垃圾堆

将转录组学引入tidyverse


生物导体版本:释放(3.19)

这是一个实用函数集合,允许以模块化、管道友好和整洁的方式对RNA测序数据进行探索和计算。

作者:斯特凡诺·曼吉奥拉[aut,cre],玛丽亚·多伊尔[ctb]

维护人员:Stefano Mangiola<mangiolastefano at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“tidybulk”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“tidybulk”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“tidybulk”)
tidybulk包概述 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 分析域,群集,差异表达式,基因表达式,基础设施,规范化,质量控制,RNA序列,排序,软件,转录,转录组学
版本 1.16.0
在生物导体中 生物柴油3.11(R-4.0)(4.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.1.0),tt服务(>= 0.3.6)
进口 易怒的,阅读器,数字播放器(>= 1.1.0),马格里特,第三年,斯特林吉,字符串,爱尔兰航空公司,呜呜声,潮汐选择,预处理核心,stats,并行,utils,生命周期,规模,总结性实验,基因组范围、方法、,S4载体,蜡笔,矩阵
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/stemangiola/tidybulk
错误报告 https://github.com/stemangiola/tidybulk/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 tidybulk_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 tidybulk_1.16.0.zip码
macOS二进制(x86_64) tidybulk_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64) tidybulk_1.16.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tidybulk网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/tidybulk
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/tidybulk网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/tidybulk网站/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包 源存档