管理的宏基因组数据
人类微生物组的固化宏基因组数据
生物导体版本：释放（3.19）
策划的MetagenomicData包为新的分析提供了标准化、策划的人类微生物组数据。它包括基因家族、标记丰度、标记存在、通路丰度、通路覆盖率以及从不同身体部位采集的样本的相对丰度。用MetaPhlAn3计算每个样品的细菌、真菌和古生物分类丰度，用HUMAnN3计算代谢功能潜能。手动管理的样本元数据和标准化宏基因组数据可作为（树）摘要实验对象使用。
作者：卢卡斯·希弗
、李维·沃尔德隆【aut】、爱德华多·帕索利【ctb】、詹妮弗·沃卡蒂【ctb）、肖恩·戴维斯【ctb」、奥黛丽·伦森【ctb’、克洛伊·米尔扎伊【ctb〕、保罗·曼吉【ctb》、塞缪尔·甘博阿图斯【ctb】、马塞尔·拉莫斯【ctb-】、瓦莱丽·奥本钦【ctb
维护人员：卢卡斯·席弗<schifer.Lucas at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“管理的MetagenomicData”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“管理的MetagenomicData”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“管理的宏基因组数据”）
细节
| 生物视图 |
实验数据,实验中心,人乳头数据,微生物数据,可复制研究 |
| 版本 |
3.12.0 |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.1.0），总结性实验,树总结实验 |
| 进口 |
批注中心,实验中心,S4载体,数字播放器,马格里特,米娅,呜呜声,爱尔兰航空公司,字符串,易怒的,第三年,潮汐选择 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/waldronlab/curatedMetagenomicData网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/waldronlab/curatedMetagenomicData/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
