rqt(平方英尺)
rqt:基因水平meta分析的实用工具
生物导体版本:释放(3.19)
尽管现代GWAS方法取得了最新进展,但解决计算整个基因的效应大小和相应的p值而不是单个变异的影响大小和p值仍然是一个重要问题。R包rqt提供了基因级GWAS元分析。有关更多信息,请参见:Lee等人(2016)的“下一代测序数据的基因关联测试”,生物信息学,32(17),i611-i619,.
作者:I.Y.Zhbannikov,K.G.Arbeev,A.I.Yashin。
维护人员:伊利亚·兹班尼科夫(Ilya Y.Zhbannikov)
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“rqt”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
细节
生物视图 |
基因组广泛协会,主要组件,回归,排序,软件,统计方法,生存 |
版本 |
1.30.0 |
在生物导体中 |
生物碳3.5(R-3.4)(7.5年) |
许可证 |
GPL公司 |
取决于 |
R(>=3.4),总结性实验 |
进口 |
统计数据,矩阵,ropls公司、方法、,汽车,RUnit(运行单位),元的,CompQuadForm格式,格尔姆奈特,实用程序,请 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/izhbannikov/rqt |
错误报告 |
https://github.com/izhbannikov/rqt/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。