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AHEnsDbs公司

AnnotationHub的EnsDbs


生物导体版本:释放(3.19)

为AnnotationHub提供基于EnsDb Ensembl的所有物种注释数据库。Ensemb SQLite数据库使用Ensembdb包中的函数(使用Ensembell Perl API)与Ensembl MySQL数据库分开生成。

作者:约翰内斯·雷纳

维护人员:约翰内斯·雷纳(Johannes Rainer)<Johannes.Rainer at eurac.edu>

引文(从R中输入引文(“AHEnsDbs”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“AHEnsDbs”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“AHEnsDbs”)
为AnnotationHub提供EnsDb数据库 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 注释数据,注释Hub软件,新闻报道,数据导入,排序
版本 1.5.1
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.4),方法,集成数据库(>= 1.99.10)
进口 注释中心数据(>= 1.5.24)
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 仿生风格,针织物,批注中心(>= 2.7.13),rmarkdown公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 AHEnsDbs_1.5.1.tar.gz公司
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
包短Url https://bioconductor.org/packages/AHEnsDbs/
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