注册打开对于生物20247月24-26日

miRSM公司

在异质数据中推断miRNA海绵模块


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包旨在识别异质数据中的miRNA海绵或ceRNA模块。它提供了在单样本和多样本水平上研究miRNA海绵模块的几种功能,包括推断基因模块(候选miRNA海绵或ceRNA模块)的流行方法,以及在单样本和多样本水平上鉴定miRNA海绵模块的两种功能,以及对miRNA海绵模块进行模块化分析的几个功能。

作者:张俊鹏[aut,cre]

维护人员:张俊鹏(Junpeng Zhang)<zjp at dali.edu.cn>

引文(从R中输入引文(“miRSM”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“miRSM”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“miRSM”)
miRSM:在异质数据中推断miRNA海绵模块 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 生物医学信息学,群集,基因表达式,基因调控,GeneSet扩展,基因目标,微阵列,软件
版本 2.0.0
在生物导体中 生物技术3.8(R-3.5)(5.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.5.0)
进口 WGCNA公司,flashClust(闪光俱乐部),动态树剪切,全球金融账户,记录仪,链接通信,MCL公司,法比亚,国家气象局,双集群,iBBiG公司,比卡雷,国际标准化组织2,s4vd(平方英尺),双比特R,rqubic公司,博科生物,项目管理局,统计,聚类算法,子空间,麦克卢斯特,索姆布雷罗,ppclust公司,卢比,实用程序,总结性实验,GSEA基础,组织Hs.eg.db,集群探查器,反应omePA,剂量,矩阵相关性,能量
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/zhangjupeng411/miRSM网站
错误报告 https://github.com/zhangjupeng411/miRSM/issues网站
查看更多
建议 仿生风格,针织物,rmarkdown公司,测试那个
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 miRSM_2.0.0.tar.gz码
Windows二进制 miRSM_2.0.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) miRSM_2.0.0.tgz码
macOS二进制(arm64) miRSM_2.0.0.tgz码
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRSM网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/miRSM
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse-miRSM网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/miRSM网站/
软件包下载报告 下载统计信息