注册打开对于生物20247月24-26日

seq徽标

DNA序列比对的序列标识


生物导体版本:释放(3.19)

seqLogo采用DNA序列基序的位置权重矩阵,绘制出Schneider和Stephens(1990)介绍的相应序列徽标。

作者:奥利弗·本博姆[aut],罗伯特·伊万内克[aut,cre]

维护人员:unibas.ch>的Robert Ivanek

引文(从R中输入引文(“seqLogo”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“seqLogo”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“seqLogo”)
DNA序列比对的序列标识 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 序列匹配,软件
版本 1.70.0
在生物导体中 BioC 2.0(R-2.5)(17年)
许可证 LGPL(>=2)
取决于 R(>=4.2),方法,网格
进口 统计4,gr设备
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/ivanek/seqLogo/issues
查看更多
建议 针织物,生物风格,rmarkdown公司,测试那个
链接到
增强功能
取决于我 rGADEM公司,基因调控
导入我 内部专家,PWMEnrich公司,RCAS公司,SPLINTER公司,TFBS工具,rGADEM公司,核糖核酸序列,扫描最小值
建议我 B等级,DiffLogo公司,MAGAR公司,MotifDb公司,igvR型,图案计数器,普世运动,潘戈恩
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 seq徽标_1.70.0.tar.gz
Windows二进制 seq徽标_1.70.0.zip
macOS二进制(x86_64) 序列号-1.70.0.tgz
macOS二进制(arm64) 序列号-1.70.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqLogo
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/seqLogo
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/seqLogo网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/seqLogo/
软件包下载报告 下载统计信息