iSEE路径

与路径分析相关的面板的iSEE扩展

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包包含多种功能，以扩展iSEE软件包的使用，包括面板或模式的附加类，以便于分析路径分析结果。此软件包不执行路径分析。相反，它提供了一些方法，以与iSEE应用程序中的交互式可视化兼容的方式，将预先计算的路径分析结果嵌入到SummarizedExperiment对象中。

作者：Kevin Rue-Albrecht【aut，cre】，托马斯·桑德曼夏洛特·索内森，费德里科·马里尼，德纳利治疗学[fnd]

维护人员：Kevin Rue-Albrecht<kevinrue67 at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“iSEEpathways”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“iSEEPaths”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“iSEEPaths”）

生物视图	差异表达式,GO（开始）,图形用户界面,基因表达式,GeneSet扩展,基础设施,路径,ShinyApps公司,软件,可视化
版本	1.2.0
在生物导体中	生物柴油3.18（R-4.3）（1年）
许可证	艺术-2.0
取决于	iSEE公司
进口	ggplot2、方法、，S4载体,闪亮的,闪亮小工具，统计，总结性实验
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/iSEE/iSEE路径
错误报告	https://support.bioconductor.org/t/iSEE路径

建议	气道,仿生风格,覆盖（covr）,边缘R,fgsea公司,政府.db,iSeed（搜索引擎代码）,针织物,组织Hs.eg.db,参考管理R,rmarkdown公司,散射,舷窗,sessioninfo（会话信息）,测试那个(>= 3.0.0)
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	iSEE路径_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	iSEPath路径_1.2.0.zip
macOS二进制（x86_64）	iSEE路径_1.2.0.tgz
macOS二进制（arm64）	iSEE路径_1.2.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iSEEpathways网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：软件包/iSEEPaths
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/iSEE路径/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/iSEEPaths网站/
软件包下载报告	下载统计信息