区域重新加载
RegioneReloaded:基因组区域集的多重关联
生物导体版本:释放(3.19)
RegioneReloaded是一个软件包,允许同时分析基因组区域集之间的关联,实现数据聚类和创建现成的发布图形。它接管并扩展了其前身regioneR的所有功能。它还包含了一种改进p值计算的策略,并将来自多重分析的z分数标准化,以便进行直接比较。RegioneReloaded通过添加新的绘图函数来获取发布就绪图,从而构建在regioneR的基础上。
作者:罗伯托·马林弗尼[aut,cre]
、大卫·科鲁乔[aut]、伯纳特·盖尔[aut'
维护人员:Roberto Malinvini<Roberto.malinvini在gmail.com>
引文(从R中输入引文(“regioneReloaded”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“regioneReloaded”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“区域重新加载”)
细节
生物视图 |
ChIPSeq公司,群集,副本编号变化,DNASeq公司,遗传学,甲基Seq,多重比较,软件 |
版本 |
1.6.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.16(R-4.2)(1.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=4.2),区域R |
进口 |
统计数据,R彩色啤酒,Rtsne公司,乌玛,ggplot2,gg排斥,重塑2、方法、,规模,集群、网格、gr设备 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/RMalinverni/regione重新加载 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。