iSEEhub公司

生物导体实验中心的iSEE


生物导体版本:释放(3.19)

此软件包定义了与Bioconductor ExperimentHub接口的iSEE应用程序的自定义登录页。登录页允许用户浏览ExperimentHub,选择一个数据集,下载并缓存它,然后将其直接导入Bioconductor iSEE应用程序。

作者:Kevin Rue-Albrecht【aut,cre】

维护人员:Kevin Rue-Albrecht<kevinrue67 at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“iSEEhub”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“iSEEhub”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“iSEEhub”)
为iSEEhub贡献力量 HTML格式 R脚本
iSEEhub简介 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,免疫肿瘤学基础设施,ShinyApps公司,单个单元格,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 生物柴油3.16(R-4.2)(2年)
许可证 艺术-2.0
取决于 总结性实验,单细胞实验,实验中心
进口 批注中心,生物技术经理,DT公司,iSEE公司、方法、,林特罗斯,S4载体,闪亮的,闪亮的仪表板,闪耀(shinyjs),实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/iSEE/iSEEhub
错误报告 https://support.bioconductor.org/t/iSEEhub
查看更多
建议 仿生风格,覆盖(covr),针织物,参考管理R,rmarkdown公司,sessioninfo(会话信息),测试那个(>= 3.0.0),空范围数据
链接到
增强功能 BioPlex公司,饼干商数据,体映射鼠,CLL甲基化,版权中立IMA,管理AdipoArray,策划AdipoChIP,管理的宏基因组数据,管理的TCGA数据,DMR分类数据,2018双集群,easierData公司,emt数据,表观变异数据,现场效应Crc,基因组分布数据,GSE103322标准,GSE13015标准,GSE62944型,HD细胞数据,HMP16S数据,人性化数据,imc数据集,mcsurvdata公司,MetaGx乳房,MetaGx卵巢,MetaGx胰腺,甲基SeqData,muscData公司,NxtIRF数据,ObMiTi公司,量子化序列,restfulSE数据,RLHub(RLHub),sesame数据,模拟基准数据,单细胞多模式,单分子足迹数据,空间Dmelxsim,S示例数据,表MurisData,MurisSenisData表,TENxVisium数据,组织Treg,VectraPolarisData公司,xcoredata数据
取决于我
导入我
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 iSEEhub_1.6.0.tar.gz公司
Windows二进制 iSEEhub_1.6.0.zip文件(仅64位)
macOS二进制(x86_64) iSE轮毂_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64) iSEEhub_1.6.0.tgz公司
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iSEEhub
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/iSEEhub
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/iSEEhub/
包短Url https://bioconductor.org/packages/iSEEhub/
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