全球伽马波依
拟合Gamma-Poisson广义线性模型
生物导体版本:释放(3.19)
将线性模型拟合到过度分散的计数数据。该软件包可以估计过度分散,并拟合矩阵输入的重复模型。它设计用于处理大型输入数据集,因为它们通常出现在单细胞RNA-seq实验中。
作者:Constantin Ahlmann-Eltze[aut,cre](君士坦丁·阿赫曼-埃尔茨),内森·卢博克,迈克尔·洛夫
维护人员:Constantin Ahlmann-Eltze<artjom31415,网址:googlemail.com>
引文(从R中输入引文(“glmGamPoi”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“glmGamPoi”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“glmGamPoi”)
细节
生物视图 |
RNA序列,回归,单个单元格,软件 |
版本 |
1.16.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.11(R-4.0)(4.5年) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
|
进口 |
卢比,延迟矩阵统计,矩阵统计,矩阵泛型,DelayedArray(延迟阵列),HDF5阵列,总结性实验,单细胞实验,生物遗传学,方法,统计,实用程序,样条曲线,爱尔兰航空公司,压控变压器 |
系统要求 |
C++11语言 |
统一资源定位地址 |
https://github.com/const-ae/glmGamPoi |
错误报告 |
https://github.com/const-ae/glmGamPoi/issues网站 |
查看更多
建议 |
测试那个(>= 2.1.0),动物园,设计2,边缘R,利马,海滩上的人,MASS(质量),随机反演,ggplot2,长凳,BiocParallel公司,针织物,市场营销,仿生风格,TENxPBMC数据,muscData公司,尖叫声,矩阵,数字播放器 |
链接到 |
卢比,RcppArmadillo公司,海滩上的人 |
增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
巴西斯坦,狐猴,转化GamPoi,SCdecor公司 |
建议我 |
设计2,DEX当量 |
指向我的链接 |
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生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。