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呻吟

时间扫描RNASeq数据分析的R包


生物导体版本:释放(3.19)

时间进程基因表达数据的简单高效工作流,建立在CRAN和生物导体上托管的公开可用开源项目的基础上。morin为使用函数数据分析分析时间进程数据所需的所有步骤提供了帮助函数:(1)时间进程数据的函数建模;(2) 差异表达分析;(3) 聚类;(4) 下游分析。

作者:伊丽莎白·普多姆,内尔·瓦罗佐[aut,cre]

维护人员:Nelle Varoquaux<Nelle.Varoquaux at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“呻吟”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“呻吟”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“呻吟”)
Moanin套餐 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
自述文件 文本
许可证 文本

细节

生物视图 群集,差异表达式,基因表达式,微阵列,RNA序列,软件,时间课程
版本 1.12.0
在生物导体中 生物化学3.13(R-4.1)(3年)
许可证 BSD 3条款许可证+文件许可证
取决于 R(>=4.0),总结性实验,topGO(顶GO),统计信息
进口 S4载体,MASS(质量)(>= 1.0.0),利马,翡翠色,边缘R、图形、方法、gr设备、,重塑2,NMI公司,动物园,群集R、花键、,矩阵统计
系统要求
统一资源定位地址
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建议 测试那个(>= 1.0.0),时间进程数据,针织物,rmarkdown公司,降价,覆盖(covr),仿生风格
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生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 呻吟_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 呻吟_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64) 呻吟_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64) 呻吟_1.12.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mournin
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/呻吟
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/moanin网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/morin(生物导体)/
软件包下载报告 下载统计信息