zFPKM公司

促进zFPKM转换的一组函数

生物导体版本：释放（3.19）

对RNA-seq FPKM数据执行zFPKM转换。该算法基于Hart等人2013年的出版物（Pubmed ID 24215113）。参考文献建议使用zFPKM>-3来选择表达基因。用编码开放/闭合染色体数据进行验证。使用FPKM或TPM可以很好地处理基因级数据。似乎无法很好地校准转录水平数据。

作者：罗恩·阿马尔[aut，cre]，约翰·汤普森[aut]

维护人员：罗恩·阿马尔（Ron Ammar）<Ron.Ammar at bms.com>

引文（从R中输入引文（“zFPKM”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）生物管理器：：安装（“zFPKM”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“zFPKM”）

生物视图	特征提取,基因表达式,免疫肿瘤学,RNA序列,软件
版本	1.26.0
在生物导体中	生物技术3.6（R-3.4）（7年）
许可证	GPL-3\|文件许可证
取决于	R（>=3.4.0）
进口	将死,数字播放器,ggplot2,第三年,总结性实验
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/ronammar/zFPKM/
错误报告	https://github.com/ronammar/zFPKM/issues网站

建议	针织物,利马,边缘R,地理查询,字符串,打印机,rmarkdown公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	DGEobj.utils公司
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	zFPKM_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	zFPKM_1.26.0.zip
macOS二进制（x86_64）	zFPKM_1.26.0.tgz
macOS二进制（arm64）	zFPKM_1.26.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zFPKM
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/zFPKM
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/zFPKM/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/zFPKM/
软件包下载报告	下载统计信息