sccomp公司
单细胞数据成分和异质性的稳健Outlier-ware估计
生物导体版本：释放（3.19）
一种稳健的离群软件方法，用于测试单细胞数据中的差异组织成分。该模型可以推断组织组成和异质性的变化，并可以基于任何现有的数据集进行真实的数据模拟。该模型还可以从大量集成数据集中传递知识，以进一步提高准确性。
作者：斯特凡诺·曼吉奥拉〔aut，cre〕
维护人员：Stefano Mangiola<mangiolastefano at gmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“sccomp”）
对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“sccomp”）
细节
| 生物视图 |
群集,基因表达式,免疫肿瘤学,规范化,RNA序列,排序,单个单元格,软件,转录组学 |
| 版本 |
1.8.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.15（R-4.2）（2年） |
| 许可证 |
GPL-3公司 |
| 取决于 |
R（>=4.2.0） |
| 进口 |
方法，卢比(>= 0.12.0),Rcpp并行(>= 5.0.1),甾醇(>= 2.1.1),rstan公司(>= 2.26.0),修饰符对象,单细胞实验，平行，数字播放器,第三年,呜呜声,马格里特,爱尔兰航空公司,易怒的,靴子,生命周期，统计，潮汐选择，实用程序，ggplot2,gg排斥,拼凑,预测,阅读器,规模,字符串,胶 |
| 系统要求 |
GNU品牌 |
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/stemangiola/scomp |
| 错误报告 |
https://github.com/stemangiola/scomp/issues |
查看更多
| 建议 |
仿生风格,测试(>= 3.0.0),降价,针织物,厕所,潮间带,tidySingleCell实验,美女医生 |
| 链接到 |
伯克希尔哈撒韦(>= 1.66.0),卢比(>= 0.12.0),RcppEigen基因(>= 0.3.3.3.0),Rcpp并行(>= 5.0.1),rstan公司(>= 2.26.0),StanHeaders公司(>= 2.26.0) |
| 增强功能 |
毛皮商,分送外 |
| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 指向我的链接 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
