HCAT库存数据
提供对扁桃体细胞图谱数据集的编程访问
生物导体版本：释放（3.19）
此软件包提供对扁桃体细胞图谱在人类细胞图谱（HCA）背景下生成的scRNA-seq、scATAC-seq、multiome、CITE-seq和空间转录组学（Visium）数据的访问。数据通过生物导体项目以单细胞实验的形式提供。此外，有关已识别单元类型的整个概要的信息以词汇表的形式提供。
作者：拉蒙·马索尼·巴多萨[aut，cre]
，费德里科·马里尼[aut]，阿兰·奥卡拉汉[aut]，海伦娜·克劳威尔[aut]
维护人员：拉蒙·马索尼·巴多萨（Ramon Massoni-Badosa）
引文（从R中输入引文（“HCATonsilData”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“HCATonsilData”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“HCATonsilData”）
细节
| 生物视图 |
实验数据,实验中心,表达式数据,RNASeq数据,单细胞数据,空间数据 |
| 版本 |
1.2.0 |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
实验中心,单细胞实验,空间实验,HDF5阵列,总结性实验,S4载体,html工具,市场营销,base64enc标准，实用程序 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/massonix/HCATonsilData网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/massonix/HCATonsilData/问题 |
查看更多
| 建议 |
针织物,ggplot2,测试那个(>= 3.0.0),散射,修拉,西尼亚克,zellkonverter公司,iSEE公司,ggspavis病毒,kableExtra（额外）,仿生风格 |
| 链接到 |
|
| 增强功能 |
|
| 取决于我 |
|
| 导入我 |
|
| 建议我 |
|
| 指向我的链接 |
|
| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
