方法插补

从WGBS数据中导入引导的完整甲基体重建


生物导体版本:释放(3.19)

这个包实现了调用基因组中所有胞嘧啶甲基化的功能。

作者:阿伦·陶特

维护人员:Aaron Taudt<Aaron.Taudt at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“methimpute”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)生物管理器::安装(“methpute”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“methimpute”)
用METHimpute调用甲基化状态 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 新闻报道,DNA甲基化,表观遗传学,HiddenMarkov模型,免疫肿瘤学,排序,软件
版本 1.26.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(7年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.5.0),基因组范围,ggplot2
进口 卢比(>=0.12.4.5),方法,utils,grDevices,统计,基因组信息Db,I范围,生物串,重新整形2,最小包装.lm,数据表
系统要求
统一资源定位地址
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建议 针织物,仿生风格
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 方法插补1.26.0.tar.gz
Windows二进制 methimpute_1.26.0.zip方法(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 方法插补1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) 方法插补1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methimpute
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/方法
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/methimpute网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/methimpute网站/
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