countsimQC(计数质量控制)

计数数据集的特征比较


生物导体版本:释放(3.19)

countsimQC提供了创建综合报告的功能,该报告比较了计数矩阵集合中的广泛特征。一个重要的用例是将一个或多个合成计数矩阵与实际计数矩阵(可能是模拟的基础)进行比较。然而,任何计数矩阵的集合都可以进行比较。

作者:夏洛特·索尼森

维护人员:夏洛特·索尼森

引文(从R中输入引文(“countsimQC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“countsimQC”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“countsimQC”)
countsimQC用户指南 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 实验设计,免疫肿瘤学,微生物组,质量控制,RNA序列,报告写作,单个单元格,软件,可视化
版本 1.22.0
在生物导体中 生物技术3.8(R-3.5)(6年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=3.5)
进口 rmarkdown公司(>= 2.5),边缘R,设计2(>= 1.16.0),数字播放器,第三年,ggplot2、gr设备、工具、,总结性实验,基因过滤器,DT公司,基因组信息数据库数据,ca工具,随机测试,stats,utils,方法,拉格
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/csoneson/countsimQC
错误报告 https://github.com/csoneson/countsimQC/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 countsimQC_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 countsimQC_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64) countsimQC_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64) countsimQC_1.22.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/countsimQC
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/countsimQC
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/countsimQC/
包短Url https://bioconductor.org/packages/countsimQC/
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