树冠R

树中最优信号电平的算法

生物导体版本：释放（3.19）

假设在层次结构中的排列出现在许多研究领域中，通常表明可以查看数据的不同分辨率。这就提出了信号应该在哪个分辨率级别上进行最佳解释的问题。treeclimbR提供了一种灵活的方法来选择最佳分辨率级别（树的不同部分可能有不同的级别），而不是将树切割为任意级别。treeclimbR使用一个调整参数来生成候选分辨率，并从中选择最佳分辨率。

作者：黄瑞珠[aut]，夏洛特·索内森[aut，cre]

维护人员：夏洛特·索尼森

引文（从R中输入引文（“treeclimbR”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“treeclimbR”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“treeclimbR”）

树冠R	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

需要帮助吗？请访问生物导体支持网站！

细节

生物视图	基于单元格的消息,软件,统计方法
版本	1.0.0
在生物导体中	生物活性碳3.19（R-4.4）（<6个月）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.4.0）
进口	树总结实验(>= 1.99.0),边缘R、方法、，总结性实验,S4载体,杜姆特,数字播放器,易怒的,第三年,猿,差异（diffcyt）,gg新闻量表,ggplot2(>= 3.4.0),翡翠色,ggtree（ggtree），统计，实用程序，爱尔兰航空公司
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/csoneson/treeclimbR
错误报告	https://github.com/csoneson/treeclimbR/issues

建议	针织物,市场营销,规模,测试那个(>= 3.0.0),仿生风格
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	树冠R_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	树气候R_1.0.0.zip
macOS二进制（x86_64）	树冠R_1.0.0.tgz
macOS二进制（arm64）	树冠R_1.0.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/treeclimbR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/treeclimbR
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/treeclimbR/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/treeclimbR/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包	源存档