威特里克斯

用于具有精确权重的矩阵的工具，测试和探索加权或稀疏数据

生物导体版本：释放（3.19）

用于处理具有精确权重和缺失数据的矩阵的数据类型和工具。这个包提供了一个通用的表示法和工具，可以用于多种类型的高吞吐量数据。权重的含义与基本R函数“lm”和包“limma”中的用法兼容。校准砝码，以考虑已知的精度预测因素。查找具有过度可变性的行。执行差异测试并找到有最大置信差异的行。即使有许多缺失值，也可以找到PCA样的变化分量，并进行旋转，以便对单个分量进行有意义的解释。支持DelayedArray矩阵和BiocParallel。

作者：保罗·哈里森

维护人员：保罗·哈里森（Paul Harrison）

引文（从R中输入引文（“weitrix”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“weitrix”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“weitrix”）

1.概念和实际细节	HTML格式
2.poly（A）尾部长度示例	HTML格式	R脚本
3.选择性聚腺苷化	HTML格式	R脚本
4.RNA-Seq表达示例	HTML格式	R脚本
5.SLAM-Seq比例数据示例	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

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细节

生物视图	数据表示,尺寸缩减,基因表达式,RNA序列,回归,单个单元格,软件,转录组学
版本	1.16.0
在生物导体中	生物柴油3.11（R-4.0）（4.5年）
许可证	LGPL-2.1\|文件许可证
取决于	R（>=3.6），总结性实验
进口	方法、utils、stats、grDevices、，断言,S4载体,DelayedArray（延迟阵列）,延迟矩阵统计,生物并行,生物遗传学,利马,顶级糖果,数字播放器,呜呜声,ggplot2,爱尔兰航空公司,规模,重塑2、花键、，Ckmeans.1d.dp,全球2,RhpcBLASctl公司
系统要求
统一资源定位地址

建议	针织物,rmarkdown公司,仿生风格,潮韵诗,气道,边缘R,EnsDb公司。哈皮恩斯v86,组织S.c.sgd.db,注释Dbi,复杂热图,拼凑,测试那个(>= 2.1.0)
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	魏特里克斯_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	weitrix_1.16.0.zip码
macOS二进制（x86_64）	魏特里克斯_1.16.0.tgz
macOS二进制（arm64）	魏特里克斯_1.16.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/weitrix网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/weitrix
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/weitrix网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/weitrix网站/
软件包下载报告	下载统计信息