iSeed(搜索引擎代码)

与差异表达分析相关的面板的iSEE扩展


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包包含多种功能,可以扩展iSEE软件包的使用,包括用于面板或模式的附加类,这些类有助于分析差异表达式结果。此包不执行差分表达式。相反,它提供了一些方法,以与iSEE应用程序中的交互式可视化兼容的方式,将预计算的差分表达式结果嵌入到SummarizedExperiment对象中。

作者:Kevin Rue-Albrecht【aut,cre】,托马斯·桑德曼,德纳利治疗学[fnd]

维护人员:Kevin Rue-Albrecht<kevinrue67 at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“iSEED”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“iSEEde”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignets(“iSEEde”)
iSEEde简介 HTML格式 R脚本
舍入数值 HTML格式 R脚本
支持的差分表达式方法 HTML格式 R脚本
使用注释促进交互式探索 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 差异表达式,基础设施,软件
版本 1.2.0
在生物导体中 生物柴油3.18(R-4.3)(1年)
许可证 艺术-2.0
取决于 iSEE公司
进口 设计2,边缘R、方法、,S4载体,闪亮的,总结性实验
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/iSEE/iSEEde网站
错误报告 https://support.bioconductor.org/t/iSEEde网站
查看更多
建议 气道,仿生风格,覆盖(covr),针织物,利马,组织Hs.eg.db,参考管理R,市场营销,舷窗,sessioninfo(会话信息),随机反演,测试那个(>= 3.0.0)
链接到
增强功能
取决于我
导入我
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 iSEED_1.2.0.tar.gz标准
Windows二进制 iSEEde_1.2.0.邮编
macOS二进制(x86_64) iSEED_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64) iSEED_1.2.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iSEEde
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/iSEEde
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/iSEEde网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/iSEEde/
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