MerfishData公司

公共MERFISH数据集的收集

生物导体版本：释放（3.19）

MerfishData是一个ExperimentHub包，用于提供通过多重错误稳健荧光原位杂交（MERFISH）获得的公开数据集。MERFISH是一种大规模多路复用的单分子成像技术，能够同时测量单个细胞中数百到数万种RNA的拷贝数和空间分布。该包的范围是为基准和分析提供MERFISH数据。

作者：路德维希·盖斯林格[aut，cre]、泰龙·李、海伦娜·克劳威尔，杰弗里·莫菲特[aut]，罗伯特·绅士[aut]

维护人员：路德维希·盖斯林格（Ludwig Geistlinger）在哈佛大学教育学院（hms.harvard.edu）

引文（从R中输入引文（“MerfishData”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“MerfishData”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignette（“MerfishData”）

生物视图	实验数据,实验中心,表达式数据,高通量图像数据,Mus_肌肉_数据,单细胞数据,空间数据
版本	1.6.0
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.2.0），EB图像,空间实验
进口	gr设备，批注中心,凹凸矩阵,实验中心,S4载体,单细胞实验,总结性实验
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/ccb-hms/MerfishData网站
错误报告	https://github.com/ccb-hms/MerfishData/issues

建议	网格，ggplot2,ggpubr公司,针织物,市场营销,测试那个,仿生风格,DropletUtils公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	Merfish数据_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MerfishData
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/MerfishData
包短Url	https://bioconductor.org/packages/MerfishData/
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