吸烟老鼠

提供对smokingMouse项目数据的访问

生物导体版本：释放（3.19）

这是一个ExperimentalHub软件包，可以访问smokingMouse项目分析中使用的基因、外显子、转录物和连接水平的数据。请参阅https://github.com/LieberInstitute/smokingMouse_Indirects。该数据集包含208只小鼠的基因、转录本、外显子和外显子-外显子连接的表达计数，这些样本来自幼鼠、成年鼠大脑和成年鼠血液。它们还包含这些样本和特征的相关信息，例如条件、质量控制指标、是否在过滤步骤后使用，以及特征是否在不同的实验中以不同的方式表达。

作者：戴安娜·冈萨雷斯-帕迪拉[aut，cre]

维护人员：戴安娜·冈萨雷斯-帕迪拉（Daianna Gonzalez-Padilla）

引文（从R中输入引文（“冒烟老鼠”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“吸烟鼠标”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“烟雾老鼠”）

吸烟鼠简介	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	实验数据,实验中心,表达式数据,Mus_肌肉_数据,RNASeq数据
版本	1.2.0
许可证	艺术-2.0
取决于
进口
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/LieberInstitute/smoking鼠标
错误报告	https://support.bioconductor.org/t/smoking鼠标

建议	实验中心,注释中心数据,仿生风格,覆盖（covr）,实验中心数据,针织物,参考管理R,rmarkdown公司,sessioninfo（会话信息）,测试那个(>= 3.0.0)
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	冒烟鼠标_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/smoking鼠标
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/吸烟鼠标
包短Url	https://bioconductor.org/packages/smoking鼠标/
软件包下载报告	下载统计信息