签名搜索
结合功能富集分析的基因表达搜索环境
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包实现了用于执行基因表达特征（GES）搜索的算法和数据结构，并随后使用专门的富集方法从功能上解释结果。
作者：段玉柱[aut]、布伦丹·贡戈[cre，aut]和托马斯·吉尔克[aut'
维护人员：Brendan Gongol<加州大学教育学院bgong001>
引文（从R中输入引文（“signatureSearch”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“signatureSearch”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“签名搜索”）
细节
| 生物视图 |
新闻报道,差异表达式,GO（开始）,基因表达式,KEGG公司,网络丰富,排序,软件 |
| 版本 |
1.18.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.10（R-3.6）（5年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.2.0），卢比,总结性实验,组织Hs.eg.db |
| 进口 |
注释Dbi,ggplot2,数据表,实验中心,HDF5阵列,马格里特,RSQ网站,数字播放器,fgsea公司,规模、方法、，q值，统计，实用程序，重塑2,visNetwork（可视网络）,BiocParallel公司,快速比赛,反应.db,矩阵,clusterProfiler（群集探查器）,阅读器,剂量,rhdf5型,GSEA基地,DelayedArray（延迟阵列）,生物遗传学,易怒的 |
| 系统要求 |
C++11语言 |
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/yduan004/signature搜索/ |
| 错误报告 |
https://github.com/yduan004/signatureSearch/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
