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    氪14角蛋白14[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:16664,更新日期2024年5月14日

    摘要

    官方符号
    Krt14号机组由提供MGI公司
    官方全名
    角蛋白14由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:96688
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000045545 联盟基因组:MGI:96688
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    检验过的
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    K14;CK-14;Krt1-14;Krt-1.14
    摘要
    该基因编码角蛋白家族的一个成员,角蛋白家族是中间丝中最多样化的一组。这种基因产物是一种I型角蛋白,通常是一种含有两个角蛋白5分子的异四聚体,即II型角蛋白。它们共同构成上皮细胞的细胞骨架。已发现该基因编码不同亚型的三种转录变体。[由RefSeq提供,2015年9月]
    表达式
    胃成体(RPKM 89.1)、肢体E14.5(RPKM80.1)和6个其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    参见中的Krt14基因组数据查看器
    位置:
    11 63.43立方厘米;11天
    外显子计数:
    9
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 11 NC_000077.7(100093988..100098336,补码)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 11 NC_000077.6(100203162..100207510,补码)

    染色体11-NC_000077.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene predicted gene, 39022 Neighboring gene keratin 9 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_30714 Neighboring gene type I keratin KA11P Neighboring gene transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 2 pseudogene

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

    相互作用

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 由MGI提供

    功能 证据代码 酒吧
    使角蛋白丝结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    实现结构分子活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    角蛋白,I型细胞骨架14
    姓名
    细胞角蛋白14
    角蛋白复合物1,酸性,基因14

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节为中报告的基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001313956.1NP_001300885.1号角蛋白,I型细胞骨架14亚型2

      状态:已审阅

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(2)缺少一个替代的帧内片段。所得亚型(2)具有相同的N-和C-末端,但比亚型1短。
      源序列
      AA050376、AA562488、AA612291、AI893364、AL590873
      保守领域(2)总结
      pfam00038型
      位置:120370
      长丝;中间丝蛋白
      19219年
      位置:235345
      DUF342;功能未知的蛋白质(DUF342)
    2. NM_001313957.1NP_001300886.1号角蛋白,I型细胞骨架14亚型3

      状态:已审阅

      描述
      转录变体:该变体(3)使用替代的第一外显子代替变体1。这种差异导致下游AUG的翻译起始,并导致与同型1相比具有更短N末端的同型(3)。
      源序列
      AA499338、AA562488、AA612291、AA760592、AI893364、AL590873
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q61781问题
      相关的
      ENSMUST00000137265.2号
      保守领域(1)总结
      pfam00038型
      位置:1214
      长丝;中间丝蛋白
    3. NM_016958.2NP_058654.1号角蛋白,I型细胞骨架14亚型1

      参见NP_058654.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      转录变体:该变体(1)代表最长的转录物,并编码最长的同种型(1)。
      源序列
      AA499338、AA562488、AA612291、AA760592、AI893364、AL590873
      共识CDS
      CCDS25413.1号
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A2A4G4型,Q61781问题,Q91VQ4问题,Q99LE0型
      相关的
      恩斯穆斯0000007272.8,ENSMUST00000007272.8号
      保守领域(1)总结
      pfam00038型
      位置:120431
      长丝;中间丝蛋白

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000077.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      100093988..100098336补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)