后固定,观察如下A类和C类RPS10被归类为与B23共定位时的GC区域定位或致密纤维成分(贴现现金流)/纤维成分(常设费用)与共同本地化时纤维蛋白每个类别分析100个细胞。F类,更多RPS10型-R158K/R160K倾向于留在细胞核中。用FLAG标记的WT或甲基化突变体RPS10转染HEK293细胞。转染24h后,分离细胞质和细胞核成分。总裂解物中RPS10的WT和突变形式(T型),胞质溶胶(C类)、和核能(N个)用抗FLAG抗体进行Western blot分析。Lamin B和GAPDH分别用作核和细胞质组分的标记。
由于RPS10的甲基化是其在核仁GC区的浓度所必需的,并且在RPS10组装成核糖体中发挥作用,我们继续研究RPS10在整个细胞中的分布,特别是其向胞浆的输出是否受到甲基化的影响。重量RPS10型和RPS10-R158K型/1.6万兰特转染HEK293细胞。48小时后分离并分析细胞核和细胞质部分。使用拉明B作为标记,F类表明核部分中存在更多RPS10-R158K/R160K突变。因此,我们的研究结果表明,RPS10的甲基化在其在核仁GC区的位置中发挥作用,也可能在其从细胞核到胞质溶胶的运输中发挥作用。
RPS10甲基化突变体与B23的结合降低
B23/NPM,也称为Numatrin1,在核糖体的加工和/或组装中起着关键作用(40). B23的伴侣性质可能是这一过程的关键,因为它可以防止蛋白质聚集,并选择性地储存核糖体蛋白质的子集以促进核糖体的生物生成(41,45). RPS10与B23的共同定位使我们确定RPS10是否与B23相互作用。利用标记物转染细胞的裂解物进行双向免疫共沉淀分析B23型和/或RPS10型进行并确认RPS10和B23之间的特定相互作用(,A类和B类). 为了评估内源性RPS10和B23是否相互作用,对HEK293细胞裂解物进行免疫共沉淀和免疫印迹(Western blotting)以及RPS10与B23抗血清。免疫沉淀物分析显示内源性蛋白之间有明显的相互作用(C类). 为了确定B23和RPS10之间的相互作用是直接的还是间接的,GST下拉分析使用B23和RP S10从大肠杆菌被雇佣。如所示D类GST-B23(而非GST)可以下拉His-tagged RPS10,表明RPS10与B23直接交互。
RPS10甲基化突变体与B23的结合减少。 A类和B类,RPS10与B23交互体内用FLAG或Myc-tagged转染HEK293细胞RPS10型和B23型如图所示。24小时后,用抗FLAG珠免疫沉淀细胞裂解物,并分析免疫复合物的Myc-tagged RPS10或B23。C类内源性B23和RPS10相互作用。抗RPS10小鼠血清用于免疫沉淀(IP(IP))以小鼠IgG作为对照,从HEK293细胞提取物中提取B23。细胞裂解(下部面板)和免疫复合物(上部面板)分别探测内源性B23和RPS10。D类,RPS10与B23交互在体外表达GST、GST-B23融合蛋白和His-RPS10用于结合分析,纯化自大肠杆菌相互孵化。分别用GST和His抗血清检测GST、GST-B23和His-RPS10。E类,RPS10甲基化突变体与B23的结合减少。用FLAG标记的B23和Myc-tagged基因转染HEK293细胞RPS10型或RPS10型-R158R/K160K。金额RPS10型-用于转染的R158K/R160K加倍,使其表达水平与WT RPS10相似。24小时后,分析细胞裂解物中标记蛋白的表达(下部面板). 用抗FLAG抗体免疫沉淀剩余部分的裂解物,并用抗Myc抗体分析RPS10或RPS10-R158K/R160K的免疫复合物。F类RPS10甲基化突变体与内源性B23的结合减少。带有Myc标记的HEK293细胞RPS10型或RPS10型-158K兰特/160K兰特。RPS10-R158K/R160K的用量增加了三倍。用抗B23抗体免疫沉淀细胞裂解物,并分析RPS10或RPS10-R158K/R160K与抗Myc抗体和B23与抗B23血清的免疫复合物。
我们在上文中表明,大多数WT RPS10与B23在核仁中共定位,RPS10甲基化突变体没有这样做。因此,我们使用共免疫沉淀分析来研究B23与WT和RPS10的甲基化突变之间的相互作用是否存在差异。值得注意的是,RPS10-R158K/R160K与过度表达或内源性B23之间的相互作用弱于WT RPS10与过度表达的或内源性的B23之间(,E类和F类). 综上所述,这些结果表明RPS10是一种新的B23结合蛋白,RPS10的甲基化突变导致与B23的结合减少,因此可以解释为什么RPS10甲基化突变未能在核仁GC区与B23/NPM共存。