zellkonverter公司

scRNA-seq对象之间的转换

生物导体版本：释放（3.19）

提供在Python AnnData对象和SingleCellExperiment对象之间进行转换的方法。这些主要用于封装Python方法的下游Bioconductor包，用于单细胞数据分析。它还包括读取和写入用于将AnnData对象保存到磁盘的H5AD文件的功能。

作者：卢克·扎皮亚[aut，cre]，亚伦·伦[aut]，杰克·卡姆罗布勒希·坎努特(，rcannood）

维护人员：卢克·扎皮亚（Luke Zappia）

引文（从R中输入引文（“zellkonverter”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“zellkonverter”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignette（“zellconverter”）

将AnnData转换为SingleCellExperimentas	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

生物视图	数据导入,数据表示,单个单元格,软件
版本	1.14.0
在生物导体中	生物柴油3.12（R-4.0）（3.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于
进口	矩阵,蛇怪,网状的,单细胞实验(>= 1.11.6),总结性实验,延迟阵列、方法、，S4载体，实用程序，克莱
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/theislab/zellkonverter网站
错误报告	https://github.com/theislab/zellkonverter/issues

建议	安达塔,生物文件缓存,仿生风格,冠状病毒,HDF5阵列,针织物,pkgload公司,rmarkdown公司,rhdf5基因(>= 2.45.1),scRNA序列,拼写,测试那个,用r
链接到
增强功能
取决于我	OSCA简介
导入我	单细胞TK,速度捕捉器
建议我	CuratedAtlasQueryR,全球视野,HDF5阵列,单元格生成dp,HCAT库存数据
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	zellkonverter_1.14.0.tar.gz公司
Windows二进制	zellkonverter_1.14.0.zip文件（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	zellkonverter_1.14.0.tgz软件
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zellkonverter网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/zellkonverter
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/zellconverter网址/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/zellkonverter网站/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包	源存档