." /> 生物导体-rqt

rqt(平方英尺)

rqt:基因水平meta分析的实用工具


生物导体版本:释放(3.19)

尽管现代GWAS方法取得了最新进展,但解决计算整个基因的效应大小和相应的p值而不是单个变异的影响大小和p值仍然是一个重要问题。R包rqt提供了基因级GWAS元分析。有关更多信息,请参见:Lee等人(2016)的“下一代测序数据的基因关联测试”,生物信息学,32(17),i611-i619,.

作者:I.Y.Zhbannikov,K.G.Arbeev,A.I.Yashin。

维护人员:伊利亚·兹班尼科夫(Ilya Y.Zhbannikov)

引文(从R中输入引文(“rqt”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“rqt”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

参考手册 PDF格式

细节

生物视图 基因组广泛协会,主要组件,回归,排序,软件,统计方法,生存
版本 1.30.0
在生物导体中 生物碳3.5(R-3.4)(7.5年)
许可证 GPL公司
取决于 R(>=3.4),总结性实验
进口 统计数据,矩阵,ropls公司、方法、,汽车,RUnit(运行单位),元的,CompQuadForm格式,格尔姆奈特,实用程序,
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/izhbannikov/rqt
错误报告 https://github.com/izhbannikov/rqt/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64) rqt_1.30.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rqt
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/rqt
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/rqt/
包短Url https://bioconductor.org/packages/rqt/
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