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    Plxnb2型丛蛋白B2[褐家鼠(挪威鼠)]

    基因ID:315217,更新日期2024年4月11日

    总结

    官方符号
    Plxnb2型由提供RGD公司
    官方全名
    丛蛋白B2由提供RGD公司
    主要来源
    RGD:1305495号
    请参阅相关
    恩森布尔:ENSRNOG00000007133 联盟基因组:RGD:1305495
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    临时的
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;大鼠
    总结
    预计可激活信号素受体活性。预计参与几个过程,包括通过质膜粘附分子的嗜同性细胞粘附;神经系统发育;和调节细胞蛋白代谢过程。预计是语义素受体复合体的一部分。预计是质膜的组成部分。与人PLXNB2同源(丛蛋白B2)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    肾脏(RPKM 193.0)、肝脏(RPKM141.6)和9个其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    参见中的Plxnb2基因组数据查看器
    位置:
    第7季度34
    外显子计数:
    46
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCr8级(GCF_036323735.1号) 7 NC_086025.1(122111917..122138201,补遗)
    RS_2023_06号 上一个程序集 额定BN7.2(GCF_015227675.2号) 7 NC_051342.1(120232276..120258385,补体)
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(GCF_ 000001895.5) 7 NC_005106.4(130135484..130161568,补遗)

    7号染色体-NC_086025.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene mitogen-activated protein kinase 12 Neighboring gene uncharacterized LOC108351526 Neighboring gene mitogen-activated protein kinase 11 Neighboring gene microRNA 349 Neighboring gene DENN domain containing 6B Neighboring gene protein phosphatase 6, regulatory subunit 2

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述:从Fischer 344大鼠的11个器官(肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本,这些器官来自于四个发育阶段(2-、6-、21-和104周龄)的雌雄大鼠
    • 生物项目:项目编号:238328
    • 出版物:PMID 24510058
    • 分析日期:2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 RGD提供

    功能 证据代码 酒吧
    启用信号素受体活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    启用信号素受体活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    过程 证据代码 酒吧
    参与大脑发育 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与兴奋性突触装配 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    通过质膜粘附分子参与嗜同性细胞粘附 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞粘附的负调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    涉及神经管闭合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与成神经细胞增殖 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与轴突发生的正调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or在轴突发生的正调控中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经元投射发育的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与翻译的积极调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与GTPase活性的调节 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与细胞迁移的调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与细胞形状的调节 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与细胞形状的调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经元迁移的调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质磷酸化的调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与信号转导通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    组件 证据代码 酒吧
    血浆中的is_active 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    定位于质膜 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    部分信号素受体复合物 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组学

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001108106.1号NP_001101576.1号丛蛋白B2前体

      参见NP_001101576.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:暂定

      源序列
      电话474027
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型,第三季度第57季度
      保守领域(7)总结
      cd01179号
      位置:898984
      IPT_plexin_repeat2;Plexins和细胞表面受体(PCSR)IPT结构域的第二个重复序列。Plexins参与细胞增殖、细胞粘附和排斥受体的调节。通常,存在三个IPT域副本。。。
      cd01180号
      位置:806897
      IPT_plexin_repeat1;Plexins和细胞表面受体(PCSR)IPT结构域的第一个重复。Plexins参与细胞增殖、细胞粘附和排斥受体的调节。通常,存在三个IPT域副本。。。
      pfam01437型
      位置:471519
      PSI;Plexin重复
      pfam08337型
      位置:12741808
      Plexin_cytopl;Plexin细胞质RasGAP结构域
      pfam17960型
      位置:528615
      TIG_plexin;TIG域
      第15674条
      位置:9861068
      IPT;免疫球蛋白样折叠,丛蛋白,转录因子(IPT)。IPT也称为转录因子免疫球蛋白(TIG)域。它们存在于细胞内转录因子、细胞表面受体(如丛蛋白和散射因子。。。
      第15693条
      位置:27469
      塞马;语义蛋白和丛蛋白的蛋白质相互作用模块Sema域

    注释基因组的参考序列:GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086025.1参考GRCr8

      范围
      122111917..122138201补码
      下载
      发电厂银行,美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. 圣诞节_063263640.1XP_063119710.1型丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型
    2. XM_006242202.4号XP_006242264.1号丛蛋白B2亚型X1

      参见XP_006242264.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型,D3ZQ57号
      相关的
      ENSRNOP00000072434.1公司
      保守领域(7)总结
      cd01179号
      位置:898984
      IPT_plexin_repeat2;Plexins和细胞表面受体(PCSR)IPT结构域的第二个重复序列。Plexins参与细胞增殖、细胞粘附和排斥受体的调节。通常,存在三个IPT域副本。。。
      cd01180号
      位置:806897
      IPT_plexin_repeat1;Plexins和细胞表面受体(PCSR)IPT结构域的第一个重复。Plexins参与细胞增殖、细胞粘附和排斥受体的调节。通常,存在三个IPT域副本。。。
      pfam01437型
      位置:471519
      PSI;Plexin重复
      pfam08337型
      位置:12741808
      Plexin_cytopl;Plexin细胞质RasGAP结构域
      pfam17960型
      位置:528615
      TIG_plexin;TIG域
      第15674条
      位置:9861068
      IPT;免疫球蛋白样折叠,丛蛋白,转录因子(IPT)。IPT也称为转录因子免疫球蛋白(TIG)域。它们存在于细胞内转录因子、细胞表面受体(如丛蛋白和散射因子。。。
      第15693条
      位置:27469
      塞马;语义蛋白和丛蛋白的蛋白质相互作用模块Sema域
    3. XM_008765727.3号XP_008763949.1号丛蛋白B2亚型X1

      参见XP_008763949.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型,D3ZQ57号
      保守领域(7)总结
      cd01179号
      位置:898984
      IPT_plexin_repeat2;Plexins和细胞表面受体(PCSR)IPT结构域的第二个重复序列。Plexins参与细胞增殖、细胞粘附和排斥受体的调节。通常,存在三个IPT域副本。。。
      cd01180号
      位置:806897
      IPT_plexin_repeat1;Plexins和细胞表面受体(PCSR)IPT结构域的第一个重复。Plexins参与细胞增殖、细胞粘附和排斥受体的调节。通常,存在三个IPT域副本。。。
      pfam01437型
      位置:471519
      PSI;Plexin重复
      pfam08337型
      位置:12741808
      Plexin_cytopl;Plexin细胞质RasGAP结构域
      pfam17960型
      位置:528615
      TIG_plexin;TIG域
      第15674条
      位置:9861068
      IPT;免疫球蛋白样折叠,丛蛋白,转录因子(IPT)。IPT也称为转录因子免疫球蛋白(TIG)域。它们存在于细胞内转录因子、细胞表面受体(如丛蛋白和散射因子。。。
      第15693条
      位置:27469
      塞马;语义蛋白和丛蛋白的蛋白质相互作用模块Sema域
    4. XM_006242207.4号XP_006242269.1号丛蛋白B2亚型X1

      参见XP_006242269.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型,D3ZQ57号
      保守领域(7)总结
      cd01179号
      位置:898984
      IPT_plexin_repeat2;Plexins和细胞表面受体(PCSR)IPT结构域的第二个重复序列。Plexins参与细胞增殖、细胞粘附和排斥受体的调节。通常,存在三个IPT域副本。。。
      cd01180号
      位置:806897
      IPT_plexin_repeat1;Plexins和细胞表面受体(PCSR)IPT结构域的第一个重复。Plexins参与细胞增殖、细胞粘附和排斥受体的调节。通常,存在三个IPT域副本。。。
      pfam01437型
      位置:471519
      PSI;Plexin重复
      pfam08337型
      位置:12741808
      Plexin_cytopl;Plexin细胞质RasGAP结构域
      pfam17960型
      位置:528615
      TIG_plexin;TIG域
      第15674条
      位置:9861068
      IPT;免疫球蛋白样折叠,丛蛋白,转录因子(IPT)。IPT也称为转录因子免疫球蛋白(TIG)域。它们存在于细胞内转录因子、细胞表面受体(如丛蛋白和散射因子。。。
      第15693条
      位置:27469
      塞马;语义蛋白和丛蛋白的蛋白质相互作用模块Sema域
    5. 圣诞节_063263643.1XP_063119713.1号丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型
    6. XM_063263645.1号XP_063119715.1号丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      a0a0g2k2年9,A6K7K6型
    7. XM_039079305.2号XP_038935233.1号丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型,D3ZQ57号
      保守领域(7)总结
      cd01179号
      位置:898984
      IPT_plexin_repeat2;Plexins和细胞表面受体(PCSR)IPT结构域的第二个重复序列。Plexins参与细胞增殖、细胞粘附和排斥受体的调节。通常,存在三个IPT域副本。。。
      cd01180号
      位置:806897
      IPT_plexin_repeat1;Plexins和细胞表面受体(PCSR)IPT结构域的第一个重复。Plexins参与细胞增殖、细胞粘附和排斥受体的调节。通常,存在三个IPT域副本。。。
      pfam01437型
      位置:471519
      PSI;Plexin重复
      pfam08337型
      位置:12741808
      Plexin_cytopl;Plexin细胞质RasGAP结构域
      pfam17960型
      位置:528615
      TIG_plexin;TIG域
      第15674条
      位置:9861068
      IPT;免疫球蛋白样折叠,丛蛋白,转录因子(IPT)。IPT也称为转录因子免疫球蛋白(TIG)域。它们存在于细胞内转录因子、细胞表面受体(如丛蛋白和散射因子。。。
      第15693条
      位置:27469
      塞马;语义蛋白和丛蛋白的蛋白质相互作用模块Sema域
    8. XM_008765729.3号XP_008763951.1号丛蛋白B2亚型X1

      参见XP_008763951.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型,D3ZQ57号
      保守领域(7)总结
      cd01179号
      位置:898984
      IPT_plexin_repeat2;Plexins和细胞表面受体(PCSR)IPT结构域的第二个重复序列。Plexins参与细胞增殖、细胞粘附和排斥受体的调节。通常,存在三个IPT域副本。。。
      cd01180号
      位置:806897
      IPT_plexin_repeat1;Plexins和细胞表面受体(PCSR)IPT结构域的第一个重复。Plexins参与细胞增殖、细胞粘附和排斥受体的调节。通常,存在三个IPT域副本。。。
      pfam01437型
      位置:471519
      PSI;Plexin重复
      pfam08337型
      位置:12741808
      Plexin_cytopl;Plexin细胞质RasGAP结构域
      pfam17960型
      位置:528615
      TIG_plexin;TIG域
      第15674条
      位置:9861068
      IPT;免疫球蛋白样折叠,丛蛋白,转录因子(IPT)。IPT也称为转录因子免疫球蛋白(TIG)域。它们存在于细胞内转录因子、细胞表面受体(如丛蛋白和散射因子。。。
      第15693条
      位置:27469
      塞马;语义蛋白和丛蛋白的蛋白质相互作用模块Sema域
    9. XM_063263644.1号XP_063119714.1号丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型
    10. XM_063263652.1号XP_063119722.1号丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型
    11. XM_063263651.1号XP_063119721.1号丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      a0a0g2k2年9,A6K7K6型
    12. XM_063263646.1号时间:0663119716.1丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型
    13. XM_063263641.1号XP_063119711.1号丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,6千7千克6
    14. XM_063263638.1号XP_063119708.1号丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型
    15. XM_063263650.1号XP_063119720.1型丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型
    16. XM_063263649.1号XP_063119719.1号丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型
    17. XM_063263647.1号XP_063119717.1号丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型
    18. XM_063263642.1号XP_063119712.1号丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型
    19. XM_063263648.1号XP_063119718.1号丛蛋白B2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K2Y9型,A6K7K6型