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    Egln2号机组egl-9家族低氧诱导因子2[褐家鼠（挪威鼠）]

    基因ID:308457，更新日期2024年5月2日

    总结

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    官方符号
    Egln2号机组由提供RGD公司
    官方全名
    egl-9家族低氧诱导因子2由提供RGD公司
    主要来源
    RGD:631376
    请参阅相关
    乐团：ENSRNOG00000020947 联盟基因组：RGD:631376
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    临时的
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；肌形态；鼠形目；鼠科；穆里奈；大鼠
    也称为
    PHD1；HPH-1；HPH-3；PHD-1；HIF-PH1型
    总结
    启用肽基脯氨酸4-双加氧酶活性。参与肽基-脯氨酸羟基化为4-羟基-L-脯氨酸。预计位于核质中。预计在细胞质和细胞核中活跃。该基因的人类同源基因与肾细胞癌有关。与人EGLN2同源（egl-9家族缺氧诱导因子2）。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
    表达式
    肌肉（RPKM 213.7）、睾丸（RPKM198.0）和9个其他组织中的偏倚表达查看更多信息
    直系同源
    人类 鼠标 全部的
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

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    参见中的Egln2基因组数据查看器
    位置：
    第1季度21
    外显子计数：
    8
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCr8级(GCF_036323735.1号) 1 NC_086019.1（91579205..91586985，补遗）
    RS_2023_06号 上一个程序集 额定BN7.2(GCF_015227675.2号) 1 NC_051336.1（82451554..82459809，补码）
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(总金额000001895.5) 1 NC_005100.4（83969456..83977665，补体）

    染色体1-NC_086019.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene phosphoglycerate kinase 1, pseudogene 6 Neighboring gene cytochrome P450, family 2, subfamily f, polypeptide 4 Neighboring gene cytochrome P450, family 2, subfamily t, polypeptide 1 Neighboring gene RAB4B, member RAS oncogene family Neighboring gene MIA SH3 domain containing

    基因组区域、转录物和产物

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    表达式

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    • 项目名称：跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述：从Fischer 344大鼠的11个器官（肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫）中分离出320个RNA样本，这些器官来自于四个发育阶段（2-、6-、21-和104周龄）的雌雄大鼠
    • 生物项目：项目编号：238328
    • 出版物：PMID 24510058
    • 分析日期：2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

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    PubMed中的相关文章

    1. 低强度激光治疗减轻慢性收缩损伤大鼠的神经病理性疼痛并促进功能恢复：可能与低氧诱导因子1α（HIF-1α）有关。 谢永林，等《计算机神经学杂志》，2012年9月1日。PMID 22351621号
    2. 缺氧诱导因子1将大鼠快速模式肌肉活动和快速肌肉表型联系起来。 隆德IG，等《生理学杂志》，2011年3月15日。PMID 21262877，免费PMC文章
    3. 通过缺氧保护右心室免受缺血和再灌注。 Wasserfuhr D垫圈，等Naunyn Schmiedebergs Arch Pharmacol，2008年7月，PMID 18488199
    4. 大鼠HIF-1α-脯氨酰-4-羟化酶-1基因的克隆和鉴定。 科布RR，等蛋白质实验纯化，2005年8月，PMID 15925519
    5. LncRNA MIAT通过与EGLN2相互作用增强大鼠模型脑缺血/再灌注损伤并减少其泛素介导的降解。 李斯，等《细胞分子医学杂志》，2021年11月，PMID 34687132，免费PMC文章

    查看PubMed中的所有（24）引文

    GeneRIFs：功能的基因引用

    什么是GeneRIF？
    1. LncRNA MIAT通过与EGLN2相互作用增强大鼠模型脑缺血/再灌注损伤并减少其泛素介导的降解。
      标题：LncRNA MIAT通过与EGLN2相互作用增强大鼠模型脑缺血/再灌注损伤并减少其泛素介导的降解。
    2. 在高糖缺氧条件下，HIF-1α和FoxO3a的联合作用导致BNIP3表达增强，导致心肌细胞死亡
      标题：高血糖缺血条件下HIF-1α和FoxO3a的协同作用触发心肌细胞凋亡。
    3. 总之，低强度激光可以调节神经卡压性神经病中HIF-1α的活性
      标题：低强度激光治疗缓解慢性收缩损伤大鼠的神经病理性疼痛并促进功能恢复：可能涉及低氧诱导因子1α（HIF-1α）。
    4. 成年大鼠体细胞基因转移后14天HIF-1α过表达，肌肉纤维中观察到缓慢到快速的转化。
      标题：低氧诱导因子1与大鼠快速模式肌肉活动和快速肌肉表型相关。
    5. 报告显示，老年大鼠脑中脯氨酰4-羟化酶表达增加，低氧诱导因子的差异调节。
      标题：老年大鼠脑中脯氨酰4-羟化酶表达增加和低氧诱导因子的差异调节。
    6. HIF-1α可能参与缺氧对右心室缺血/再灌注损伤的保护作用
      标题：通过缺氧保护右心室免受缺血和再灌注。
    7. mTOR依赖性HIF-1α合成的增加和羟化酶依赖性HIF-1α降解的减少有助于间歇性缺氧诱导的HIF-1α积累。
      标题：间歇性缺氧诱导HIF-1α表达：NADPH氧化酶、Ca2+信号、脯氨酸羟化酶和mTOR的参与。
    8. 确定了大鼠体内脯氨酰羟化酶的三种形式，并证明缺氧一段时间可选择性增加PHD-2 mRNAs水平的表达
      标题：缺氧上调脯氨酰羟化酶活性：一种限制HIF-1在复氧过程中反应的反馈机制。
    提交： 新GenerRIF 更正

    PubChem的途径

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    一般基因信息

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    标记

    同源性

    克隆名称

    • MGC93662、MGC9366

    基因本体论 RGD提供

    功能 证据代码 酒吧
    使2-氧戊二酸依赖性加氧酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    能够结合L-抗坏血酸 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    激活双氧酶活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    启用铁质粘合 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    启用铁质粘合 国际标准化组织
    从序列正交推断
    更多信息
    		  
    启用铁质粘合 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
    		  
    激活低氧诱导的因子-脯氨酸双加氧酶活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    实现铁离子结合 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    激活氧化还原酶活性，作用于成对供体，结合或还原分子氧 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    启用氧传感器活动 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    激活肽基脯氨酸4-双加氧酶活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    激活肽基脯氨酸4-双加氧酶活性 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		 公共医学 
    激活肽基脯氨酸4-双加氧酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    过程 证据代码 酒吧
    参与细胞氧化还原稳态 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    参与细胞缺氧反应 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    参与肽基-脯氨酸羟基化合成4-羟基-L-脯氨酸 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    参与蛋白质分解代谢过程的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    参与神经元凋亡过程的调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    参与神经元凋亡过程的调控 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
    		  
    参与缺氧反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    组件 证据代码 酒吧
    细胞质中有活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    核质定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    在核心中是活动的 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    位于核内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    位于核内 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
    		  

    一般蛋白质信息

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    首选名称
    脯氨酰羟化酶EGLN2
    姓名
    HIF-1α-脯氨酸-4-羟化酶-1
    HIF-脯氨酰羟化酶1
    缺氧诱导因子脯氨酰羟化酶1
    脯氨酰羟化酶结构域蛋白1
    NP_001004083.1号
    XP_038967457.1号
    XP_038967464.1号

    NCBI参考序列（RefSeq）

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    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001004083.1号→NP_001004083.1号脯氨酰羟化酶EGLN2

      参见NP_001004083.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态：暂定

      源序列
      BC078907号
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q6AYU4号机组
      保守领域（1）总结
      智能00702
      位置：213→383
      P4Hc；脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物

    注释基因组的参考序列：GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086019.1参考GRCr8

      范围
      91579205..91586985补码
      下载
      GenBank（基因银行）,法斯塔,序列查看器（图形）

    mRNA和蛋白质

    1. XM_039111529.2号→XP_038967457.1号脯氨酰羟化酶EGLN2亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A8I5ZS56型
      相关的
      ENSRNOP00000081509.1公司
      保守领域（1）总结
      智能00702
      位置：329→438
      P4Hc；脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物

    2. XM_039111536.1号→XP_038967464.1号脯氨酰羟化酶EGLN2亚型X2

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A6J9B3型
      保守领域（1）总结
      智能00702
      位置：三→97
      P4Hc；脯氨酸4-羟化酶α亚基同源物
    核苷酸 蛋白质 应变
    标题 访问和版本
    蛋白质接入 链接
    GenPept链接 UniProtKB链接
    Q6AYU4.1问题 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q6AYU4

    基因链接输出

    以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

    化学信息
    分子生物学数据库
    研究材料
    工具
    其他