全球伽马波依

拟合Gamma-Poisson广义线性模型


生物导体版本:释放(3.19)

将线性模型拟合到过度分散的计数数据。该软件包可以估计过度分散,并拟合矩阵输入的重复模型。它设计用于处理大型输入数据集,因为它们通常出现在单细胞RNA-seq实验中。

作者:Constantin Ahlmann-Eltze[aut,cre](君士坦丁·阿赫曼-埃尔茨),内森·卢博克,迈克尔·洛夫

维护人员:Constantin Ahlmann-Eltze<artjom31415,网址:googlemail.com>

引文(从R中输入引文(“glmGamPoi”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“glmGamPoi”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“glmGamPoi”)
glmGamPoi快速启动 HTML格式 R脚本
伪体和微分表达式 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 RNA序列,回归,单个单元格,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 生物柴油3.11(R-4.0)(4.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于
进口 卢比,延迟矩阵统计,矩阵统计,矩阵泛型,DelayedArray(延迟阵列),HDF5阵列,总结性实验,单细胞实验,生物遗传学,方法,统计,实用程序,样条曲线,爱尔兰航空公司,压控变压器
系统要求 C++11语言
统一资源定位地址 https://github.com/const-ae/glmGamPoi
错误报告 https://github.com/const-ae/glmGamPoi/issues网站
查看更多
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链接到 卢比,RcppArmadillo公司,海滩上的人
增强功能
取决于我
导入我 巴西斯坦,狐猴,转化GamPoi,SCdecor公司
建议我 设计2,DEX当量
指向我的链接
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 glmGamPoi_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 glmGamPoi_1.16.0.zip格式
macOS二进制(x86_64) glmGamPoi_1.16.0.tgz像素
macOS二进制(arm64) glmGamPoi_1.16.0.tgz像素
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/glmGamPoi
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/glmGamPoi
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/glmGamPoi/
包短Url https://bioconductor.org/packages/glmGamPoi/
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