单一得分
基于秩的单样本基因集评分方法
生物导体版本:释放(3.19)
一种简单的单样本基因特征评分方法,使用基于等级的统计分析样本的基因表达谱。它在单个样本水平上对基因集的表达活性进行评分。
作者:Dharmesh D.Bhuva【aut】,吕汝谦[aut,ctb],莫梅内·福鲁坦[aut、ctb],马尔维卡·哈尔班达[aut,cre]
维护人员:Malvika Kharbanda<Kharbanda.m at wehi.edu.au>
引文(从R中输入引文(“singscore”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“singscore”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览Vignette(“singscore”)
细节
生物视图 |
基因表达式,GeneSet扩展,软件 |
版本 |
1.24.0 |
在生物导体中 |
生物C 3.7(R-3.5)(6.5岁) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=3.6) |
进口 |
方法、统计、图形、,ggplot2,gr设备,gg排斥,GSEA基地,巧妙地,第三年,普利尔,马格里特,重塑,边缘R,R彩色啤酒,博科生物,BiocParallel公司,总结性实验,矩阵统计,重塑2,S4载体 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://davislaboratory.github.io/singscore网站 |
错误报告 |
https://github.com/DavisLaboratory/singscore/issues |
查看更多
建议 |
pkg向下,仿生风格,己糖,针织物,市场营销,测试那个,覆盖(covr) |
链接到 |
|
增强功能 |
|
取决于我 |
|
导入我 |
TBSignatureProfiler(签名档案器),SingscoreAML变化,集群洞 |
建议我 |
马斯特R,vissE(视觉系统E),msigdb公司 |
指向我的链接 |
|
生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。