项目BAMR

在鸟枪蛋白质组学数据中为PSM生成SAM文件


生物导体版本:释放(3.19)

将PSM映射回基因组。该软件包从鸟枪蛋白质组学数据构建SAM文件。该软件包还提供了从GTF文件准备注释的功能。

作者:王晓静

维护人员:王晓静(Xiaojing Wang)

引文(从R中输入引文(“proBAMr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“proBAMr”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“proBAMr”)
问题简介 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 免疫肿瘤学,质谱法,蛋白质组学,软件,可视化
版本 1.38.0
在生物导体中 BioC 3.0(R-3.1)(10年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.0.1),I范围,注释Dbi
进口 基因组范围,生物串,基因组特征,txdb制造商,rtracklayer公司
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 问题BAMr_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 问题BAMr_1.38.0.zip
macOS二进制(x86_64) 问题BAMr_1.38.0.tgz
macOS二进制(arm64) 问题BAMr_1.38.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proBAMr
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/proBAMr
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/proBA先生/
包短Url https://bioconductor.org/packages/proBA先生/
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