ercc仪表盘
用ERCC对照评估差异基因表达实验
生物导体版本:释放(3.19)
使用外部RNA控制联盟(ERCC)刺突比例混合物进行差异基因表达实验的技术性能指标。
作者:莎拉·蒙罗、史蒂夫·隆德
维护人员:莎拉·蒙罗(Sarah Munro)
引文(从R中输入引文(“erccdashboard”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“erccdashboard”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“erccdashboard”)
细节
生物视图 |
交替拼接,BatchEffect(批次效果),差异表达式,差分拼接,基因表达式,遗传学,免疫肿瘤学,微阵列,多重比较,质量控制,RNA序列,软件,转录,mRNA微阵列 |
版本 |
1.38.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.0(R-3.1)(10年) |
许可证 |
GPL(>=2) |
取决于 |
R(>=3.2),ggplot2(>= 2.1.0),额外网格(>= 2.0.0) |
进口 |
边缘R,gplots(gplots),网格,gtools(工具),利马,位置匹配,MASS(质量),普利尔,q值,重塑2,收益率,规模,字符串 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
https://github.com/munrosa/ercdashboard网站 http://tinyurl.com/erccsrm |
错误报告 |
https://github.com/munrosa/ercdashboard/issues |
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程序包档案
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