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    Vdac1型依赖电压的阴离子通道1[褐家鼠(挪威鼠)]

    基因ID:83529,更新日期2024年5月2日

    总结

    官方符号
    Vdac1型由提供RGD公司
    官方全名
    依赖电压的阴离子通道1由提供RGD公司
    主要来源
    RGD:621575
    请参阅相关
    恩森布尔:ENSRNOG00000006375 联盟基因组:RGD:621575
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    临时的
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;大鼠
    总结
    启用电压门控阴离子通道活动。参与线粒体钙离子跨膜转运。位于线粒体外膜和突触小泡。蛋白质复合物的一部分。用于研究视觉癫痫。该基因的人类同源基因与前列腺癌有关。与人类VDAC1同源(电压依赖性阴离子通道1)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    肌肉(RPKM 4256.8)、心脏(RPKM3059.3)和7种其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新的
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    请参阅中的Vdac1基因组数据查看器
    地点:
    22年第10季度
    外显子计数:
    10
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02版本 现在的 GRCr8级(GCF_036323735.1号) 10 NC_086028.1(37029377..37060542)
    RS_2023_06号 上一个程序集 额定BN7.2(GCF_015227675.2号) 10 NC_051345.1(36532306..36559642)
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(GCF_ 000001895.5) 10 NC_005109.4(37724915..37752827)

    10号染色体-NC_086028.1描述相邻基因的基因组上下文 Neighboring gene small nucleolar RNA SNORA42/SNORA80 family Neighboring gene S-phase kinase-associated protein 1 Neighboring gene transcription factor 7 Neighboring gene similar to human chromosome 5 open reading frame 15 Neighboring gene cytochrome b-c1 complex subunit 10-like Neighboring gene uncharacterized LOC102548512

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述:从Fischer 344大鼠的11个器官(肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本,这些器官来自四个发育阶段(2周、6周、21周和104周龄)的两性
    • 生物项目:项目编号:238328
    • 出版物:PMID 24510058
    • 分析日期:2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 RGD提供

    功能 证据代码 酒吧
    激活钙通道 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
     
    启用神经酰胺绑定 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    能够结合胆固醇 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    实现相同的蛋白质结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    启用单原子阴离子通道活性 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    使核苷酸结合 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    能够结合氧甾醇 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    能够结合氧甾醇 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使氧化甾醇结合 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    使磷脂酰胆碱结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    启用孔蛋白活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    使蛋白激酶结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    实现含蛋白复合物结合 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    实现跨膜转运蛋白结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    启用电压门控通道活动 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    实现电压门控单原子阴离子通道活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    实现电压门控单原子阴离子通道活性 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    实现电压门控单原子阴离子通道活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    实现电压门控单原子阴离子通道活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    实现电压门控单原子阴离子通道活性 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    过程 证据代码 酒吧
    参与凋亡过程 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与凋亡过程 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与凋亡过程 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与行为恐惧反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    行为恐惧反应中的上游行为 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    钙导入线粒体的参与 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或化学突触传递内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与上皮细胞分化 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与学习 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    行为_上游_或学习中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与线粒体钙离子跨膜转运 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与单原子阴离子跨膜转运 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与单原子阴离子转运 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞凋亡过程的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与钙离子导入线粒体的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与活性氧代谢过程的负调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与活性氧代谢过程的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经元突触传递 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    神经元突触传递中的上游动作 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    parkin介导的线粒体去极化刺激促有丝分裂的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与有丝分裂的调节 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与有丝分裂的调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    组件 证据代码 酒吧
    定位膜 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位膜 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    定位膜筏 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于线粒体膜 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于线粒体核小体中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    线粒体外膜is_active 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    定位于线粒体外膜 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于线粒体外膜 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于线粒体外膜 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于线粒体外膜 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
     
    线粒体通透性转换孔复合体的一部分 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    线粒体通透性转换孔复合体的一部分 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    位于线粒体内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于质膜 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于质膜 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于质膜 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    部分孔隙复合体 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    突触后密度膜is_active 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    突触前活动区膜中的is_active 经验
    根据实验推断
    更多信息
    公共医学 
    突触前活动区膜中的is_active 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    蛋白质复合物的一部分 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于突触 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于突触小泡 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 

    一般蛋白质信息

    首选名称
    电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1
    姓名
    VDAC-1型
    线粒体外膜蛋白孔蛋白1
    rVDAC1型

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新的 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_031353.3号NP_112643.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1

      参见NP_112643.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:暂定

      源序列
      日本宇宙航空研究开发委员会Z010000010
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A1L125型,Q3MHT8型,Q5M944问题,Q5M972问题,Q6IN28号机组,问题6P9W9,第9季度第2季度
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A8I6GGP1号机组,A6HEA9型
      相关的
      ENSRNOP00000008477.4,ENSRNOT00000008477.6号
      保守领域(1)总结
      cd07306
      地点:4282
      Porin3_VDAC;线粒体外膜的电压依赖性阴离子通道

    注释基因组的参考序列:GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086028.1参考GRCr8

      范围
      37029377.37060542
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_063269962.1号XP_063126032.1号电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型X2

    2. XM_063269961.1号时间:0663126031.1电压依赖性阴离子选择性通道蛋白1亚型X1