麝香葡萄酒

多样本多组scRNA-seq数据分析工具


生物导体版本:释放(3.19)

`muscat为多样本、多组、多(细胞)亚群scRNA-seq数据中的DS分析提供了各种方法和可视化工具,包括细胞级混合模型和基于聚合“伪体”数据的方法,以及模拟单样本和多样本scRNA-sq数据的灵活仿真平台。

作者:海伦娜·克劳威尔、皮尔雷·卢克·日尔曼[aut]、夏洛特·索内森[aut]]、安东尼·索内尔[aut]、马克·罗宾逊[aut,fnd]

维护人员:海伦娜·L·克劳威尔(Helena L.Crowell)

引文(从R中输入引文(“马斯喀特”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“muscat”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“麝香”)
1.DS分析 HTML格式 R脚本
2.数据模拟 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 差异表达式,免疫肿瘤学,排序,单个单元格,软件,统计方法,可视化
版本 1.18.0
在生物导体中 生物技术3.10(R-3.6)(5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.3)
进口 BiocParallel公司,blme公司,复杂热图,数据表,设计2,数字播放器,边缘R,ggplot2,甘氨酰甲基溴,grDevices,网格,利马,lmer测试,lme4公司,矩阵,矩阵统计、方法、,进步,呜呜声,S4载体,规模,散射,舷窗,sc变换,统计,单细胞实验,总结性实验,差异分区,翡翠色
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/HelenaLC/muscat网站
错误报告 https://github.com/HelenaLC/muscat/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 麝香_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 麝香_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64) 麝香_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/muscat
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/muscat
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/muscat网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/muscat网站/
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