绞线检查
计算bam文件的绞线信息
生物导体版本：释放（3.19）
该包旨在从链特异性RNA样品中定量并去除推定的双链DNA。还有一些选项和方法可以绘制所有滑动窗口的正负比例，使用户可以了解样本被污染的程度以及用于过滤的适当阈值。
作者：Thu-Hien To[aut，cre]、Steve Pederson[aut]
维护人员：Thu-Hien To<在gmail.com>
引文（从R中输入引文（“strandCheckR”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“strandCheckR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“strandCheckR”）
细节
| 生物视图 |
对齐,新闻报道,免疫肿瘤学,质量控制,RNA序列,软件 |
| 版本 |
1.22.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.8（R-3.5）（6年） |
| 许可证 |
GPL（>=2） |
| 取决于 |
|
| 进口 |
数字播放器,马格里特,基因组信息Db,基因组比对,基因组范围,I范围,Rsamtools软件,S4载体，网格，生物遗传学,ggplot2,重塑2，统计，额外网格,TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg38.known基因、方法、，字符串,rmarkdown公司 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/U-ABioinformaticsHub/strandCheckR |
| 错误报告 |
https://github.com/U-ABioinformaticsHub/strandCheckR/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
