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    Atm公司ATM丝氨酸/苏氨酸激酶[褐家鼠(挪威鼠)]

    基因ID:300711,更新日期2024年5月2日

    总结

    官方符号
    Atm公司由提供RGD公司
    官方全名
    ATM丝氨酸/苏氨酸激酶由提供RGD公司
    主要来源
    注册编号:1593265
    请参阅相关
    乐团:ENSRNOG00000029773 联盟基因组:RGD:1593265
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    临时的
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;Euarchontoglires语;闪光;啮齿动物;变形肌;鼠形目;鼠科;穆里奈;大鼠
    总结
    预计能够实现相同的蛋白质结合活性;磷酸转移酶活性,醇基为受体;和蛋白质N末端结合活性。参与多种过程,包括神经元凋亡过程的正调控;氮化合物代谢过程的正调控;以及调节小胶质细胞的活化。位于细胞质和细胞核中。用于研究共济失调毛细血管扩张症;细胞增殖病;不育;白血病;和淋巴瘤。恶性肿瘤前期和癫痫持续状态的生物标志物。该基因的人类同源基因与多种疾病有关,包括结直肠癌;子宫内膜癌;肺癌(多发);神经退行性疾病(多发性);老年性白内障。与人类ATM同源(ATM丝氨酸/苏氨酸激酶)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    脾脏(RPKM 259.9)、胸腺(RPKM189.4)和9个其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    请参阅中的Atm基因组数据查看器
    位置:
    24年第8季度
    外显子计数:
    67
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCr8级(GCF_036323735.1号) 8 NC_086026.1(62724939.62829040,补码)
    RS_2023_06号 上一个程序集 额定BN7.2(GCF_015227675.2号) 8 NC_051343.1(53828741..53932773,补码)
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(GCF_ 000001895.5) 8 NC_005107.4(58015938..58119973,补遗)

    8号染色体-NC_086026.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene protein O-glucosyltransferase 3 Neighboring gene similar to human chromosome 11 open reading frame 65 Neighboring gene uncharacterized LOC120094159 Neighboring gene nuclear protein, co-activator of histone transcription Neighboring gene 60S ribosomal protein L17 pseudogene Neighboring gene acetyl-CoA acetyltransferase 1

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述:从Fischer 344大鼠的11个器官(肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本,这些器官来自于四个发育阶段(2-、6-、21-和104周龄)的雌雄大鼠
    • 生物项目:项目编号:238328
    • 出版物:PMID 24510058
    • 分析日期:2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 综合体 来源 酒吧 说明

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 RGD提供

    过程 证据代码 酒吧
    参与DNA损伤检查点信号 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_within DNA损伤检查点信号 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与DNA损伤检查点信号 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与DNA损伤反应 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与DNA损伤反应 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or_within DNA损伤响应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与DNA损伤反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与DNA双链断裂处理 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_in-DNA修复 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_within V(D)J复合 国际标准化组织
    从序列正交推断
    更多信息
     
    大脑发育中的上游活动 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    涉及细胞对X射线的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞对γ辐射的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞对电离辐射的反应 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞对亚硝化应激的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞对活性氧的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞对维甲酸的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与染色质重塑 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    acts上游ofor染色体组织内参与减数分裂细胞周期 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or成人寿命测定范围内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    涉及双绞线断裂修复 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    涉及双绞线断裂修复 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or内双链断裂修复的同源重组 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    同源重组参与双链断裂修复 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与端粒RNA定位的建立 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与建立端粒定位蛋白复合物 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or雌配子代内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    雌性性腺发育中的上游行为 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游of或雌性减数分裂核分裂内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    心脏发育的上游活动 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与组蛋白mRNA分解代谢过程 国际标准化组织
    从序列正交推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or免疫系统过程内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与内源性凋亡信号通路对DNA损伤的反应 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or内在凋亡信号通路内对DNA损伤的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    脂蛋白分解代谢过程中上游的acts 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    雄性减数分裂细胞核分裂中的上游行为 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游of或减数分裂端粒内聚集 国际标准化组织
    从序列正交推断
    更多信息
     
    参与有丝分裂G2 DNA损伤检查点信号 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与有丝分裂纺锤体装配检查点信号 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    多细胞生物生长中的上游行为 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与B细胞增殖的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与TORC1信号的负调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与TORC1信号的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与端粒帽盖的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    神经元凋亡过程的上游行为 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    神经元凋亡过程中的上游活动 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游或卵母细胞内发育 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游或卵泡内发育 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    与吞咽有关 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与磷脂酰肌醇-3-磷酸生物合成过程 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与DNA分解代谢过程的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与DNA损伤反应的正调控,p53类介体的信号转导 国际标准化组织
    从序列正交推断
    更多信息
     
    参与凋亡过程的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞粘附的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞迁移的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与基因表达的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经元凋亡过程的阳性调节 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游ofor对神经元凋亡过程的正调控 国际标准化组织
    从序列正交推断
    更多信息
     
    参与端粒酶催化核心复合物组装的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    端粒酶参与端粒维持的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    端粒延长参与端粒维持的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与RNA聚合酶II对转录的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or或胚胎后发育内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与前B细胞等位基因排除 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与自噬调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞周期调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    小胶质细胞活化的参与调节 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    端粒酶参与端粒维持的调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与复制性衰老 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与缺氧反应 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或电离辐射响应范围内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    与电离辐射有关 国际标准化组织
    从序列正交推断
    更多信息
     
    参与DNA损伤的信号转导 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    行为_上游_of_or内体液发生 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与端粒维持 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    胸腺发育中的上游活动 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    丝氨酸蛋白激酶ATM
    姓名
    人类共济失调毛细血管扩张症基因突变
    共济失调毛细血管扩张症突变同源物
    NP_001100291.1号
    XP_008764444.1号
    XP_038936996.1号
    XP_038936997.1号
    XP_038936998.1号
    XP_038937000.1号
    支出_038937002.1
    XP_063121184.1号
    XP_063121185.1号

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节为中报告的基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001106821.1号NP_001100291.1号丝氨酸蛋白激酶ATM

      参见NP_001100291.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:暂定

      源序列
      电话473975
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A6J4J4型,D4ACL8号机组
      相关的
      编号0000045529.3,ENSRNOT00000050555.4号
      保守领域(4)总结
      cd05171
      位置:26912970
      PIKKc_ATM;共济失调毛细血管扩张症的催化结构域突变
      pfam02259型
      位置:21032497
      工厂验收试验;FAT域
      pfam02260型
      位置:30343063
      FATC;FATC域
      pfam11640型
      位置:11165
      TAN;端粒长度维持与DNA损伤修复

    注释基因组的参考序列:GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086026.1参考GRCr8

      范围
      62724939.62829040补充
      下载
      发电厂银行,美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_039081069.2号XP_038936997.1号丝氨酸蛋白激酶ATM亚型X1

      保守领域(4)总结
      cd05171
      位置:27233002
      PIKKc_ATM;共济失调毛细血管扩张症的催化结构域突变
      第02259页
      位置:21372529
      工厂验收试验;FAT域
      pfam02260型
      位置:30663095
      FATC;FATC域
      pfam11640型
      位置:8165
      TAN;端粒长度维持与DNA损伤修复
    2. XM_039081070.2号XP_038936998.1号丝氨酸蛋白激酶ATM亚型X1

      保守领域(4)总结
      cd05171
      位置:27233002
      PIKKc_ATM;共济失调毛细血管扩张症的催化结构域突变
      pfam02259型
      位置:21372529
      脂肪;FAT域
      pfam02260型
      位置:30663095
      FATC;FATC域
      pfam11640型
      位置:8165
      TAN;端粒长度维持与DNA损伤修复
    3. XM_008766222.4号XP_008764444.1号丝氨酸蛋白激酶ATM亚型X2

      参见XP_008764444.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K3I0型
      保守领域(4)总结
      cd05171
      位置:26892968
      PIKKc_ATM;共济失调毛细血管扩张症的催化结构域突变
      pfam02259型
      位置:21032495
      工厂验收试验;FAT域
      pfam02260型
      位置:30323061
      FATC;FATC域
      pfam11640型
      位置:11165
      TAN;端粒长度维持与DNA损伤修复
    4. 圣诞节_039081068.2XP_038936996.1号丝氨酸蛋白激酶ATM亚型X1

      保守领域(4)总结
      cd05171
      位置:27233002
      PIKKc_ATM;共济失调毛细血管扩张症的催化结构域突变
      pfam02259型
      位置:21372529
      工厂验收试验;FAT域
      pfam02260型
      位置:30663095
      FATC;FATC域
      pfam11640型
      位置:8165
      TAN;端粒长度维持与DNA损伤修复
    5. XM_039081072.2号XP_038937000.1号丝氨酸蛋白激酶ATM亚型X3

      保守领域(3)总结
      cd05171
      位置:21982477
      PIKKc_ATM;共济失调毛细血管扩张症的催化结构域突变
      pfam02259型
      位置:16122004
      工厂验收试验;FAT域
      pfam02260型
      位置:25412570
      FATC;FATC域
    6. XM_039081074.2号XP_038937002.1号丝氨酸蛋白激酶ATM异构体X4

      保守领域(2)总结
      pfam02259型
      位置:21372186
      工厂验收试验;FAT域
      pfam11640型
      位置:8165
      TAN;端粒长度维持与DNA损伤修复
    7. XM_063265114.1号XP_063121184.1号丝氨酸蛋白激酶ATM亚型X5

    8. XM_063265115.1号XP_063121185.1号丝氨酸蛋白激酶ATM亚型X6

    核糖核酸

    1. XR_005487761.2号RNA序列