区域性个人电脑

用区域主成分分析综述区域甲基化

生物导体版本：释放（3.19）

使用区域主成分总结DNA甲基化数据的功能。使用基因组区域内的主成分分析计算区域主成分，以总结CpG甲基化水平的变化。使用Marcenko-Pasteur或Gavish-Donoho方法选择主成分的数量，以识别数据中的相关信号。

作者：蒂凡尼·尤拉里奥[aut，cre]

维护人员：Tiffany Eulalio<tyeulalio at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“地区性文件”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“区域电脑”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“区域性图片”）

生物视图	DNA甲基化,差异甲基化,甲基化阵列,软件,统计方法
版本	1.2.0
在生物导体中	生物柴油3.18（R-4.3）（0.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.3.0）
进口	数字播放器,PCA工具,易怒的,基因组范围
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/tyeulalio/regional公司
错误报告	https://github.com/tyeulalio/regionalpcs/issues

建议	针织物,rmarkdown公司,RMT统计,测试那个(>= 3.0.0),仿生风格,第三年,minfiData公司,TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,I范围
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	区域性cs_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	区域pcs_1.2.0.zip
macOS二进制（x86_64）	区域pcs_1.2.0.tgz
macOS二进制（arm64）	区域pcs_1.2.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regional公司
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/地区
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/regional公司/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/regional公司/
软件包下载报告	下载统计信息