rGADEM公司

从头发现基序

生物导体版本：释放（3.19）

rGADEM是大规模基因组序列数据的有效从头发现模体工具。它是一个开源的R包，基于GADEM软件。

作者：阿诺·德罗特（Arnaud Droit）、拉斐尔·戈塔多（Raphael Gottardo）、戈登·罗伯逊（Gordon Robertson）和李雷平（Leiping Li）

维护人员：Arnaud Droit<位于crchuq.ulaval.ca>的Arnaud.Droit

引文（从R中输入引文（“rGADEM”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“rGADEM”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“rGADEM”）

rGADEM用户指南	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式

生物视图	ChIPSeq公司,ChIP芯片,微阵列,MotifDiscovery公司,排序,软件
版本	2.52.0
在生物导体中	BioC 2.6（R-2.11）（14年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=2.11.0），生物串,I范围,牛基因组、方法、，seq徽标
进口	生物串,基因组范围、方法、图形、，seq徽标
系统要求
统一资源定位地址

建议	英国基因组。哈皮恩斯。加州大学圣保罗分校hg19,rtracklayer公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我	TCGA工作流
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	rGADEM_2.52.0.tar.gz
Windows二进制	rGADEM_2.52.0.zip码
macOS二进制（x86_64）	rGADEM_2.52.0.tgz
macOS二进制（arm64）	rGADEM_2.52.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rGADEM
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/rGADEM
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/rGADEM网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/rGADEM/
软件包下载报告	下载统计信息