麝香葡萄酒
多样本多组scRNA-seq数据分析工具
生物导体版本:释放(3.19)
`muscat为多样本、多组、多(细胞)亚群scRNA-seq数据中的DS分析提供了各种方法和可视化工具,包括细胞级混合模型和基于聚合“伪体”数据的方法,以及模拟单样本和多样本scRNA-sq数据的灵活仿真平台。
作者:海伦娜·克劳威尔、皮尔雷·卢克·日尔曼[aut]、夏洛特·索内森[aut]]、安东尼·索内尔[aut]、马克·罗宾逊[aut,fnd]
维护人员:海伦娜·L·克劳威尔(Helena L.Crowell)
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“muscat”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“麝香”)
细节
生物视图 |
差异表达式,免疫肿瘤学,排序,单个单元格,软件,统计方法,可视化 |
版本 |
1.18.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.10(R-3.6)(5年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=4.3) |
进口 |
BiocParallel公司,blme公司,复杂热图,数据表,设计2,数字播放器,边缘R,ggplot2,甘氨酰甲基溴,grDevices,网格,利马,lmer测试,lme4公司,矩阵,矩阵统计、方法、,进步,呜呜声,S4载体,规模,散射,舷窗,sc变换,统计,单细胞实验,总结性实验,差异分区,翡翠色 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
https://github.com/HelenaLC/muscat网站 |
错误报告 |
https://github.com/HelenaLC/muscat/issues |
查看更多
建议 |
仿生风格,countsimQC(计数质量控制),奶牛场,实验中心,iCOBRA公司,针织物,谱系图,R彩色啤酒,重塑2,市场营销,随机反演,测试那个,UpSetR(升级程序) |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
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建议我 |
梦想家,muscData公司 |
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程序包档案
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