countsimQC(计数质量控制)
计数数据集的特征比较
生物导体版本:释放(3.19)
countsimQC提供了创建综合报告的功能,该报告比较了计数矩阵集合中的广泛特征。一个重要的用例是将一个或多个合成计数矩阵与实际计数矩阵(可能是模拟的基础)进行比较。然而,任何计数矩阵的集合都可以进行比较。
作者:夏洛特·索尼森
维护人员:夏洛特·索尼森
引文(从R中输入引文(“countsimQC”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“countsimQC”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“countsimQC”)
细节
生物视图 |
实验设计,免疫肿瘤学,微生物组,质量控制,RNA序列,报告写作,单个单元格,软件,可视化 |
版本 |
1.22.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.8(R-3.5)(6年) |
许可证 |
GPL(>=2) |
取决于 |
R(>=3.5) |
进口 |
rmarkdown公司(>= 2.5),边缘R,设计2(>= 1.16.0),数字播放器,第三年,ggplot2、gr设备、工具、,总结性实验,基因过滤器,DT公司,基因组信息数据库数据,ca工具,随机测试,stats,utils,方法,拉格 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/csoneson/countsimQC |
错误报告 |
https://github.com/csoneson/countsimQC/issues网站 |
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。