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rqt

rqt:基因水平meta分析的实用工具


生物导体版本:释放(3.18)

尽管现代GWAS方法取得了最新进展,但解决计算整个基因的效应大小和相应的p值而不是单个变异的影响大小和p值仍然是一个重要问题。R包rqt提供了基因级GWAS元分析。有关更多信息,请参见:Lee等人(2016)的“下一代测序数据的基因关联测试”,生物信息学,32(17),i611-i619,.

作者:I.Y.Zhbannikov,K.G.Arbeev,A.I.Yashin。

维护人员:伊利亚·兹班尼科夫(Ilya Y.Zhbannikov)

引文(从R中输入引文(“rqt”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“rqt”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“rqt”)
rqt软件包教程 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基因组广泛协会,主要组件,回归,排序,软件,统计方法,生存
版本 1.28.0
在生物导体中 生物活性炭3.5(R-3.4)(7年)
许可证 GPL公司
取决于 R(>=3.4),总结性实验
进口 统计、矩阵、,液滴,方法,car,RUnit,meta,CompQuadForm,glmnet,utils,pls
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/izhbannikov/rqt
错误报告 https://github.com/izhbannikov/rqt/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 rqt_1.28.0.tar.gz剂量
Windows二进制 rqt_1.28.0.zip码
macOS二进制(x86_64) rqt_1.28.0.tgz号
macOS二进制(arm64) rqt_1.28.0.tgz号
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rqt
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/rqt
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/rqt/
包短Url https://bioconductor.org/packages/rqt/
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