miRSM公司
在异质数据中推断miRNA海绵模块
生物导体版本:释放(3.19)
该软件包旨在识别异质数据中的miRNA海绵或ceRNA模块。它提供了在单样本和多样本水平上研究miRNA海绵模块的几种功能,包括推断基因模块(候选miRNA海绵或ceRNA模块)的流行方法,以及在单样本和多样本水平上鉴定miRNA海绵模块的两种功能,以及对miRNA海绵模块进行模块化分析的几个功能。
作者:张俊鹏[aut,cre]
维护人员:张俊鹏(Junpeng Zhang)<zjp at dali.edu.cn>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“miRSM”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“miRSM”)
细节
生物视图 |
生物医学信息学,群集,基因表达式,基因调控,GeneSet扩展,基因目标,微阵列,软件 |
版本 |
2.0.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.8(R-3.5)(5.5年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=3.5.0) |
进口 |
WGCNA公司,flashClust(闪光俱乐部),动态树剪切,全球金融账户,记录仪,链接通信,MCL公司,法比亚,国家气象局,双集群,iBBiG公司,比卡雷,国际标准化组织2,s4vd(平方英尺),双比特R,rqubic公司,博科生物,项目管理局,统计,聚类算法,子空间,麦克卢斯特,索姆布雷罗,ppclust公司,卢比,实用程序,总结性实验,GSEA基础,组织Hs.eg.db,集群探查器,反应omePA,剂量,矩阵相关性,能量 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/zhangjupeng411/miRSM网站 |
错误报告 |
https://github.com/zhangjupeng411/miRSM/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。