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    行动2肌动蛋白γ2,平滑肌[褐家鼠(挪威鼠)]

    基因ID:25365,更新日期2024年4月11日

    总结

    官方符号
    行动2由提供RGD公司
    官方全名
    肌动蛋白γ2,平滑肌由提供RGD公司
    主要来源
    RGD:2027年
    请参阅相关
    恩森布尔:ENSRNOG00000029401 联盟基因组:RGD:2027
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    临时的
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;Euarchontoglires语;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;大鼠
    也称为
    SMGA;行动
    总结
    预测可启用ATP结合活性。预计参与间质迁移;基因表达的正调控;血管相关平滑肌收缩。预计位于几个细胞成分中,包括丝状体;跛足;和肌球蛋白丝。预计是dynactin复合体的一部分。预计在细胞质中活跃。该基因的人类同源基因与巨囊虫-微克隆-睾丸蠕动减退综合征有关。与人类ACTG2同源(肌动蛋白γ2,平滑肌)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    子宫(RPKM 1423.3)和肺(RPKM170.0)中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    请参阅中的Actg2基因组数据查看器
    位置:
    第4季度34
    外显子计数:
    9
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCr8级(GCF_036323735.1号) 4 NC_086022.1(117579513..117604379,补码)
    RS_2023_06号 上一个程序集 额定BN7.2(GCF_015227675.2号) 4 NC_051339.1(116021832..116046475,补码)
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(GCF_ 000001895.5) 4 NC_005103.4(115215160..115239746,补遗)

    染色体4-NC_086022.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene uncharacterized LOC134486594 Neighboring gene deoxyguanosine kinase Neighboring gene uncharacterized LOC120102320 Neighboring gene Stam binding protein Neighboring gene uncharacterized LOC120102321 Neighboring gene C-type lectin domain family 4, member F

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述:从Fischer 344大鼠的11个器官(肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本,这些器官来自于四个发育阶段(2-、6-、21-和104周龄)的雌雄大鼠
    • 生物项目:项目编号:238328
    • 出版物:PMID 24510058
    • 分析日期:2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?
    提交: 新GenerRIF 更正

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    克隆名称

    • MGC105507型

    基因本体论 RGD提供

    功能 证据代码 酒吧
    启用ATP绑定 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    启用水解酶活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    使蛋白激酶结合 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    过程 证据代码 酒吧
    涉及生物过程 ND(无损检测)
    无可用生物数据
    更多信息
     
    参与肾小球系膜细胞发育 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与间充质迁移 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与基因表达的正调控 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    参与血压调节 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与应对病毒 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    血管相关平滑肌收缩 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    组件 证据代码 酒吧
    肌动蛋白细胞骨架中的活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    肌动蛋白细胞骨架定位 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    位于单元格体中 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    位于单元格外围 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于细胞质中 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    定位于细胞骨架 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    位于丝状体中 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    位于lamellipodium 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    位于运动纤毛内 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于肌球蛋白丝 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    蛋白质复合物的一部分 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于平滑肌收缩纤维 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    肌动蛋白,γ-血管平滑肌
    姓名
    肌动蛋白,γ2,平滑肌,肠
    α-肌动蛋白-3
    α平滑肌肌动蛋白
    γ-2-肌动蛋白
    γ-环平滑肌肌动蛋白
    平滑肌γ-肌动蛋白

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组学

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_012893.1号NP_037025.1号肌动蛋白,γ-血管平滑肌

      参见NP_037025.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:暂定

      源序列
      M22323型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第63269页
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K4M6型,A6IAN1型
      保守领域(1)总结
      PTZ00281型
      位置:1376
      PTZ00281;肌动蛋白;临时的

    注释基因组的参考序列:GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086022.1参考GRCr8

      范围
      117579513..117604379补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_006236728.4号XP_006236790.1号肌动蛋白、γ-受体平滑肌亚型X1

      参见XP_006236790.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第63269页
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0G2K4M6型,A6IAN1型
      相关的
      ENSRNOP00000050322.2公司
      保守领域(1)总结
      PTZ00281型
      位置:1376
      PTZ00281;肌动蛋白;临时的