毒蛇

基于富集正则子分析的蛋白质活性虚拟推断


生物导体版本:释放(3.19)

从基因表达数据推断蛋白质活性,包括VIPER和msVIPER算法

作者:玛丽亚诺·J·阿尔瓦雷斯(Mariano J Alvarez)<reef103 at gmail.com>

维护人员:玛丽亚诺·J·阿尔瓦雷斯(Mariano J Alvarez)<reef103 at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“毒蛇”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“毒蛇”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“毒蛇”)
使用VIPER PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 功能预测,基因表达式,基因调控,网络丰富,软件,系统生物学
版本 1.38.0
在生物导体中 生物化学2.14(R-3.1)(10.5年)
许可证 文件许可证
取决于 R(>=2.14.0),博科生物,方法
进口 混合工具,统计,并行,e1071号,科恩平滑
系统要求
统一资源定位地址
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 毒蛇_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 viper_1.38.0.zip型
macOS二进制(x86_64) 毒蛇1.38.0.tgz
macOS二进制(arm64) 毒蛇_1.38.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/viper网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/毒蛇
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/viper网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/viper网站/
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