hiReads处理器

处理454/Illumina数据LM-PCR读取的功能

生物导体版本：释放（3.19）

hiReadsProcessor包含一组功能，允许用户处理使用任何平台排序的LM-PCR产品。给定一个excel/txt文件，其中包含解复用和样本元数据的参数，该函数自动修剪适配器和识别基因组产品。基因组产物进一步处理以进行质量控制和丰度量化。

作者：尼拉夫·马拉尼

维护人员：尼拉夫·马拉尼

引文（从R中输入引文（“hiReadsProcessor”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“hiReadsProcessor”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“hiReadsProcessor”）

生物视图	预处理,排序,软件
版本	1.40.0
在生物导体中	生物技术3.0（R-3.1）（9.5年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=3.5.0），生物串,pwalling（pwallign）,基因组比对,BiocParallel公司,hi注释器
进口	声音长度,数字播放器,生物遗传学,基因组范围,读xl，方法
系统要求	BLAT，用于BLAT的2bit格式的UCSC hg18
统一资源定位地址

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	hi读取处理器_1.40.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）	hi读数处理器_1.40.0.tgz
macOS二进制（arm64）	hiReadsProcessor_1.40.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hiReadsProcessor网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：软件包/hiReadsProcessor
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/hiReadsProcessor网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/hiReadsProcessor网站/
软件包下载报告	下载统计信息