ercc仪表盘

用ERCC对照评估差异基因表达实验


生物导体版本:释放(3.19)

使用外部RNA控制联盟(ERCC)刺突比例混合物进行差异基因表达实验的技术性能指标。

作者:莎拉·蒙罗、史蒂夫·隆德

维护人员:莎拉·蒙罗(Sarah Munro)

引文(从R中输入引文(“erccdashboard”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“erccdashboard”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

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细节

生物视图 交替拼接,BatchEffect(批次效果),差异表达式,差分拼接,基因表达式,遗传学,免疫肿瘤学,微阵列,多重比较,质量控制,RNA序列,软件,转录,mRNA微阵列
版本 1.38.0
在生物导体中 生物技术3.0(R-3.1)(10年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.2),ggplot2(>= 2.1.0),额外网格(>= 2.0.0)
进口 边缘R,gplots(gplots),网格,gtools(工具),利马,位置匹配,MASS(质量),普利尔,q值,重塑2,收益率,规模,字符串
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/munrosa/ercdashboard网站 http://tinyurl.com/erccsrm
错误报告 https://github.com/munrosa/ercdashboard/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 erccd仪表盘_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 erccd仪表盘_1.38.0.zip
macOS二进制(x86_64) ercc仪表盘_1.38.0.tgz
macOS二进制(arm64) ercc仪表盘_1.38.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/erccdashboard网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ercc仪表盘
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ercdashboard网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/erccdashboard网站/
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