单一得分

基于秩的单样本基因集评分方法


生物导体版本:释放(3.19)

一种简单的单样本基因特征评分方法,使用基于等级的统计分析样本的基因表达谱。它在单个样本水平上对基因集的表达活性进行评分。

作者:Dharmesh D.Bhuva【aut】,吕汝谦[aut,ctb],莫梅内·福鲁坦[aut、ctb],马尔维卡·哈尔班达[aut,cre]

维护人员:Malvika Kharbanda<Kharbanda.m at wehi.edu.au>

引文(从R中输入引文(“singscore”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“singscore”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignette(“singscore”)
单样本评分 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基因表达式,GeneSet扩展,软件
版本 1.24.0
在生物导体中 生物C 3.7(R-3.5)(6.5岁)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.6)
进口 方法、统计、图形、,ggplot2,gr设备,gg排斥,GSEA基地,巧妙地,第三年,普利尔,马格里特,重塑,边缘R,R彩色啤酒,博科生物,BiocParallel公司,总结性实验,矩阵统计,重塑2,S4载体
系统要求
统一资源定位地址 https://davislaboratory.github.io/singscore网站
错误报告 https://github.com/DavisLaboratory/singscore/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 签名_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 签名_1.24.0.zip
macOS二进制(x86_64) 签名_1.24.0.tgz
macOS二进制(arm64) 签名_1.24.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singscore
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/singscore
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/singscore/
包短Url https://bioconductor.org/packages/singscore/
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