篮球运动员
候选基因挖掘者
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包旨在整合GWAS衍生的SNP和共表达网络，以挖掘与特定表型相关的候选基因。为此，用户必须定义一组引导基因，这些基因是与研究表型相关的已知基因。此外，可以对挖掘出的候选项进行评分，以支持作为中心和/或转录因子的候选项。然后，这些分数可以用于排序和选择最有希望的前n个基因用于下游实验。
作者：法比西奥·阿尔梅达·席尔瓦[aut，cre]
，蒂亚戈·维南西奥[aut]
维护人员：法比西奥·阿尔梅达·席尔瓦（Fabrício Almeida-Silva）
引文（从R中输入引文（“cageminer”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“cageminer”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“cageminer”）
细节
| 生物视图 |
功能基因组学,功能预测,基因表达式,基因组广泛关联,网络,网络丰富,SNP公司,软件,变量注释 |
| 版本 |
1.10.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.14（R-4.1）（2.5年） |
| 许可证 |
GPL-3型 |
| 取决于 |
R（>=4.1） |
| 进口 |
ggplot2,爱尔兰航空公司,ggbio公司,ggtext（gg文本）,基因组信息Db,基因组范围,I范围,重塑2、方法、，BioNERO公司 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/almeidasilvaf/cageminer网站 |
| 错误报告 |
https://support.bioconductor.org/t/cageminer（https://support.bioconductor.org/t/cageminer） |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
