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cmapR公司

R中的CMap工具


生物导体版本:释放(3.19)

连接图(CMap)是Broad Institute研究人员建立的扰动基因表达谱的海量资源,由NIH综合网络基细胞特征库(LINCS)计划资助。请访问https://clue.io(俱乐部)了解更多信息。cmapR包实现了解析、操作和编写通用CMap数据对象的方法,例如带注释的矩阵和基因集集合。

作者:特德·纳托利[aut,cre]

维护人员:泰德·纳托利(Ted Natoli)<Ted.e.Natoli at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“cmapR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“cmapR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“cmapR”)
cmapR教程 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据导入,数据表示,基因表达式,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 生物柴油3.11(R-4.0)(4年)
许可证 文件许可证
取决于 R(>=4.0)
进口 方法,rhdf5基因,数据表,flowCore(流动堆芯),总结性实验,矩阵统计
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/cmap/cmapR
错误报告 https://github.com/cmap/cmapR/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 cmapR_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 cmapR_1.16.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) cmapR_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64) 最大功率R_1.16.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cmapR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/cmapR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/cmapR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/cmapR/
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