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    Sox9指数SRY-box转录因子9[褐家鼠(挪威鼠)]

    基因ID:140586,更新于2024年4月4日

    总结

    官方符号
    Sox9指数由提供RGD公司
    官方全名
    SRY-box转录因子9由提供RGD公司
    主要来源
    注册编号:620474
    请参阅相关
    乐团:ENSRNOG00000002607 联盟基因组:RGD:620474
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;大鼠
    也称为
    SRY公司
    总结
    使DNA结合转录激活物活性,RNA聚合酶II特异性;bHLH转录因子结合活性;和顺调控区序列特异性DNA结合活性。参与多个过程,包括支持细胞的发育;cAMP介导的信号转导;积极调节大分子代谢过程。转录调节复合物的一部分。该基因的人类直系同源基因与46,XX性别逆转2有关;46、XY性别逆转10;和钟状体发育不良。与人SOX9同源(SRY-box转录因子9)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    脑组织(RPKM 21.4)、睾丸组织(RPKM 20.4)和7个其他组织中的偏倚表达查看更多信息
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    请参阅中的Sox9基因组数据查看器
    位置:
    10季度32.1
    外显子计数:
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCr8级(GCF_036323735.1号) 10 NC_086028.1(98305744..98311250)
    RS_2023_06号 上一个程序集 额定BN7.2(合同通用条款015227675.2) 10 NC_051345.1(97806485..97811994)
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(总金额000001895.5) 10 NC_005109.4(101288528..101294030)

    染色体10-NC_086028.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene uncharacterized LOC134480722 Neighboring gene uncharacterized LOC103693474 Neighboring gene uncharacterized LOC134480640 Neighboring gene uncharacterized LOC102549521

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述:从Fischer 344大鼠的11个器官(肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本,这些器官来自于四个发育阶段(2-、6-、21-和104周龄)的雌雄大鼠
    • 生物项目:项目编号:238328
    • 出版物:PMID 24510058
    • 分析日期:2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

    PubMed中的相关文章

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    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 RGD提供

    功能 证据代码 酒吧
    启用DNA绑定 国际标准化组织
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    更多信息
     
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    使DNA结合转录激活物活性,RNA聚合酶II特异性 国际标准化组织
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    激活DNA结合转录因子活性 进口
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    启用beta-catenin绑定 国际标准化组织
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    启用染色质结合 国际空间站
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    实现顺调控区序列特异性DNA结合 国际标准化组织
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    使顺式调节区序列特异性DNA结合 国际空间站
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    启用前mRNA内含子结合 国际标准化组织
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    使蛋白激酶A催化亚单位结合 国际标准化组织
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    过程 证据代码 酒吧
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    参与软骨发育 IEP公司
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    参与软骨发育 国际空间站
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    参与软骨发育 北美
    不可追踪的作者声明
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    参与软骨发育 TAS公司
    可追溯作者声明
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    acts_upstream_of_or内胶质细胞命运规范 国际标准化组织
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    acts上游of或在上皮细胞分化的负调控中 国际标准化组织
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    参与免疫系统过程的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
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    位于核内 国际空间站
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    蛋白质复合物的一部分 国际空间站
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    部分转录调节复合物 国际开发协会
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    部分转录调节复合物 国际标准化组织
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    一般蛋白质信息

    首选名称
    转录因子SOX-9
    姓名
    SRY(性别决定区域Y)-框9(腺体发育不良,常染色体性别反转)
    SRY框9
    含有基因9的SRY-box

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组学

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_080403.3号NP_536328.1号转录因子SOX-9

      参见NP_536328.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      源序列
      日本宇宙航空研究开发委员会Z010000010
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      F1LYL9型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0C5AMK0型
      相关的
      ENSRNOP00000003511.5号,ENSRNOT00000003511.7号
      保守领域(2)总结
      cd01388号
      位置:104174
      SOX-TCF_HMG-盒;DNA结合蛋白HMG-box超家族的I类成员。这些蛋白质包含一个HMG盒,并以高度序列特异的方式结合DNA的小凹槽。成员包括昆虫和脊椎动物中的SRY及其同源物,以及。。。
      pfam12444型
      位置:2294
      Sox_N;Sox发育蛋白N末端

    注释基因组的参考序列:GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086028.1参考GRCr8

      范围
      98305744..98311250
      下载
      GenBank(基因银行),法斯塔,序列查看器(图形)