协和式R

计算协和系数

生物导体版本：释放（3.19）

许多分析工作流程包括近似最近邻图，然后对图结构进行聚类。协方差系数估计图和聚类结果之间的一致性。包“concordexR”是基于concordex Python的原始命令行工具的R实现。

作者：凯拉·杰克逊，A.Sina Booeshaghi[aut]，Angel Galvez-Merchan[aut]，Lambda Moses[aut]，劳拉·卢伯特，Lior Pachter[aut，rev，ths]

维护人员：凯拉·杰克逊（Kayla Jackson）

引文（从R中输入引文（“concordexR”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“concordexR”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“concordexR”）

生物视图	群集,图形和网络,单个单元格,软件
版本	1.4.0
在生物导体中	生物柴油3.17（R-4.3）（1年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.2）
进口	生物并行,克莱,延迟阵列,ggplot2,矩阵、方法、，苯丙胺,爱尔兰航空公司,规模
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/pachterlab/concordexR https://pachterlab.github.io/concordexR/
错误报告	https://github.com/pachterlab/concordexR/issues

建议	生物邻居,生物风格,咆哮,覆盖（covr）,针织物,拼凑,rmarkdown公司,散射,TENxPBMC数据,测试那个(>= 3.0.0),vdiffr公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	协和式飞机R_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	协和式飞机R_1.4.0.zip
macOS二进制（x86_64）	协和R_1.4.0.tgz
macOS二进制（arm64）	协和R_1.4.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/concordexR网址
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/concordexR
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/concordexR/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/concordexR/
软件包下载报告	下载统计信息