注册打开对于生物20247月24-26日

供应链控制系统

单细胞RNA测序数据双链的硅内注释


生物导体版本:释放(3.19)

在单细胞RNA测序(scRNA-seq)中,细胞的数据组合有时被视为单细胞(双细胞)。scds包提供了在scRNA-seq数据中以计算方式注释双链的方法。

作者:Dennis Kostka[aut,cre],Bais Abha[aut]

维护人员:丹尼斯·科斯特卡(Dennis Kostka at pitt.edu)

引文(从R中输入引文(“scds”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“scds”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“scds”)
scds包简介 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 分类,基因表达式,预处理,质量控制,RNA序列,排序,单个单元格,软件,转录组学
版本 1.20.0
在生物导体中 生物技术3.9(R-3.6)(5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=3.6.0)
进口 矩阵,S4载体,单细胞实验,总结性实验,xgboost公司,方法,统计信息,数字播放器,中华人民共和国
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 生物风格,针织物,rsvd公司,Rtsne公司,散射,奶牛场,rmarkdown公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我 单细胞TK
建议我 实验子集,muscData(蘑菇数据)
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 scds_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 scds_1.20.0.zip文件(仅64位)
macOS二进制(x86_64) scds_1.20.0.tgz公司
macOS二进制(arm64) scds_1.20.0.tgz公司
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scds
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/scd
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/scds/
包短Url https://bioductor.org/packages/scd/
软件包下载报告 下载统计信息