tx转换器

转录组切割

生物导体版本：释放（3.19）

不同的mRNA测序文库制备方法可产生特定于转录末端的测序读取。在比对或伪比对阶段以及下游分析中，通过使用转录组注释的截短版本，可以帮助对此类数据中的亚型使用进行量化分析。这个包实现了一些方便的方法，可以方便地生成这种截断的注释及其相应的序列。

作者：默文·范斯勒

维护人员：默文·范斯勒（Mervin Fansler）<fanslerm at mskcc.org>

引文（从R中输入引文（“txcutr”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“txcutr”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignets（“txcutr”）

生物视图	对齐,注释,RNA序列,排序,软件,转录组学
版本	1.10.0
在生物导体中	生物柴油3.14（R-4.1）（3年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=4.1.0）
进口	注释Dbi,基因组特征,txdb制造商,I范围,基因组范围,生物遗传学,生物串,S4载体,rtracklayer公司,生物并行，统计，方法，实用程序
系统要求
统一资源定位地址

建议	参考管理器,仿生风格,针织物,sessioninfo（会话信息）,rmarkdown公司,测试那个(>= 3.0.0),TxDb（发送日期）。Scerevisiae公司。UCSC.sacCer3.sgdGene公司,英国基因组。Scerevisiae公司。UCSC.sacCer3
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
链接到我
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	txcutr_1.10.0.tar.gz公司
Windows二进制	txcutr_1.10.0.zip
macOS二进制（x86_64）	txcutr_1.10.0.tgz
macOS二进制（arm64）	txcutr_1.10.0.tgz型
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/txcutr网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/txcutr
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/txcutr网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/txcutr网站/
软件包下载报告	下载统计信息